Cours Pasteur : Initiation au logiciel R

Le cours "Initiation au logiciel R" a pour objectif de présenter le langage de programmation R en abordant, en particulier, l’importation, la manipulation, l’exportation des données. La description de données à l'aide de statistiques de base et de graphiques est aussi abordée.

 

R est un environnement gratuit et un langage de programmation pour réaliser des analyses statistiques.

 

Les participants doivent être familiers de l’environnement Windows et de Microsoft Excel. Cependant, aucune expérience préalable de programmation informatique (en R ou en un autre langage) ou en statistique n’est requise, mais un intérêt pour la programmation sous forme de programmes (script) est demandé.

 

A l’issue du cours, les participants pourront gérer leurs données avec R (importation, contrôles de cohérence, création de variables, exportation…) et effectuer une exploration basique des données (description statistique de base, représentation graphique). Ils auront aussi les bases afin de pouvoir continuer à explorer R et se former à des analyses plus complexes, ou pour interagir avec des statisticiens plus aguerris.

 

Une initiation aux tests statistiques permettra d'aborder les comparaisons de variables quantitatives (t-test non-paramétrique de Wilcoxon) et de variables qualitatives (test du chi-2)

 

Programme du cours

 

Présentation de l’environnement R

  • Installation de R et de R studio
  • Types de données dans R
  • Syntaxe de R
  • Ecriture de programmes

Gestion des données avec R

  • Importer des données dans R
  • Décrire les données et contrôler la qualité
  • Manipuler les données
  • Exporter des données

Graphiques

  • Histogrammes
  • Nuages de points
  • Boîtes à moustaches

Initiation au test statistique

  • Comparaison de variables continues (test de student et analyse de la variance)
  • Comparaison de variables catégorielles (chi2)
  • Test non paramétrique pour les petis échantillons

 

Les candidatures sont évaluées par le Comité du cours.

 

Membres du comité du cours

 

Y. Madec (Unité d’Epidemiologie des Maladies Emergentes, Institut Pasteur),

V. Ponticelli (Institut Pasteur),

V. Rouilly (independent Data Scientist Consultant, Datactix founder.),

M. Sala (Institut Pasteur),

D. Tavel (Institut Pasteur),

A. Thiébaut (Institut Pasteur/INSERM),

H. Waxin (Institut Pasteur).

 

 

Informations pratiques

 

Titre du cours Initiation au logiciel R
Directeur

Yoann Madec

Unité de Recherche et d'Expertise Epidémiologie des Maladies Emergentes

Insitut Pasteur

Co-directeur

David Tavel

Unité de Recherche et d'Expertise Epidémiologie des Maladies Emergentes

Insitut Pasteur

Participants 15

Durée

5 jours
Dates

20-24 mars 2017

Clôture des inscriptions

27 janvier 2017

Diplômes  
Contact

enseignement@pasteur.fr

Candidature

Inscription en ligne

 

Frais de participation

Mis à jour le 09/12/2016