Le directeur général de l'Institut Pasteur est nommé pour quatre ans. Son mandat est renouvelable une fois. Le directeur général, sous l'autorité du conseil d'administration, assure le fonctionnement de l'Institut Pasteur.
Le directeur général nomme aux emplois autres que ceux pourvus par le conseil d'administration et ordonnance les dépenses.
Le directeur général est le représentant légal de l'Institut Pasteur.
Le directeur général de l'Institut Pasteur est assisté dans ses fonctions par un directeur en charge des questions administratives et financières et par les autres membres de la direction.
Les directions de l'Institut Pasteur
Direction générale
Prof. Sir Stewart Cole
Direction générale adjointe
François Romaneix
Direction générale adjointe scientifique
Christophe D’Enfert
Direction des applications de la recherche et relations industrielles
Isabelle Buckle
Direction de la communication - médiation scientifique
Jean-François Chambon
Direction de la philanthropie
Antoine Bogaerts
Direction Internationale
Jennifer Heurley
Direction juridique
Samuel Valcke
Direction des ressources techniques et de l'environnement
Nathalie Denoyés
Direction financière
Françoise Perriolat
Direction médicale
Pierre Buffet
Direction des ressources humaines
Odile Hermabessière
Direction de la technologie
Michael Nilges
Direction des systèmes d’information
Stéphane Fournier
Direction de l'enseignement
Monica Sala
Direction des carrières et de l’évaluation scientifique
Patrick Trieu-Cuot
Direction de l'audit et du contrôle interne
Pascal Masse-Navette
Délégué à la sécurité et à la sûreté
François Thibault
