Au niveau mondial, 45% des décès d’enfants de moins de 5 ans surviennent pendant les 4 premières semaines de vie, 20% des décès des nouveau-nés sont causés par des infections, notamment bactériennes. Réduire cette mortalité fait partie des Objectifs du Développement Durable fixés par les Nations Unies. Cette menace est particulièrement sévère dans les pays à faible revenu, qui rassemblent des facteurs spécifiques contribuant à l’émergence et à la propagation de l’antibiorésistance (surconsommation, mésusage, vente libre, et contrefaçons d’antibiotiques, ainsi que promiscuité et conditions de vie précaires). En réponse, l'Institut Pasteur a lancé en 2012 le programme BIRDY, visant à comprendre et répondre aux infections bactériennes et à la résistance aux antibiotiques chez les enfants de ces régions vulnérables.
Comprendre l'Antibiorésistance dans le Contexte de la Santé Néonatale
Mis en place dès 2012 à Madagascar, puis étendu au Sénégal et au Cambodge en 2014, la première phase du projet BIRDY (Bacterial Infections and antibiotic Resistant Diseases among Young children in low-Income countries), a étudié les causes des infections bactériennes chez les enfants, évalué leurs conséquences et caractérisé leur résistance aux antibiotiques. Cette étude, inédite par son ampleur et son approche, s'est déroulée en milieu communautaire urbain et rural, suivant environ 3000 enfants sur les 3 pays dès leur naissance pendant leurs premiers mois de vie. Un suivi régulier à domicile avec un réseau de pédiatres et d'agents communautaires ont permis une prise en charge rapide des infections suspectées. Les analyses des prélèvements biologiques ont aidé à identifier les bactéries responsables d’infection et déterminer leur sensibilité aux antibiotiques, garantissant une antibiothérapie adaptée et optimale. De plus, le réseau des partenaires locaux comprenant les, structures de santé, les soignants et les aidants, a été sensibilisé aux bonnes pratiques en cas de signes d’accouchement prématuré, de signes précoces d’infections ainsi qu’aux pratiques à risque dans la transmission des infections au sein du foyer.
Au Cambodge, cette étude a révélé une mortalité néonatale et infantile au sein de la cohorte inférieure aux taux attendus au Cambodge selon les chiffres les plus récemment publiés. L’amélioration du système de santé, les efforts autour de la santé materno-foetale et l’amélioration progressive des conditions de vie au Cambodge expliquent en partie l’amélioration de ces indicateurs. Il est probable que ces taux de mortalité bas soient favorisés par la prise en charge du programme BIRDY, permettant l’accès rapide et gratuit aux structures de soins dès l’inclusion et en particulier dès la naissance pour des symptômes d’allure infectieuse.
Les résultats à Madagascar ( 2011-2017) ont révélé de nombreuses infections chez les nouveau-nés, dans 85% des cas durant la première semaine de vie. Dans 70% des cas, ces infections ne répondaient pas à un des deux antibiotiques de 1ere ligne recommandés par l’OMS (Organisation Mondiale de la Santé). Des investigations supplémentaires étaient nécessaires.
BIRDY 2 à Madagascar : Vers une Compréhension Plus Approfondie des Infections Bactériennes Résistantes
Les résultats de la première phase du projet BIRDY a montré que l’incidence des infections néonatales est élevée dans ces trois pays, entre 10 à 18 pour 1000 naissances vivantes. A titre de comparaison, elle est de moins de 1 pour 1000 naissances vivantes aux Etats-Unis. A Madagascar, il a également été estimé durant l’étude, que 16 à 38 % des naissances étaient prématurées. Cependant, en l'absence d'échographies, technique de référence non couramment accessible à Madagascar, l'ampleur réelle de ce problème, ainsi que les facteurs de risque et les conséquences sur le développement de l'enfant, restent largement inconnus. Des investigations devraient être poursuivies et élargies pour mieux comprendre le rôle de la mère et de l'environnement dans la transmission des infections résistantes.
Dans ce contexte, le projet BIRDY 2, lancé en 2018 à Madagascar, a suivi 600 couples mères-enfants depuis la grossesse des femmes jusqu'aux douze premiers mois de vie des enfants. L'objectif était d'approfondir les investigations précédentes et de fournir des données plus précises. Les nouveau-nés ont été suivis de manière active à travers des visites régulières et rapprochées jusqu’à l’âge de 3 mois. Lors de chaque visite, les signes suggestifs d’infection étaient recherchés ; en cas de suspicion d’infection, le nouveau-né était examiné par un médecin qui posait un diagnostic basé sur les signes cliniques. A la suite de cela, des prélèvements à visée bactériologique étaient effectués. Des visites de suivi ponctuelles étaient également effectuées aux âges de 6, 9 et 12 mois de l’enfant.
