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Centres nationaux de référence
L'Institut Pasteur héberge 15 centres nationaux de référence (à Paris et à Lyon) et 4 CNR-laboratoires associés (en Guyane). Nommés pour 5 ans par le ministère chargé de la Santé, ces laboratoires experts sont des observatoires des maladies transmissibles sur le territoire français. Ils interagissent étroitement avec la Cellule d'intervention biologique d'urgence de l'Institut Pasteur.
Bactéries anaérobies et botulisme
Le CNR des Bactéries anaérobies et du botulisme surveille la circulation de ces bactéries en France, analyse les prélèvements transmis par les laboratoires, conseille les professionnels de santé et conduit des recherches sur les agents responsables de ces infections, dont Clostridioides difficile et Clostridium botulinum.
Coqueluche et autres bordetelloses
Le CNR Coqueluche et bordetelloses surveille la circulation de la coqueluche en France, analyse les prélèvements envoyés par les laboratoires, conseille les soignants et conduit des recherches sur les bactéries Bordetella responsables de ces infections respiratoires.
Corynébactéries du complexe diphtheriae
Corynebacterium diphteriae (ou bacille de Klebs et Loeffler). Bacille de 1 à 8 microns de long, à Gram positif non ramifié non sporulé et immobile, en forme de massue et groupé en amas. Agent de la diphtérie, angine à "fausses membranes". Encore beaucoup de mortalité surtout infantile dans le tiers monde où la couverture vaccinale est faible. (Grossissement X 1000).
Le CNR des Corynebactéries du complexe diphtheriae surveille la circulation de la diphtérie en France, caractérise les souches adressées par les laboratoires, conseille les médecins et biologistes face aux cas suspects et conduit des recherches sur les bactéries Corynebacterium responsables de ces infections potentiellement mortelles.
Entérovirus & paréchovirus
Le Centre National de Référence Entérovirus et Paréchovirus a pour rôle principal d'assurer la surveillance des infections à EV et HPeV en coordination avec Santé publique France.
Escherichia coli, Shigella, Salmonella
Bactéries Escherichia coli O104:H4 (souche 55989) en interaction avec des cellules de l'épithélium intestinal humain (lignée T84). Microscopie electronique à balayage. Cette souche de Escherichia coli a été isolée en République de Centre-Afrique et son génome a été séquencé par des chercheurs de l'Institut Pasteur en collaboration avec le Génoscope.
Le CNR des Escherichia coli, Shigella et Salmonella surveille ces bactéries entériques responsables de toxi-infections alimentaires et d'infections invasives en France, type les souches adressées par les laboratoires, contribue à la détection des épidémies et conduit des recherches sur ces agents pathogènes.
Fièvres hémorragiques virales
Le CNR des Fièvres hémorragiques virales surveille la circulation de ces virus en France, réalise les diagnostics biologiques des cas suspects, conseille les équipes soignantes sur la prise en charge et conduit des recherches sur les virus responsables de ces infections sévères, dont Ebola et Lassa.
Hantavirus
Virus Sin Nombre (SNV), un Hantavirus,
au microscope électronique en transmission
Le CNR des Hantavirus surveille la circulation de ces virus en France, diagnostique les infections humaines, analyse les données épidémiologiques et conduit des recherches sur les hantavirus responsables de la néphropathie épidémique et d'autres infections transmises par les rongeurs.
Leptospirose
Les leptospires appartiennent au phylum des spirochètes et sont constitués de bactéries saprophytes et pathogènes. Les espèces pathogènes sont responsables d'une zoonose: la leptospirose, où l'homme se retrouve être un hôte occasionnel dans un cycle impliquant les animaux sauvages et domestiques.
Le CNR de la Leptospirose surveille cette infection bactérienne en France, confirme le diagnostic biologique des cas suspects, conseille les professionnels de santé et conduit des recherches sur les bactéries Leptospira responsables de cette zoonose transmise notamment par les rongeurs.
Listeria
Cellule infectée par Listeria monocytogenes. (Photographie de microscopie à fluorescence). Au cours de l'infection, les bactéries Listeria (en bleu clair) se multiplient à l'intérieur des cellules infectées.
Le CNR Listeria participe à la surveillance de Listeria et de la listériose en France. Il caractérise les souches d'origine humaine et alimentaire, contribue à la détection des épidémies, et à l’identification des sources de contamination. L’unité de Biologie des infections, à laquelle il est affilié, conduit des recherches sur Listeria monocytogenes et la listériose.
Méningocoques et Haemophilus influenzae
Bactéries Neisseria meningitidis adhérant à la surface de cellules épithéliales. Les diplocoques sont enchevêtrés dans des microvillosités d'origine cellulaires. Les bactéries Neisseria meningitidis constituent l'une des causes majeures de méningites aiguës.
Le CNR des Méningocoques et Haemophilus influenzae surveille la circulation de ces bactéries responsables de méningites et d'infections invasives en France, type les souches transmises par les laboratoires, conseille les soignants et les autorités sanitaires, contribue aux réponses aux situations anormales, aux stratégies de surveillance et de vaccination, et conduit des recherches sur ces agents pathogènes à déclaration obligatoire.
Mycoses invasives et antifongiques
Champignons filamenteux Scedosporium apiospermum.
Le CNR des Mycoses invasives et antifongiques surveille ces infections fongiques graves en France, identifie les champignons responsables et évalue leur sensibilité aux traitements, conseille les cliniciens sur la prise en charge et conduit des recherches sur les mécanismes de résistance aux antifongiques.
Peste et autres yersinioses
Foie de souris expérimentalement infecté par le bacille de la peste Yersinia pestis.
Le CNR de la peste et autres yersinioses surveille les infections à Yersinia en France, caractérise les souches responsables de yersiniose entérique, intervient en cas de suspicion de peste importée et conduit des recherches sur ces bactéries pathogènes pour l’homme.
Rage
Virus de la rage en microscopie électronique. Image colorisée.
Le CNR de la Rage surveille cette infection virale en France, réalise les diagnostics biologiques humains et vétérinaires, conseille les équipes soignantes sur la conduite à tenir après exposition et conduit des recherches sur les lyssavirus responsables de cette maladie toujours mortelle une fois les symptômes déclarés.
Vibrions et choléra
Vue en microscopie électronique d'un vibrion cholérique. On peut voir son flagelle qui lui permet de se déplacer. Les points noirs sont de fines particules d'or qui permettent de visualiser des anticorps reconnaissant un antigène exposé à la surface de la bactérie.
Le CNR des Vibrions et du Choléra surveille la circulation de ces bactéries en France, caractérise les souches de Vibrio cholerae et autres vibrions transmises par les laboratoires, contribue à la veille épidémiologique mondiale et conduit des recherches sur ces agents pathogènes d'origine hydrique et alimentaire.
Virus des infections respiratoires (dont la grippe et le SARS-CoV-2)
Virus de la grippe type A. Particules sphériques irrégulières de taille variable (80 à 120 nanomètres de diamètre) mais le virus peut également se présenter sous la forme de longs filaments. (Grossissement X 117000). Image colorisée.
Le CNR des virus des infections respiratoires surveille la circulation de la grippe, du SARS-CoV-2 et des autres virus respiratoires en France, analyse les prélèvements envoyés par les laboratoires hospitaliers et de ville, conseille les autorités sanitaires et conduit des recherches sur ces virus responsables d'épidémies saisonnières et de pandémies.