Cours Pasteur

Analyse avancée des bioimages avec l'Intelligence Artificielle (IA)

Ce cours d’analyse de bioimage combine théorie et pratique pour équiper les participants des outils et techniques nécessaires à l’analyse avancée d’images en sciences de la vie. Il est construit sur deux pistes : Le 'début de carrière des chercheurs track' vise à maîtriser les outils logiciels d’analyse d’image les plus récents et communs. La piste d’analyse se concentre sur l’utilisation d’algorithmes avancés et de ressources informatiques pour l’analyse des bioimages.

Informations pratiques

  • 5 jours
  • 31 mai 2027 - 4 juin 2027
  • Institut Pasteur
  • Anglais

Contacts

ABA-AI@pasteur.fr

Inscriptions

  • Date limite : 1 mars 2027
  • Participant.e.s : 35

Accréditations :

  • Diplôme de l'Institut Pasteur

Description

L’analyse d’images biologiques est un domaine multidisciplinaire qui intègre la biologie, l’informatique et les mathématiques pour extraire, traiter et interpréter des informations à partir d’images biologiques. Grâce à des outils et techniques avancés, les chercheurs peuvent quantifier et visualiser des images biologiques, permettant ainsi d’approfondir la compréhension des processus du vivant.

Le cours Pasteur "Advanced Bioimage Analysis with Artificial Intelligence (IA)" offre une solide formation en analyse d’images biologiques, en mettant l’accent sur les applications pratiques tout en se concentrant sur les techniques d’IA – sans s’y limiter exclusivement. En 2026, le cours donnera la priorité aux jeunes chercheurs (Early Career Investigators), avec un effectif maximal de 35 participants.

Le parcours dédié aux jeunes chercheurs est conçu pour les biologistes et chercheurs ayant une expérience limitée en analyse d’images. Ce cours accompagnera les participants depuis les bases – comme l’installation et l’utilisation de logiciels courants (Fiji, Icy, QuPath, Napari, Ilastik et TrackMate) – jusqu’à la construction de leurs propres pipelines d’analyse. À l’issue de la formation, les participants seront capables d’utiliser, de modifier et d’exécuter des scripts et des notebooks pour le traitement et l’analyse de leurs images.

Le cours propose des séances interactives et pratiques, combinant cours théoriques et travaux dirigés, afin de favoriser la collaboration entre étudiants et formateurs dans un environnement stimulant.

Témoignage

 

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Directeur.rice.s

OLIVO-MARIN Jean-christophe - Institut Pasteur
TINEVEZ Jean-Yves - Institut Pasteur

Membres du comité de cours

CHERIET Samia - Institut Pasteur
OLIVO-MARIN Jean-christophe - Institut Pasteur
PONTICELLI Virginie - Institut Pasteur
SALA Monica - Institut Pasteur
TINEVEZ Jean-Yves - Institut Pasteur