Au Cambodge, visite de suivi d'un bébé inclus dans la cohorte Birdy. Crédit: Institut Pasteur du Cambodge/ Veasna Hak
Parallèlement, une étude transversale suivant l’approche « Une Seule Santé » a été adoptée pour comprendre le rôle de l’environnement et de l’entourage dans la transmission de la résistance aux antibiotiques. Dans 126 foyers dont 62 en milieu rural et 64 en milieu urbain, des prélèvements environnementaux dans les points d’eau, les aliments d’origine animale, etc. ont été réalisés, ainsi que sur les personnes et les animaux vivants dans le foyer. Les analyses des prélèvements environnementaux, en cours, fourniront des données précieuses pour comprendre de façon globale la transmission des bactéries multirésistantes et adapter les stratégies de prévention et de traitement. Cette étude a également collaboré avec des anthropologues pour comprendre les coutumes et croyances des populations, qui pourraient favoriser l’acquisition de ces bactéries multirésistantes.
Recommandations Dépassées : Défis de la Résistance Bactérienne dans le Sepsis Néonatal
Dans le cadre des analyses réalisées chez les nouveau-nés de 0 à 3 mois, il y a eu 53 cas d'infections bactériennes graves possibles et notamment 6 cas confirmés de septicémie. La septicémie est une affection potentiellement mortelle qui survient lorsque le système immunitaire réagit par une réponse inflammatoire généralisée extrême à une infection, entraînant une dysfonction d’organe. Les tests effectués par l'Institut Pasteur de Madagascar ont montré que toutes les bactéries responsables de ces infections étaient résistantes aux deux antibiotiques, l'ampicilline et la gentamicine, recommandés par l'Organisation Mondiale de la Santé (OMS). Cette résistance est particulièrement préoccupante car le sepsis néonatal est une urgence médicale qui, sans diagnostic rapide et traitement efficace, peut entraîner des complications graves ou la mort.
Les résultats du projet BIRDY 2 révèlent un défi majeur dans le traitement de cette infection potentiellement mortelle, mettant en évidence l'urgence de trouver de nouvelles solutions thérapeutiques. Ces découvertes soulignent également l'importance de continuer la recherche pour développer des traitements innovants capables de surmonter cette résistance bactérienne croissante.
Publications du projet BIRDY (phases 1 et 2) :
1. Klebsiella pneumoniae carriage in low-income countries: antimicrobial resistance, genomic diversity and risk factors.
Huynh BT, Passet V, Rakotondrasoa A, Diallo T, Kerleguer A, Hennart M, Lauzanne A, Herindrainy P, Seck A, Bercion R, Borand L, Pardos de la Gandara M, Delarocque-Astagneau E, Guillemot D, Vray M, Garin B, Collard JM, Rodrigues C, Brisse S. Gut Microbes. 2020 Sep 2;11(5):1287-1299. doi: 10.1080/19490976.2020.1748257. Epub 2020 May 13. PMID: 3240402
2. Prevalence and Factors Associated with Maternal Group B Streptococcus Colonization in Madagascar and Senegal.
Jung YJ, Huynh BT, Seck A, Bercion R, Sarr FD, Herindrainy P, Diouf JB, Andrianirina ZZ, Firon A, Trieu-Cuot P, Goyet S, Collard JM, Delarocque-Astagneau E, Guillemot D, Vray M; BIRDY Study Group. Am J Trop Med Hyg. 2021 Aug 30;105(5):1339-1346. doi: 10.4269/ajtmh.21-0113. PMID: 34460418
3. Severe bacterial neonatal infections in Madagascar, Senegal, and Cambodia: A multicentric community-based cohort study.
