Envoyer un échantillon/une souche au CNR des virus des infections respiratoires (dont la grippe et le SARS-CoV-2)

Le CNR prend en charge l’analyse de prélèvements nasopharyngés et salivaires réalisés dans le cadre de la surveillance réalisée en population générale par le réseau Sentinelles.

Le CNR prend également en charge des prélèvements respiratoires (nasopharyngé, expectoration, liquide bronchoalvéolaire LBA, aspiration trachéale …) sélectionnés par les laboratoires hospitaliers du réseau RENAL ou d’autres types de prélèvements (liquide céphalorachidien LCR, biopsie pulmonaire, biopsie cardiaque, sang …). Cette sélection concerne prioritairement :

   - les prélèvements détectés positifs pour la grippe (ou souches de virus influenza) en dehors de la période épidémique,
   - les prélèvements de cas sévères ou de cas particuliers comme les suspicions de réduction de la sensibilité aux antiviraux ou d’échec vaccinal,
   - l’investigation d’épidémies d’IRA dans les EHPAD.
   - Le CNR réalise également des analyses virologiques ou sérologiques d’autres provenances après évaluation de la finalité et accord des responsables du CNR.

Le CNR coordonnateur, situé aux Hospices Civils de Lyon, prend en charge les échantillons issus de la surveillance en population générale et en milieu hospitalier, provenant de la moitié sud de la France. Alors que le laboratoire associé, situé à l'Institut Pasteur à Paris, analyse les échantillons de la moitié nord de la France. Les laboratoires associés, l’Institut Pasteur de Guyane et le CHU Félix Guyon de l'île de la Réunion, se chargent respectivement de la surveillance dans les Territoires Français d’Amérique (TFA) et dans l'Océan Indien.

RECOMMANDATIONS POUR LE PRÉLÈVEMENT PAR ÉCOUVILLONNAGE ET CONDITIONS PRE-ANALYTIQUES

(mise à jour: mars 2026)

Les prélèvements sont réalisés par écouvillonnage nasal ou pharyngé profond à l’aide du matériel adapté.

Une fois le prélèvement réalisé, il est adressé par voie postale accompagné de la fiche clinique au laboratoire correspondant dans le respect du triple emballage, agent infectieux de catégorie B, classification UN 3373.

Le médecin ou le patient seront chargés de poster le prélèvement si possible le jour du prélèvement, ou le plus rapidement possible.

CONDITIONS D’ACHEMINEMENT DES PRÉLÈVEMENTS ET ÉCHANTILLONS

Tous les prélèvements ou souches à analyser sont à adresser au CNR virus des infections respiratoires à l’adresse suivante :

Centre National de Référence virus des infections respiratoires (dont la grippe et le SARS-CoV-2)

Institut Pasteur 25-28 rue du Docteur Roux 75724 Paris Cedex 15 France

Secrétariat du CNR : +33(0)1 45 68 87 25

Télécopie du CNR : +33(0)1 40 61 32 41

Email: grippe@pasteur.fr

Etiquette à compléter et à coller sur l'emballage extérieur (PDF - 20 Ko)

Législation : Tout transport de matériels biologiques potentiellement infectieux demeure sous l’entière responsabilité de l’expéditeur. Les modalités de transport des matières infectieuses sont fixées par l’arrêté français du 5 août 2009 modifiant l'arrêté du 29 mai 2009 relatif au transport des marchandises dangereuses par voies terrestres (dit « arrêté TMD »). Il est recommandé de suivre le Guide sur la sécurité du transport des matières infectieuses et des échantillons de diagnostic publié par l'OMS.

Envoi d’un échantillon biologique

Conditions d’envoi des échantillons biologiques au CNR des virus des infections respiratoires

Les échantillons adressés au CNR des virus des infections respiratoires doivent être conditionnés et transportés de manière à garantir leur intégrité et la qualité des analyses réalisées.

Les prélèvements doivent être conservés et expédiés dans des conditions de température adaptées à leur mode de conservation initial. En particulier, tout échantillon conservé à l’état congelé doit impérativement être maintenu congelé pendant toute la durée du transport, afin d’éviter toute décongélation susceptible d’altérer le matériel biologique et de compromettre les analyses virologiques. Les échantillons congelés doivent ainsi être expédiés sur glace carbonique ou dans un dispositif permettant de maintenir une température négative jusqu’à leur réception au CNR.

Les échantillons conservés à +4 °C doivent être transportés réfrigérés, par exemple à l’aide de pains de glace ou d’un dispositif équivalent, afin de maintenir la chaîne du froid pendant l’acheminement. Les échantillons conservés à température ambiante doivent également être expédiés dans des conditions permettant de préserver cette température, en évitant notamment toute exposition à des températures extrêmes.

De manière générale, les échantillons doivent être emballés conformément à la réglementation en vigueur pour le transport de matières biologiques (triple emballage) et accompagnés de leur fiche de renseignements dûment complétée.

Le respect strict de ces conditions est indispensable afin d’assurer la fiabilité des résultats obtenus et la bonne prise en charge des échantillons par le laboratoire.

Informations sur le triple-emballage des prélèvements

1er emballage

Prélèvement respiratoire en milieu de transport, exemple Virocult ELITECH, UTM COPAN

2ème emballage

Emballages de transport suivant :

Diagnobag (DACKLAPACK) avec tissu absorbant 1 tube (capacité absorbant 50 ml).

3ème emballage

Enveloppe postale à bulle étiquetée «UN 3373  BIOLOGICAL SUBSTANCE CATEGORY B »,

Traçabilité de l’expéditeur 

Fiche clinique jointe au prélèvement avec identification du médecin préleveur. Cette fiche est placée dans le 3e emballage, hors du Diagnobag.

PRESTATION DE CONSEIL, SUGGESTION ET RÉCLAMATION

Contacter le CNR virus des infections respiratoires (dont la grippe et le SARS-Cov-2)

Ou le service de Coordination des Centres de référence 

CONFIDENTIALITÉ ET PROTECTION DES INFORMATIONS

Les fichiers informatisés du CNR sont déclarés à la Commission Informatique et Libertés (CNIL) : Loi n°78-17 du 06 janvier 1978.

​Voir aussi :
Organisation des Centres Nationaux de Référence,
Système du Management de la Qualité des Laboratoires de Référence et d’Expertise

CONDITIONS FINANCIÈRES

Les analyses relevant des activités de surveillance et d’expertise du CNR et sous réserve que la fiche d’information soit remplie sont réalisées à titre gracieux

​Voir aussi :
Organisation des Centres Nationaux de Référence,
Système du Management de la Qualité des Laboratoires de Référence et d’Expertise

Mis à jour le 12/03/2026