Cours

Analyse des génomes

Mécanismes du vivant
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Ce cours théorique et pratique d’une durée de sept semaines fait le tour des concepts, techniques et outils nécessaires à l'étude des génomes, des étapes expérimentales à l’analyse des résultats. Il illustre les différents aspects de la génomique et de ses applications en se basant sur les résultats les plus récents de la recherche.

Informations pratiques

Institut Pasteur
5 novembre-21 décembre 2018
15 juin 2018
En Français

Diplômes

Unité d'enseignement de Master 2 Paris Descartes
Unité d'enseignement de Master 2 Sorbonne Université
Unité d'enseignement de Master 2 Paris Diderot
Unité d'enseignement de Master 2 Paris Sud
Module d'école doctorale
Diplôme de l'Institut Pasteur
Diplôme d'Université Paris Diderot

Le cours Analyse des génomes présente les deux aspects complémentaires de l’étude des génomes : une démarche expérimentale « à la paillasse » et le traitement des résultats au moyen d’outils bio-informatiques.

Les conférences, données par des chercheurs spécialistes, présentent les nouvelles technologies utilisées en génomique et les connaissances acquises dans les domaines aussi variés que la structure et l’expression des génomes, l’évolution, l’épigénomique, les réseaux de régulation d’expression des gènes, l'étude d'organismes modèles ou pathogènes, la méta-génomique et l’analyse des populations naturelles ou artificielles.

Des travaux pratiques de génomique et de bio-informatique permettent de mettre en pratique les différents concepts abordés pendant ces conférences. La partie expérimentale s’articule autour de deux thématiques principales. D’une part, l’analyse métagénomique des communautés microbiennes à l’aide des technologies HiC. D’autre part, l’étude des petits ARN non codants (piRNA) et des régulations des éléments transposables chez la drosophile Drosophila melanogaster.

Les candidats doivent avoir de bonnes connaissances en génétique, biologie moléculaire et biochimie du niveau de la fin de première année de Master. Aucun prérequis n’est demandé dans le domaine informatique. Les méthodes de bio-informatique nécessaires à l’analyse des données seront enseignées pendant le cours. Les étudiants disposeront d’un accès direct aux ordinateurs pour mettre en applications cet enseignement. Les candidatures sont évaluées par le Comité du cours.

Flyer du cours : Analyse des génomes 2018

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Plus d'informations

Directeurs

Didier Mazel

Unité Plasticité du Génome Bactérien

Institut Pasteur

 

Stéphane Le Crom

Institut de Biologie Paris-Seine

UPMC - Sorbonne Université

Chef de travaux

Lionel Frangeul

Unité Virus et interférence ARN

Institut Pasteur

Participants
20
Durée
7 semaines
Membres du comité de cours

M. Badoual* (Université Paris-Saclay),

S. Bloyer* (Université Paris-Saclay),

L. Frangeul (Institut Pasteur),

J. Heuvingh (ESPCI),

S. Le Crom* (Sorbonne Université),

S. Malot (Institut Pasteur),

D. Mazel (Institut Pasteur),

V. Ponticelli (Institut Pasteur),

M. Sala (Institut Pasteur),

R.A. Veitia* (Université Paris-Diderot),

H. Waxin (Institut Pasteur).

* Représentants des Universités

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