Coronavirus SARS-CoV-2 : the Institut Pasteur mobilization
L’Institut Pasteur à Paris et le Réseau International des 32 Instituts Pasteur sont mobilisés massivement partout dans le monde pour répondre par la science à la pandémie d’infection par le coronavirus SARS-CoV-2. Cette mobilisation regroupe actuellement plusieurs centaines de personnes de l’Institut Pasteur à Paris et plusieurs équipes du Réseau dans différents pays. Une Task force Coronavirus, lancée par l'Institut Pasteur dès janvier dernier, lance et coordonne de nouvelles recherches pasteuriennes sur le Covid-19. Mais beaucoup d'autres projets sont également en cours de réalisation en partenariats ou avec le soutien d'organismes tiers. A ce stade, voici les projets de recherche en cours, plusieurs autres démarreront très prochainement. Voici un état des lieux des travaux engagés (au 29 mai 2020).
Projets de recherche
Connaissance du virus et de sa pathogénèse
Evolution du SARS-CoV-2 chez l'humain pendant l'infection et de la réponse immunitaire par anticorps. (Projet SARS-CoV-2_EVOLSERO)
INTERNATIONAL | Paris, Laos | Suivi de l’origine et de la transmission / propagation du SARS-CoV-2 au Laos et au Vietnam : recherche de virus de type SARS et détection d’anticorps chez les vertébrés.(Projet SPILLOVER-CORONA)
Une technique pour identifier les facteurs de la cellule importants pour l'infection par le SARS-CoV-2. (Projet CoV-CRISPR)
Caractérisation des interactions intra-virales du SARS-CoV-2 et des interactions virus-hôte axées sur la signalisation de l'immunité innée. (Projet PSII)
Vers une détection contrôlée du SARS-CoV-2 par le système immunitaire inné. (Projet CoV-2Sensing)
INTERNATIONAL | Paris, Shanghai, Laos, Vietnam | Origines, réservoirs naturels et transmission inter-espèces du SARS-CoV-2 et d’autres coronavirus dit « SARS-like ». (Projet ONRITS)
Une combinaison d’approches protéomiques de pointe pour mieux comprendre les mécanismes de l'infection par le SARS-CoV-2 (projet PROTEO-SARS-CoV-2)
Évaluation du rôle des protéines apico-basales pendant l’infection par SARS-CoV2 (projet EPIC)
INTERNATIONAL | Paris, KKU | Caractérisation de l’immunité systémique et des muqueuses pendant l’infection par le SARS-CoV-2 et le rétablissement (projet COVar_Immune)
Rôle des récepteurs nicotiniques dans l’infection par SARS-CoV2 au sein du cerveau (projet NicoSars)
Mécanismes de propagation intercellulaire du SARS-CoV-2 : évaluation du rôle des nanotubes pour échapper à la surveillance immunitaire et augmenter le tropisme et la pathogénicité (projet COVID-Spreads)
Étude des facteurs déterminants du tropisme du coronavirus dans un modèle humain 3D de cellules épithéliales pulmonaires (Projet TROPICORO - TROPIsm of COROnaviruses)
Implications neurologiques de l’infection SARS-CoV2 – une étude transversale (Projet NeuroCoVid)
INTERNATIONAL | Paris | Restriction de la réplication du SARS-CoV-2 par des gènes codants et non codants (projet ROSA)
Analyse des interactions du virus avec les récepteurs d’invasion des cellules humaines et de leur potentielle inhibition (DSAC project)
Développement d’outils pour la recherche
Caractérisation de l’interaction entre la protéine Nsp3 du SARS-CoV-2 et des structures non-canoniques d’acide nucléique (G4) présents dans les cellules infectées. (Projet G4-COVID19)
Technique de séquençage génomique du SARS-CoV-2 pour analyser les échantillons cliniques de basse qualité. (Projet SABSOS)
Développement d’un test pour identifier des inhibiteurs des protéases du SARS-CoV-2 (projet Cov2-PIs)
Génération de modèles animaux sensibles au SARS-CoV-2 pour tester des vaccins ou des médicaments (Projet hACE2-COV)
Production d’antigènes recombinants de 2 protéines de surface du coronavirus SARS-CoV-2 et génération de nano-anticorps contre ces protéines pour des applications diagnostiques et thérapeutiques. (Projet CORONABODIES)
INTERNATIONAL | Paris, Dakar, Cameroun, Côte d’Ivoire | Surveillance sérologique du SARS-CoV-2 et des coronavirus saisonniers (projet CoronaSeroSurv)
L’utilisation de méthodes d’intelligence artificielle pour discriminer le Covid-19 des autres pneumopathies, à partir d’images radiographiques et tomodensitométriques thoraciques (projet AIMDP COVID-19)
Séquencer directement et à faible coût le génome complet de Covid-19 à partir d’échantillons d’ARN prélevés sur des patients (projet CAPTURE-COV)
Un modèle de poisson-zèbre pour l’étude de la neuro-invasion par SARS-CoV2 (projet NeuroCoVidZ)
Recherche épidémiologique ou socio-épidémiologique
Constitution d’une collection d’échantillons biologiques humains en France. (Projet CORSER – Etude séro-épidémiologique du virus SARS-CoV-2)
Agents de santé et bénévoles de la Croix-Rouge et continuité des soins avec Covid-19 : une approche opérationnelle à méthodes mixtes (projet RCCOVID)
L’Institut Pasteur étudie la transmission du SARS-CoV-2 de l’Homme aux animaux domestiques.