Huynh BT, Kermorvant-Duchemin E, Chheang R, Randrianirina F, Seck A, Hariniaina Ratsima E, Andrianirina ZZ, Diouf JB, Abdou AY, Goyet S, Ngo V, Lach S, Pring L, Sok T, Padget M, Sarr FD, Borand L, Garin B, Collard JM, Herindrainy P, de Lauzanne A, Vray M, Delarocque-Astagneau E, Guillemot D; BIRDY study group. PLoS Med. 2021 Sep 28;18(9):e1003681. doi: 10.1371/journal.pmed.1003681. eCollection 2021 Sep. PMID: 34582450
4. Characterization of Klebsiella pneumoniae isolates from a mother-child cohort in Madagascar.
Rakotondrasoa A, Passet V, Herindrainy P, Garin B, Kermorvant-Duchemin E, Delarocque-Astagneau E, Guillemot D, Huynh BT, Brisse S, Collard JM. 2020 Jul 1;75(7):1736-1746. doi: 10.1093/jac/dkaa107. PMID: 32303060
5. Incidence and risk factors of neonatal bacterial infections: a community-based cohort from Madagascar (2018-2021).
IDevred I, Rambliere L, Herindrainy P, Andriamarohasina L, Harimanana A, Randrianirina F, Ratsima EH, Hivernaud D, Kermorvant-Duchemin E, Andrianirina ZZ, Abdou AY, Delarocque-Astagneau E, Guillemot D, Crucitti T, Collard JM, Huynh BT. Incidence and risk factors of neonatal bacterial infections: a community-based cohort from Madagascar (2018-2021). BMC Infect Dis. 2023 Oct 5;23(1):658. doi: 10.1186/s12879-023-08642-w. PMID: 37798644; PMCID: PMC10552278.
6. Excess risk of subsequent infection in hospitalized children from a community cohort study in Cambodia and Madagascar.
Lison Rambliere, Elsa Kermorvant-Duchemin, Agathe de Lauzanne, Jean-Marc Collard, Perlinot Herindrainy, Muriel Vray, Benoit Garin, Andrianirina Zafitsara Zo, Fanjalalaina Rasoanaivo, Jacob Rakotoarimanana Feno Manitra, Tanjona Bodonirina Raheliarivao, Jean-Baptiste Niokhhor Diouf, Véronique Ngo, Siyin Lach, Pring Long, Laurence Borand, Touch Sok, Armiya Youssouf Abdou, Michael Padget, Yoann Madec, Didier Guillemot, Elisabeth Delarocque-Astagneau, Bich-Tram Huynh. International Journal of Epidemiology. 2022 Oct 13;51(5):1421-1431. doi: 10.1093/ije/dyac048. PMID: 35333344
7. Stillbirths and neonatal mortality in LMICs: A community-based mother-infant cohort study.
Rambliere L, de Lauzanne A, Diouf JB, Zo AZ, Landau M, Herindrainy P, Hivernaud D, Sarr FD, Sok T, Vray M, Collard JM, Borand L, Delarocque-Astagneau E, Guillemot D, Kermorvant-Duchemin E, Huynh BT, BIRDY study group. J Glob Health. 2023 Apr 14;13:04031. PMID: 37057650
8. Inappropriate antibiotic prescribing and its determinants among outpatient children in 3 low- and middle-income countries: A multicentric community-based cohort study.
Ardillon A, Ramblière L, Kermorvant-Duchemin E, Sok T, Zo AZ, Diouf JB, Long P, Lach S, Sarr FD, Borand L, Cheysson F, Collard JM, Herindrainy P, de Lauzanne A, Vray M, Delarocque-Astagneau E, Guillemot D, Huynh BT; BIRDY study group. Inappropriate antibiotic prescribing and its determinants among outpatient children in 3 low- and middle-income countries: A multicentric community-based cohort study. PLoS Med. 2023 Jun 6;20(6):e1004211. doi: 10.1371/journal.pmed.1004211. PMID: 37279198; PMCID: PMC10243627.
9. Bacterial Infections and Antibiotic-Resistant Diseases Among Young Children in Low-Income Countries (BIRDY) Study Group.
Vaccination Coverage and Risk Factors Associated With Incomplete Vaccination Among Children in Cambodia, Madagascar, and Senegal.
Verrier F, de Lauzanne A, Diouf JN, Zo AZ, Ramblière L, Herindrainy P, Sarr FD, Sok T, Vray M, Collard JM, Borand L, Kermorvant-Duchemin E, Delarocque-Astagneau E, Guillemot D, Huynh BT; Bacterial Infections and Antibiotic-Resistant Diseases Among Young Children in Low-Income Countries (BIRDY) Study Group. Vaccination Coverage and Risk Factors Associated With Incomplete Vaccination Among Children in Cambodia, Madagascar, and Senegal. Open Forum Infect Dis. 2023 Mar 10;10(4):ofad136. doi: 10.1093/ofid/ofad136. PMID: 37035496; PMCID: PMC10077827.
