Nos actions de surveillance

L'Institut Pasteur s’appuie sur une infrastructure unique pour agir en véritable sentinelle et protéger la santé humaine : 14 centres nationaux de référence et 4 CNR-laboratoires associés, 8 centres collaborateurs de l’OMS, une Cellule d’Intervention Biologique d’Urgence (CIBU) disponible 24h/24 et 7/7j, ainsi que des équipes spécialisées en épidémiologie et en modélisation.

Une mission historique au cœur de la santé publique

La santé publique est l'une des missions fondatrices de l'Institut Pasteur. Nos expertises scientifiques sont directement mobilisées pour surveiller les maladies infectieuses, comprendre leur évolution, prévenir leur diffusion et améliorer leur prise en charge. 

Les Centres nationaux de référence (CNR) : des sentinelles pour anticiper, surveiller et alerter face aux menaces sanitaires  

L'Institut Pasteur héberge 14 centres nationaux de référence (à Paris et à Lyon) et 4 CNR-laboratoires associés (en Guyane). Nommés pour 5 ans par le ministère chargé de la Santé, ces laboratoires experts constituent le dispositif sentinelle français de lutte, de contrôle et de surveillance des maladies transmissibles.

Chaque CNR est spécialisé sur un agent infectieux ou un groupe de maladies : listériose, rage, virus respiratoires (comme le SARS-CoV-2 ou le virus de la grippe), ou encore les hantavirus et les fièvres hémorragiques virales, à titres d’exemples. Véritables observatoires épidémiologiques, ils identifient précisément les agents pathogènes en circulation, suivent leur évolution (apparition de variants, résistances aux antibiotiques) et alertent sans délai les autorités sanitaires face à tout phénomène inhabituel ou risque épidémique.

Leurs missions s'articulent autour de quatre axes principaux :

• l’expertise concernant la microbiologie, la pathologie des agents infectieux et leur sensibilité aux agents anti-infectieux ;
• la contribution à la surveillance épidémiologique, en suivant l’évolution et les caractéristiques des infections ;
• l’alerte par l’information immédiate de Santé Publique France et du ministre chargé de la Santé de toute situation pouvant entraîner des répercussions sur l’état sanitaire de la population ;
• le conseil des pouvoirs publics, des agences de sécurité sanitaire et des professionnels de santé ;  

Dans ce cadre, les CNR s'appuient sur un réseau dense de partenaires nationaux et internationaux : 

• des laboratoires de biologie médicale publics ou privés (LBM) ; 
• des médecins sentinelles ;
• Santé Publique France ;
• des agences régionales de santé, comme l’ARS ;
• des laboratoires et organismes de recherche (Inserm, CNRS, Anses…) ; 
• des laboratoires industriels ; 
• des ONG. 

La plupart des CNR sont membres de réseaux européens, comme le European Center for Diseases Control, ou internationaux. Huit CNR sont actuellement des centres collaborateurs de l’OMS, l’Organisation Mondiale de la Santé.

Les CNR interagissent étroitement avec la Cellule d'intervention biologique d'urgence de l'Institut Pasteur.

La CIBU : une cellule d'urgence biologique disponible 24h/24

Face aux menaces biologiques imprévues, l'Institut Pasteur dispose d’une infrastructure unique : la Cellule d'Intervention Biologique d'Urgence (CIBU). 

Disponible 24h/24 et 7j/7, elle est capable de répondre aux urgences microbiologiques et d’identifier rapidement un large spectre de pathogènes (bactéries et virus), en particulier lors d’événements sanitaires inhabituels ou d’épidémies exceptionnelles.

La CIBU est organisée en trois pôles complémentaires :

• le Pôle d'Identification Bactérienne (PIB) ;
• le Pôle d'Identification Virale (PIV) ;
• le Pôle de Génotypage des Pathogènes (PGP).

Modélisation et épidémiologie : anticiper pour mieux décider

Séquençage des agents infectieux, analyse de grandes quantités de données biologiques, modélisation mathématique des dynamiques épidémiques… Nos expertises scientifiques permettent d'anticiper l'évolution des épidémies et d'éclairer la décision publique.

Nos plateformes de génomique et de séquençage constituent un dispositif clé dans la surveillance génomique de pathogènes. 

