Une étude de l'Institut Pasteur souligne la diversité génétique de Salmonella enterica sérotype Panama, une bactérie responsable d’infections alimentaires fréquentes aux Antilles et en Guyane. Et révèle l'évolution inquiétante de cette bactérie, autrefois sensible aux traitements. Ces résultats soulignent l’importance d’une surveillance accrue pour prévenir les risques sanitaires. Début 2026, la Fondation Le Roch-Les Mousquetaires vient de renouveler son soutien à l’équipe de François-Xavier Weill pour suivre l’évolution des résistances bactériennes aux antibiotiques.
Salmonella enterica sérotype Panama, l’un des agents les plus courants de salmonellose dans les territoires ultramarins français, cache une diversité insoupçonnée. Une étude phylogénétique inédite, menée par les professeur.es François-Xavier Weill (Institut Pasteur) et Kate Baker (Université de Cambridge) et publiée en 2025 dans The Lancet Microbe, a analysé plus de 800 génomes collectés dans 45 pays depuis 1931. C’est la première fois qu’une analyse aussi large est réalisée sur cette bactérie, responsable d’épidémies hospitalières en France métropolitaine dans les années 1970 (plus de 1 000 cas certaines années).
Des lignées aux profils contrastés
Les scientifiques ont identifié deux lignées particulièrement résistantes aux antibiotiques et plus invasives, principalement présentes en Europe et en Asie. À l’inverse, les souches américaines, dont celles des Antilles, restent sensibles aux traitements. Ces différences pourraient s’expliquer par des réservoirs distincts :
- En Europe, la lignée résistante serait liée au développement de l’industrie porcine après la Seconde Guerre mondiale.
- En Asie, certaines souches résistantes pourraient provenir de chaînes d'approvisionnement alimentaire complexes.
- En Amérique, les souches sont restées sensibles aux antibiotiques du fait d’un réservoir environnemental (peut-être des reptiles). Ces souches auraient pu être introduites aux Antilles à la faveur des mouvements de populations engendrés par la construction du canal de Panama.
Un risque sanitaire à surveiller
« Ces résultats montrent que Salmonella enterica sérotype Panama n’est pas un agent uniforme, mais un ensemble de lignées aux comportements variés », explique François-Xavier Weill. La présence de souches multirésistantes aux antibiotiques et invasives en Europe et en Asie justifie une vigilance accrue, notamment dans les filières alimentaires.
Un projet soutenu par la Fondation Le Roch-Les MousquetairesCette recherche s’inscrit dans un projet plus large, financé depuis plusieurs années par la Fondation Le Roch-Les Mousquetaires, visant à comprendre l’évolution des résistances bactériennes. « Leur soutien est essentiel pour décrypter ces mécanismes et proposer des stratégies de prévention adaptées », souligne le François-Xavier Weill. Début 2026, ce soutien vient d’être renouvelé jusqu’en 2028. |
Source : Global diversity and evolution of Salmonella enterica serovar Panama: a genomic epidemiology study, The Lancet Microbe, septembre 2025
Caisey V Pulford1, Blanca M Perez-Sepulveda1, Danielle J Ingle2, Rebecca J Bengtsson1, Rebecca J Bennett1, Ella V Rodwell3, Maria Pardos de la Gandara4, Charlotte E Chong5, P Malaka De Silva5, Magali Ravel4, Véronique Guibert4, Elisabeth Njamkepo4, Neil Hall6, Marie A Chattaway3, Benjamin P Howden7, Deborah A Williamson8, Jay C D Hinton1, François-Xavier Weill9, Kate S Baker10
1Clinical Infection, Microbiology, and Immunology, Institute of Infection, Veterinary and Ecological Sciences, University of Liverpool, Liverpool, UK.
2Department of Microbiology and Immunology, The University of Melbourne at The Peter Doherty Institute for Infection and Immunity, Melbourne, VIC, Australia.
3Gastrointestinal Bacteria Reference Unit, UK Health Security Agency, London, UK.
4Unité des Bactéries pathogènes entériques, Institut Pasteur, Université Paris Cité, Paris, France.
5Department of Genetics, University of Cambridge, Cambridge, UK.
6Earlham Institute, Norwich Research Park, Norwich, UK.
7Microbiological Diagnostic Unit Public Health Laboratory, Department of Microbiology and Immunology, The University of Melbourne at The Peter Doherty Institute for Infection and Immunity, Melbourne, VIC, Australia; Centre for Pathogen Genomics, The University of Melbourne, Melbourne, Australia.
8School of Medicine, University of St Andrews, Fife, Scotland.
9Unité des Bactéries pathogènes entériques, Institut Pasteur, Université Paris Cité, Paris, France.
10Clinical Infection, Microbiology, and Immunology, Institute of Infection, Veterinary and Ecological Sciences, University of Liverpool, Liverpool, UK; Department of Genetics, University of Cambridge, Cambridge, UK.
