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Maladies infectieuses bactériennes : tuberculose, méningite, choléra et autres infections

Les maladies infectieuses d'origine bactérienne regroupent un large éventail d'infections causées par des bactéries pathogènes. 

Elles peuvent toucher différents organes (poumons, peau, système digestif, système nerveux…). Les bactéries qui en sont à l’origine se transmettent par contact direct, ingestion d'aliments ou d'eau contaminés, ou par le biais d’animaux. Parmi ces maladies, on peut citer la tuberculose, le choléra, la méningite à méningocoques, la peste ou encore la fièvre typhoïde. Certaines peuvent être graves ou mortelles sans traitement rapide. 

À ces menaces infectieuses s’ajoute la résistance aux traitements antibiotiques (urgence mondiale en santé publique) qui rend de plus en plus difficile la prise en charge d’un certain nombre de ces infections. Une étude parue dans The Lancet en 2024 rappelle que 1,2 million de personnes meurent chaque année directement d'infections causées par des bactéries résistantes aux antibiotiques. Si l'on inclut les cas où l'antibiorésistance a contribué au décès sans en être la cause unique, on estime à environ 4,7 à 5 millions le nombre de décès par an. Cela fait de l'antibiorésistance une menace sanitaire mondiale comparable, voire supérieure à des maladies comme le VIH/sida ou le paludisme en termes de mortalité annuelle. 

Ces résistances existent malheureusement aussi pour les traitements contre les virus, les parasites et les champignons.

Maladies infectieuses virales : Covid-19, VIH/sida, hépatites ou encore cancer du col de l’utérus

De nombreux virus sont pathogènes pour l'être humain. Ils peuvent se transmettre de diverses façons. Le SARS-CoV-2 (Covid-19) se propage par les voies respiratoires ; le VIH/sida se transmet par voie sanguine ou sexuelle, quand le virus chikungunya et celui de la rage, eux, sont transmis par des piqûres ou morsures d'animaux. Certains virus, comme les virus hépatiques ou le papillomavirus peuvent également être à l'origine de certains cancers. 

Il existe des résistances à certains traitements antiviraux qui entraînent un enjeu de santé publique lors de la prise en charge des patients.

Maladies infectieuses parasitaires : paludisme ou encore leishmaniose

Les maladies parasitaires sont causées par des protozoaires, des vers ou d'autres parasites, souvent transmis par des insectes vecteurs, à l’instar des moustiques. On y retrouve le paludisme (Plasmodium), la maladie de Chagas (Trypanosoma cruzi), la leishmaniose ou encore la maladie du sommeil (trypanosomiase africaine). Certaines, comme l’amibiase, se contractent via l’eau ou les aliments contaminés. 

Il existe des résistances à des traitements antiparasitaires (certains traitements antipaludéens par exemple) qui sont un obstacle à la prise en charge efficace des patients.

Maladies infectieuses fongiques (mycoses) : candidoses ou aspergilloses

Les mycoses sont provoquées par des champignons microscopiques. Elles peuvent être superficielles ou profondes, affectant la peau, les muqueuses, les poumons ou le système nerveux central. Ce groupe comprend, par exemples, l’aspergillose, les candidoses et la cryptococcose, des pathologies particulièrement préoccupantes chez les personnes immunodéprimées.

Il existe des résistances à des traitements antifongiques qui constituent une menace de santé publique (voir la vidéo Et si la prochaine menace sanitaire venait… des champignons?, avec Sarah Dellière, chercheuse à l’Institut Pasteur).

Maladies transmissibles multifactorielles ou liées aux soins

Ces pathologies regroupent des infections complexes ou liées à des conditions particulières, comme le sepsis (réponse inflammatoire grave à une infection). Elles peuvent  survenir en milieu hospitalier (infections nosocomiales) ou communautaire (c’est-à-dire contractées dans notre environnement quotidien, comme les pneumonies, infections urinaires, méningites...). Elles nécessitent une prise en charge urgente. 

Maladies neurologiques et troubles du développement, comme la maladie d’Alzheimer et l’autisme

En dehors du champ infectieux, les maladies neurologiques et neurodégénératives forment un groupe majeur de pathologies. Souvent chroniques et évolutives, elles regroupent des affections qui touchent le cerveau, la moelle épinière ou les nerfs périphériques, comme la maladie d’Alzheimer ou encore la maladie de Parkinson. 

Les troubles du développement concernent notamment certains troubles du spectre autistique. 

Maladies génétiques : mucoviscidose, maladies rares et mutations héréditaires

D'autres maladies trouvent leur origine non dans un micro-organisme, mais dans le code génétique lui-même. Provoquées par des mutations de l'ADN, héréditaires ou acquises de novo (mutation d’un gène apparaissant chez un individu alors qu'aucun des parents ne la possède dans son patrimoine génétique ; ce type de mutation spontanée survient lors du processus de réplication de l'ADN pendant la division cellulaire), les maladies génétiques regroupent des pathologies variées : la mucoviscidose, le syndrome de Sanfilippo, les maladies mitochondriales ou encore certaines formes de surdité congénitale. Elles se caractérisent par des symptômes spécifiques et nécessitent un suivi médical spécialisé. 

Cancers

Les cancers, c'est-à-dire la prolifération anarchique de cellules, résultent de modifications du génome. Celles-ci peuvent être héréditaires, survenir spontanément lors de la division cellulaire, ou être provoquées par des facteurs environnementaux : tabac, alcool, mauvaise alimentation, exposition aux polluants ou certains agents infectieux. 

Par exemple, le cancer du col de l’utérus causé par le papillomavirus (HPV), les cancers gastriques dus à Helicobacter pylori, ou le sarcome de Kaposi provoqué par l’herpès virus HHV-8. L’identification de l’agent infectieux à l’origine de ces cancers permet une meilleure prévention et, parfois, une vaccination ciblée. 

Autres maladies non infectieuses, comme l’endométriose

Cette catégorie regroupe diverses affections non infectieuses, souvent chroniques et invalidantes, comme l’endométriose (affection gynécologique) et la maladie de Verneuil (hidrosadénite suppurée). Elles ne sont pas causées par un micro-organisme mais peuvent fortement impacter la qualité de vie.