Virology
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Research is being conducted in the department to understand the molecular and cellular mechanisms that are involved in various viral cycle stages, and the processes driving related diseases. Considerable efforts are ongoing to identify and analyze the biological and epidemiological determinants of infectious disease emergence. Research focuses on various aspects such as transmission, animal reservoirs and vectors, epidemiology, viral evolution, and host immune response. Emerging and respiratory viruses, arboviruses and retroviruses are studied using cutting-edge techniques. The department houses several National Reference Centers and WHO Collaborating Centers which provide essential epidemiological surveillance of viral infectious diseases.
Our main recent publications
Development of a pentavalent vaccine against New World arenaviruses
New World arenaviruses cause fatal hemorrhagic fever in South America. MOPEVAC NEW is a pentavalent live attenuated vaccine for the Junin, Machupo, Chapare, Guanarito and Sabiá viruses. It induces sterilizing immunity against the Machupo and Guanarito viruses in cynomolgus monkeys due to high titers of antibodies, including neutralizing antibodies, demonstrating the efficacy of this vaccine for several of these viruses.
Nature Microbiology, January 5, 2023.
The tiger mosquito can transmit the chikungunya virus in temperate conditions
Arboviruses such as chikungunya (CHIKV) first emerged in Europe in 2007. By combining three approaches (transcriptomics, metagenomics and genomics), scientists have identified temperature as a modifying factor in mosquitoes’ immunity gene expression and microbiota, and also in the genetic diversity of CHIKV, although it does not affect transmission efficiency.
Journal of Travel Medicine, April 25, 2023.
New discovery concerning receptors used by coronaviruses to enter human cells
The gateway used by a seasonal coronavirus, HKU1, to enter human cells has been identified. HKU1 binds to a different receptor than SARS-CoV-2, which may partly explain the difference in severity between these two coronaviruses. Receptors provide a useful means of elucidating coronavirus transmissibility and pathology as part of surveillance work on viral evolution.
Nature, October 25, 2023.
Early HIV treatment encourages lasting remission
Starting antiretroviral treatment soon after HIV infection promotes long-term remission from infection once treatment has been discontinued. A study conducted on primate models revealed that remission is related to the early development of CD8+ T immune cells, which are particularly effective in eliminating the virus. The findings pave the way for novel immunotherapy strategies to treat HIV infection.
Nature Communications, January 11, 2024.
Targeting nuclear structures to neutralize HIV
The HIV virus forms structures in the nucleus of infected cells known as membraneless condensates (HIV-1-MLOs), which protect it from the immune system and enable it to remain dormant. By blocking these structures, scientists were able to make the virus harmless. This discovery improves our understanding of the mechanisms used by HIV to evade the body's defenses and could open up new avenues for treatment.
EMBO Journal, December 2, 2024.
Nos principaux travaux en 2025
Cartographier l’abdomen du moustique Aedes
Les moustiques Aedes aegypti, vecteurs de la dengue, du Zika ou encore de la fièvre jaune, constituent une menace pour la santé mondiale. Après un repas de sang, leurs tube digestif et tissu adipeux orchestrent digestion, métabolisme, reproduction et défense immunitaire. Grâce au séquençage d’ARN sur cellule unique, cette étude dresse une carte détaillée de ces tissus et donne des pistes pour de nouvelles méthodes de lutte antivectorielle.
Cell Genomics,13 août 2025
Surveiller la résistance au virus respiratoire RSV
Le nirsévimab protège les nourrissons contre le virus respiratoire syncytial (RSV), mais certains cas d’infection surviennent malgré le traitement. En France, des scientifiques ont étudié ces cas en séquençant le génome du virus et en testant sa sensibilité au médicament. Si la plupart des souches restent sensibles, quelques rares mutations conférant une résistance ont été détectées, soulignant la nécessité d’une surveillance étroite au fil des saisons.
The Lancet Infectious Diseases, Mars 2025
Comprendre la résistance au traitement du mpox
Le virus du mpox, proche de la variole, fait l’objet d’un traitement par le tecovirimat. Grâce à la cristallographie et à des simulations de dynamique moléculaire, les scientifiques ont élucidé la structure de sa cible virale, la phospholipase F13, révélant comment certaines mutations de cette phospholipase permettent au virus d’y résister. Ces résultats ouvrent la voie à la conception d’antiviraux plus efficaces.
Nature Microbiology, 12 février 2025
Nos principaux travaux précédents
En 2024
Un traitement précoce du VIH favorise une rémission durable
Commencer le traitement antirétroviral très tôt après une infection par le VIH favorise la rémission de l’infection durablement après l’arrêt du traitement. Une étude menée sur modèle primate révèle que cette rémission serait liée au développement précoce de cellules immunitaires T CD8 particulièrement efficaces pour éliminer le virus. Ces résultats ouvrent la voie à de nouvelles stratégies d’immunothérapie de l’infection par le VIH.
Nature Communications, 11 janvier 2024
Cibler des structures nucléaires pour neutraliser le VIH
Le virus du VIH forme des structures dans le noyau des cellules infectées appelées condensats sans membrane (HIV-1-MLOs) qui le protègent du système immunitaire et lui permettent de rester en dormance. En bloquant ces structures, les chercheurs ont réussi à rendre le virus inoffensif. Cette découverte permet de mieux comprendre les mécanismes par lesquels le VIH échappe aux défenses de l’organisme et pourrait ouvrir de nouvelles pistes pour le traitement de l’infection.
EMBO Journal, 2 décembre 2024
En 2023
Mise au point d’un vaccin pentavalent contre les Arénavirus du Nouveau Monde
Les Arénavirus du Nouveau Monde causent des fièvres hémorragiques mortelles en Amérique du Sud. MOPEVAC NEW est un vaccin vivant atténué pentavalent dirigé contre les virus Junin, Machupo, Chapare, Guanarito et Sabia. Il induit une immunité stérilisante chez les singes cynomolgus contre les virus Machupo et Guanarito grâce à des titres élevés en anticorps, y compris neutralisant, démontrant l’efficacité de ce vaccin contre plusieurs de ces virus.
Nature Microbiology, 5 janvier 2023
Le moustique-tigre capable de transmettre le virus du chikungunya à des températures tempérées
Les arbovirus tels que le chikungunya (CHIKV) ont émergé pour la première fois en Europe en 2007. En combinant trois approches (transcriptomique, métagénomique, et génomique), des scientifiques démontrent que la température modifie l'expression des gènes de l’immunité et le microbiote du moustique, ainsi que la diversité génétique du CHIKV, sans affecter l’efficacité de sa transmission.
Journal of Travel Medicine, 25 avril 2023
Nouvelle découverte sur les récepteurs d’entrée des coronavirus dans les cellules humaines
La porte d’entrée dans les cellules humaines d’un coronavirus saisonnier, le virus HKU1, a été identifiée. Le récepteur sur lequel se fixe le HKU1 est différent de celui utilisé par le SARS-CoV-2, ce qui pourrait expliquer en partie la différence de sévérité de ces deux coronavirus. Dans le cadre de la surveillance de l’évolution virale, les récepteurs sont des cibles d’intérêt pour comprendre la transmissibilité et la pathologie des coronavirus.
Nature, 25 octobre 2023