Envoyer un échantillon/une souche

La fiche doit être complétée pour tout envoi au CNRMA. Toute fiche incomplète entraînera la mise en attente du dossier jusqu’à l’obtention des renseignements manquants ou l’archivage définitif en l’absence de réponse dans un délai d’un mois. Les demandes particulières (recherche de champignon dans un prélèvement biologique, typage moléculaire, ...) et les demandes d’expertise en urgence doivent faire l’objet d’un accord préalable de l’un des responsables du CNR (mail à ou contact téléphonique)

Selon les espèces, le résultat définitif de caractérisation de la souche peut prendre plusieurs semaines, voire plusieurs mois. Cependant pour les isolats faisant l’objet d’une technique accréditée COFRAC et pour les isolats envoyés dans le cadre d’une demande d’expertise ou pour une analyse en urgence, après validation par le CNRMA-IFI, un rapport intermédiaire et/ou final sera systématiquement envoyé dans un délai de 10 jours ouvrés à réception de la souche.

Pour les isolats envoyés dans le cadre de la surveillance SINFONI, seuls les résultats définitifs seront envoyés sous forme de compte-rendu papier par voie postale à l’expéditeur. Les données de CMI effectuées au CNRMA-IFI seront mises en ligne sur le serveur RedCap dès leur validation. 

CONDITIONS PRÉ-ANALYTIQUES

Le mélange de plusieurs espèces et les repiquages sur tube de transport retardant les analyses, il est recommandé de n’envoyer au CNRMA que des souches « pures » dont une identification, au moins partielle, a été obtenue et sous forme d’un repiquage récent sur gélose de Sabouraud par exemple (pas de tube de transport).

Si l’échantillon transmis ne respecte pas les conditions pré-analytiques citées ci-dessous, le CNR se réserve le droit de refuser la prestation et/ou demander un nouveau prélèvement.

Envoi d'une souche

Les souches doivent être envoyées pures sur milieu de culture en tubes (en respectant la législation) et toujours accompagnées de la fiche de demande.

Un repiquage récent (et non une gélose de stockage) est souhaitable pour éviter les retards d’analyse liés aux délais de croissance à partir d’un tube de conservation.

Envoi d'un échantillon biologique

Les envois d'échantillons (tissu, liquide biologique, bloc, lames) nécessitent l'accord préalable de l'un des responsables.

Le diagnostic moléculaire des mycoses invasives peut être réalisé, après accord des responsables du CNRMA (contact téléphonique ou mail à cnrma@pasteur.fr), sur le site Saint-Louis. Les demandes et les échantillons doivent être adressés directement à l’Hôpital Saint Louis en prévenant par mail / téléphone de l'envoi, qui sera accompagné d'une fiche d'analyse antigéniques et moléculaires.

Pr. Alexandre Alanio
Laboratoire de Parasitologie-Mycologie
Plot B, 1er étage - Hôpital Saint-Louis
1 avenue Claude Vellefaux
75475 Paris Cedex 10 - tél 01 42 49 95 02

alexandre.alanio@aphp.fr, cnrma@pasteur.fr

Tableau récapitulatif d'envoi des souches et des échantillons biologiques : 

Législation

Tout transport de matériels biologiques potentiellement infectieux demeure sous l’entière responsabilité de l’expéditeur. Les modalités de transport des matières infectieuses sont fixées par l’arrêté français du 5 août 2009 modifiant l'arrêté du 29 mai 2009 relatif au transport des marchandises dangereuses par voies terrestres (dit « arrêté TMD »). Il est recommandé de suivre le Guide sur la sécurité du transport des matières infectieuses et des échantillons de diagnostic publié par l'OMS.

PRESTATION DE CONSEIL, SUGGESTION ET RÉCLAMATION

Contacter le CNR des Mycoses invasives et antifongiques cnrma@pasteur.fr ou le service de Coordination des centres de référence ccr@pasteur.fr.

MODALITÉS DE CONSERVATION ET RESTITUTION DES ÉCHANTILLONS BIOLOGIQUES TRAITÉS

Le CNR conserve toutes les souches envoyées dans le cadre de ses missions d'expertise et de surveillance. Les souches sont conservées selon la technique appropriée à l'espèce. Les correspondants peuvent demander un repiquage de la souche s'ils le souhaitent.

CONFIDENTIALITÉ ET PROTECTION DES INFORMATIONS

 Les fichiers informatisés du CNR sont déclarés à la Commission Informatique et Libertés (CNIL) : Loi n°78-17 du 06 janvier 1978.

CONDITIONS FINANCIÈRES

Les activités de service effectuées au CNRMA sont faites gratuitement à condition :

• Que les demandes soient accompagnées par la fiche de renseignements complétée
• Qu’elles concernent des patients (et non l'environnement ou une contamination industrielle)
• Qu’une pré-identification ait été entreprise

Les identifications de souches isolées de l’environnement sont considérées comme des expertises hors mission du CNRMA lorsqu'elles sont effectuées hors du cadre de l'investigation de cas groupés, et sont donc facturées.

​Voir aussi :
Organisation des Centres Nationaux de Référence,
Système du Management de la Qualité des Laboratoires de Référence et d’Expertise

Mis à jour le 27/02/2025