Le virus Ebola est responsable de fortes fièvres et d'hémorragies souvent mortelles pour l'homme. Le taux de létalité se situe entre 30 et 90% selon les épidémies et l'espèce virale. Le réservoir naturel du virus serait la chauve-souris. Le virus Ebola a été découvert en 1976, lors des deux flambées épidémiques au Soudan et en République démocratique du Congo. Depuis, une vingtaine de flambées épidémiques sont apparues en Afrique Centrale. En décembre 2013, le virus a atteint l’Afrique de l’Ouest, région qui était jusqu’alors épargnée par la maladie. En 2014, il provoque la plus grande épidémie connue jusqu’à présent. Depuis, il a réémergé à plusieurs reprises en RDC, mais aussi en Guinée en 2021. L’enjeu des recherches actuelles est de poursuivre le développement des traitements et des outils diagnostiques pour le traitement et le dépistage de la maladie.

La Diphtérie est une maladie causée par plusieurs espèces de corynebactéries du complexe diphtheriae. La diphtérie typique est une infection respiratoire qui induit des atteintes du système nerveux central,  de la gorge ou d’autres organes, entraînant la mort par asphyxie. Plus fréquentes, les infections cutanées sont souvent moins graves. Il existe un vaccin efficace, obligatoire pour les enfants et les professionnels de santé, pour lequel il est recommandé de suivre le calendrier vaccinal toute sa vie.

Considérée longtemps par erreur comme une maladie de la petite enfance, la coqueluche peut être sévère à tout âge. Cette infection bactérienne est particulièrement dramatique, voire mortelle, pour les jeunes nourrissons, non ou partiellement vaccinés, et les personnes à risque telles que les femmes enceintes et les personnes âgées. 

La cryptococcose est une infection fongique grave. Elle survient chez les patients immunodéprimés. La forme clinique la plus fréquente de cette infection est une méningo-encéphalite, fatale en l’absence de traitement. 

Le choléra est une maladie diarrhéique aigue épidémique, strictement humaine, due à la bactérie Vibrio cholerae des sérogroupes O1 (et rarement O139). Cette infection peut être causée par des contacts directs avec des malades (via des mains sales, toilettes mortuaires, …) mais plus fréquemment par l’ingestion d’eau ou d’aliments contaminés par des déjections de malades. Une résurgence du choléra au niveau mondial est observée depuis 2022 après de nombreuses années de baisse du nombre de cas de choléra.

Le chikungunya est une maladie virale transmise à l’humain par la piqûre des moustiques Aedes albopictus et Aedes aegypti. Bien que rarement mortelle, cette maladie peut causer des douleurs significatives et une incapacité prolongée, affectant la qualité de vie des personnes touchées. Les traitements existants sont uniquement symptomatiques. Actuellement en France, 80% des départements rassemblent les conditions propices à l’émergence de la maladie. 

Les champignons (levures) du genre Candida peuvent provoquer des infections superficielles touchant les muqueuses et la peau et des infections viscérales : elles peuvent se limiter à un organe ou disséminer à travers l’organisme. Parmi les 200 espèces de Candida connues, une vingtaine est responsable d’infections humaines. Les levures Candida sont souvent responsables d’infections graves, survenant dans un contexte nosocomial.

La bactérie Helicobacter pylori (H. pylori) est l’agent causal de pathologies de l’estomac chez l'être humain : elle est responsable de gastrites chroniques, d’ulcères gastriques (plaies ouvertes qui se développent sur la muqueuse interne de l’estomac) et duodénaux. Elle joue un rôle important dans la genèse des cancers gastriques (adénocarcinomes et lymphomes). Ceci a conduit à réviser le traitement de la maladie ulcéreuse désormais considérée comme une maladie infectieuse, et pose d’une façon plus générale la question de l’éradication de cette bactérie (qui infecte 50% de la population mondiale) comme moyen de prévention des cancers gastriques.

Le cancer du col de l’utérus est le quatrième cancer le plus fréquent chez la femme dans le monde. Il est presque 100% imputable à une infection chronique par des virus appartenant à la famille des papillomavirus. À l’échelle mondiale environ 600 000 nouveaux cas, et plus de 300 000 décès, sont recensés chaque année. La maladie peut être prévenue grâce à des tests de dépistage réguliers. 

Le botulisme est une affection neurologique grave provoquée par une toxine très puissante produite par la bactérie Clostridium botulinum. Il existe différents types de botulisme : botulisme alimentaire, botulisme infantile ou botulisme contracté via une blessure. Si le botulisme est rare, sa mortalité reste élevée quand le traitement n’est pas précoce.