INTERNATIONAL | São Paolo | Etude descriptive : analyse épidémiologique, clinique et immunologique des cas de SARS-CoV-2 à São Paulo Metropolis, au Brésil (Study MRSP)
INTERNATIONAL | Montevideo | Conception d’un polypeptide dérivé de l’ACE2 pour une détection label-free en temps réel sur un smartphone et pour l’assistance thérapeutique (isCoVDe - projet in silico Coronaviruses Decoy)
INTERNATIONAL | Cameroun, Paris | Evaluation de la propagation du virus SARS-CoV-2 au sein de différents groupes de population au Cameroun (Projet infection spread in Cameroon)
INTERNATIONAL | Guyane, Nouvelle-Calédonie, Guadeloupe | Étude d’investigation sur la transmission du SARS au sein de ménages des territoires d’Outre-Mer (projet EPICOVID-19)
Évaluation du risque Covid-19 parmi les contacts familiaux des premiers cas en Afrique (projet COVID-19 risk evaluation project)
INTERNATIONAL / Dakar / Évaluation du tableau clinique et de l’évolution de l’infection par le coronavirus SARS-CoV-2 au Sénégal (projet SEN-CoV)
INTERNATIONAL / Niger, Dakar, Cameroun, Madagascar / Suivi/Évaluation des facteurs de risque d’infection par le coronavirus SARS-CoV-2 chez les professionnels de santé dans les établissements de soins pour la prise en charge des 1° cas de COVID-19 (projet Healthcare workers Africa)
Développement d’outils diagnostiques
INTERNATIONAL | Paris, Cambodge | Développement d’outils sérologiques Covid-19 simples et enquête sérologique ciblée sur des individus à risque. (Projet COVID19 Serosurvey)
Caractérisation des anticorps chez les patients en convalescence et développement d’un test sérologique appliqué à une enquête épidémiologique chez des individus exposés au SARS-CoV-2. (Projet SARS-CoV-2-LIPS)
INTERNATIONAL | São Paolo | Développement d’un laboratoire sur puce à faible coût pour diagnostiquer le SARS-CoV-2 (Projet LAMP)
INTERNATIONAL / Canada / Développement d’un test rapide de détection du virus SARS-CoV2 pouvant être utilisé hors des laboratoires (projet POC)
Prophylaxie et candidats vaccins
Développement d'un modèle animal et développement accéléré d’un candidat vaccin à ADN. (Projet SCARD SARS-CoV-2)
Glycoprotéine Spike, vecteurs lentivireaux et vaccin à cellules B/T (Projet VAC-NAB-COV)
Le CEPI finance le développement d’un vaccin contre SARS-CoV-2, projet porté par le consortium de l’Institut Pasteur, de Themis et de l’université de Pittsburgh.
Essai randomisé de chimioprophylaxie du Covid-19 chez les professionnels de santé (essai COVIDAXIS)
INTERNATIONAL | Bulgarie | Développement d’un nouveau nano-vaccin à multiples épitopes contre le coronavirus SARS-CoV2 et création d’un modèle de souris humanisé pour tester ce vaccin (Projet VacciNanoCor)
INTERNATIONAL | Madagascar | Etude sur les premiers cas d’infections par le coronavirus (COVID-19) et leurs contacts à Antananarivo, Madagascar. (projet Covid-19 & contacts Madagascar)
Recherche thérapeutique
Isoler et caractériser les anticorps humains neutralisant le SARS-CoV-2. (Projet 2019-NCOV THERAMAB)
Des génomes viraux défecteux (DVG), inhibiteurs antiviraux potentiels du SARS-CoV-2 (Projet SARS-DVGs)
INTERNATIONAL | Rome, Paris, Lille | Trouver des médicaments antiviraux puissants contre le SARS-CoV-2 en ciblant des protéines bien spécifiques essentielles au cycle viral. (Projet DrugDesign_SARS2)
INTERNATIONAL | Shanghai, Paris | Identification and isolation of potent human neutralizing antibodies against SARS-CoV-2 (NABCOV project)
INTERNATIONAL | Paris | Accélérer l'identification et la conception des antiviraux contre le SARS-CoV2 en collaboration avec le projet "DrugDesign_SARS2" (projet inSilico_Drugs_to_Beat_SARS2).
INTERNATIONAL | INRS Canada | Découverte urgente de candidats-médicaments ciblant le coronavirus SARS-CoV-2 (projet DrugCandidates-SARS-Cov2)
Repositionnement et conception de médicaments pour inhiber les protéases du SARS-CoV2 (projet CoV2-Anti-protease)
Modélisation
Lancement d’une grande enquête auprès des Français sur leurs contacts pendant le confinement (projet SOCIALCOV)
Bio-informatique
Covid-19 : le Hub de bioinformatique et biostatistique de l’Institut Pasteur se mobilise (GISAID, nextrain)