Plan stratégique 2019-2023 : les avancements 2020 de l'axe "maladies infectieuses émergentes"

Ces cinquante dernières années ont vu émerger de nombreuses zoonoses, dans lesquelles un agent pathogène animal a franchi la barrière d'espèce pour provoquer une maladie chez l'homme. Des agents pathogènes connus ré-émergent sans cesse en raison de modifications de leur écosystème, conduisant au développement d'épidémies synergiques. L'Institut Pasteur et le Réseau International des Instituts Pasteur sont idéalement positionnés pour répondre à ces menaces.

Les avancements de l’axe au 31 décembre 2020

• L’Institut Pasteur, confronté à l’émergence du SARS-CoV-2 en décembre 2019, a immédiatement mobilisé ses équipes pour répondre aux multiples défis posés par la nouvelle pandémie 
  • Développement des tests diagnostiques RT-PCR et sérologiques au CNR des virus respiratoires, isolement et séquençage des premières souches arrivées sur le territoire français fin janvier 2020, puis des variants anglais et sud-africains un an plus tard 
  • Enquêtes épidémiologiques dans les écoles de Crépy-en-Valois, et études cas-témoins sur les circonstances et les lieux de transmission du SARS-CoV-
  • Modélisation de la dynamique épidémique en France, analyse de l’efficacité des méthodes de contrôle de l’épidémie, impact des variants et des vaccins sur la dynamique épidémique, modélisation de la transmission du virus dans les lieux de soins. Voir modelisation-covid19.pasteur.fr
  • Analyse longitudinale de la réponse immunologique chez des patients infectés par le SARS-CoV-2
  • Etude de l’interaction cellule-pathogène
  • Développement d’anticorps monoclonaux à visée thérapeutique
  • Développement de candidats vaccins contre le SARS-CoV-2.
  • En Afrique et en Asie, le Réseau International des Instituts Pasteur a facilité la mise en place de laboratoires de diagnostic du SARS-CoV-2 dans les pays les plus démunis, contribuant ainsi à la surveillance mondiale de l’épidémie. L’ensemble de ces travaux a fait l’objet de plus d’une centaine de publications scientifiques, dont certaines ont eu un impact direct sur la gestion de l’épidémie en France et dans le monde. 

En savoir plus sur la mobilisation de l'Institut Pasteur contre la pandémie de Covid-19 et le virus SARS-CoV-2

• En marge de sa réponse à l’épidémie de Covid-19, l’Institut Pasteur a poursuivi en 2020 sa lutte contre d’autres maladies infectieuses émergentes ou ré-émergentes. Sans être exhaustif, on peut citer notamment :
  • De nouvelles recommandations pour la prise en charge des femmes enceintes positives au virus de l’hépatite B
  • Des avancées dans la compréhension des mécanismes de réplication du VIH et de son contrôle immunitaire
  • L’établissement du rôle central de l’homme dans la propagation du choléra
  • La mise à jour d’un risque de transmission accru de la fièvre jaune

L’axe « maladies infectieuses émergentes » ce sont :

• 10 départements scientifiques 
  • Biologie Cellulaire et Infection,
  • Biologie Computationnelle,
  • Génomes et Génétique,
  • Santé Globale,
  • Immunologie,
  • Microbiologie,
  • Mycologie,
  • Parasites et Insectes Vecteurs,
  • Biologie Structurale et Chimie,
  • Virologie.

• 87 équipes

• 3 plateformes technologiques
  • Biomics Platform (Marc Monot) 
  • Antibody Engineering (Pierre Lafaye)
  • Center for the Production and Infection of Anopheles (Patricia Baldacci)

• 4 ressources biologiques
  • CRBIP (Sylvain Brisse)
  • Collection of the Institut Pasteur - CIP (Dominique Clermont)
  • Collection of Cyanobacteria (Muriel Gugger)
  • National Collection of Cultures of Microorganisms (Raquel Hurtado Ortiz)

• ​12 centres nationaux de référence (CNR)
• Centre national de référence des et Haemophilus influenzae (Muhamed-kheir TAHA)
• Centre national de référence de la Peste et autres yersinioses (Sophie Le Guern)
• Centre national de référence des Bactéries anaérobies et du botulisme (Christelle Mazuet)
• Centre national de référence des Vibrions et du choléra (Marie-Laure Quilici)
• Centre national de référence des Hantavirus (Jean-Marc Reynes)
• Mycoses invasives et antifongiques (Françoise Dromer)
• Centre national de référence des Corynebactéries du complexe diphtheriae et Centre national de référence de la coqueluche et autres bordetelloses (Sylvain Brisse)

• 3 LABEX 
  • IBEID, Inception, Milieu intérieur

• Le Pasteur International Center for Research on Emerging Infectious Diseases (créé en octobre 2020)