Durant la pandémie de Covid-19, les équipes de l'Institut Pasteur ont contribué à modéliser la circulation du virus, à estimer le nombre de cas et à suivre l'émergence des variants, fournissant aux autorités sanitaires des données essentielles pour orienter leur réponse. 

Plus récemment, l'Institut Pasteur a également contribué à la modélisation de l'épidémie de grippe saisonnière en France métropolitaine.

De nos territoires au monde entier : l'Institut Pasteur en première ligne face aux crises sanitaires

L'action de l'Institut Pasteur en matière de surveillance sanitaire est profondément ancrée dans le dispositif de santé français, y compris dans les territoires ultramarins, tout en s'inscrivant dans une dynamique internationale. 

• Le Pasteur Network : un dispositif majeur de surveillance des maladies infectieuses dans de nombreux pays

Grâce au Pasteur Network et à ses collaborations avec les autorités de santé du monde entier, nous pouvons agir au plus près des zones d'émergence, partager rapidement les connaissances et renforcer les capacités locales face aux crises sanitaires.

• Les Laboratoires de référence de l’Union Européenne 

Les Laboratoires de référence de l’Union européenne (EURL, pour European Reference Laboratory) en santé publique ont pour but d’aider les laboratoires nationaux à harmoniser leurs pratiques. Leur rôle consiste à promouvoir de bonnes méthodes de diagnostic, de tests et de surveillance, ainsi qu’à standardiser la notification des menaces sanitaires transfrontalières, le tout sur une base volontaire. 

Actuellement, trois EURLs associent des laboratoires de l’Institut Pasteur :

• EURL-PH-DIPE - Diphtérie et coqueluche
• EURL-PH-ERZV - Virus zoonotiques et émergents

• EURL-PH-RESVIR - Virus respiratoires

   

• Observatoires et réseaux de surveillance épidémiologique 

Les équipes de l’Institut Pasteur co-pilotent ou co-animent également des observatoires et réseaux de surveillance épidémiologique en France et à l’international autour des grandes menaces, à l’instar des virus respiratoires, des arboviroses ou encore autour des maladies émergentes.

C'est cette capacité à conjuguer ancrage français et ouverture sur le monde qui fait toute notre force.

Sur le terrain face aux crises : Ebola et la peste, deux exemples emblématiques

La complémentarité entre CNR et CIBU a démontré toute son efficacité lors de crises sanitaires majeures.

En 2014, lors de l'épidémie d'Ebola en Afrique de l'Ouest, l’Institut Pasteur a joué un rôle clé dans l’identification rapide du virus et l’alerte internationale. 

Le CNR des fièvres hémorragiques virales a confirmé que le virus appartenait à la même famille que celui d'Ebola, tandis que la CIBU a identifié précisément la souche responsable, Ebola Zaïre, la plus virulente. 

Les équipes se sont ensuite déployées en Guinée pour installer des laboratoires de diagnostic, analyser des milliers d'échantillons, développer un test rapide et former les soignants locaux. Cet engagement s'est prolongé par la création de l'Institut Pasteur de Guinée, afin de renforcer durablement les capacités de surveillance et de réponse aux épidémies.

En 2017, lors de l'épidémie de peste pulmonaire à Madagascar, les équipes de l'Institut Pasteur de Paris se sont mobilisées en appui de l'Institut Pasteur de Madagascar pour faire face à une situation exceptionnelle. 

Elles ont contribué à l’analyse des données épidémiologiques, au renforcement des capacités de diagnostic et à l’expertise scientifique afin de mieux comprendre la dynamique de l’épidémie et adapter les stratégies de réponse.

Mai 2026 : séquençage complet de l’hantavirus Andes détecté à bord du navire de croisière MV Hondius

Menées conjointement par le CNR Hantavirus et la CIBU de l’Institut Pasteur, les investigations virologiques ont permis de réaliser le séquençage complet de la souche de l’hantavirus détectée dans un prélèvement sanguin de la passagère française testée positive après son voyage à bord du navire MV Hondius. 

Outre le séquençage de la souche virale (Andes), nos équipes se sont fortement mobilisées autour des analyses diagnostiques en France durant l’épisode infectieux, tout en contribuant à l’évaluation du risque de transmission et au conseil aux autorités sanitaires.