ybhI - ybhJ sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

ATG AAT AAG AAA TCG TTA TGG AAG CTA ATT CTG ATA TTA GCG ATC CCA TGT

ATT ATT GGT TTT ATG CCA GCT CCG GCA GGA TTA AGC GAA CTG GCG TGG GTG

CTT TTT GGT ATT TAC CTG GCG GCC ATT GTG GGG CTG GTT ATC AAG CCT TTC

CCG GAA CCT GTC GTA CTG TTA ATT GCC GTT GCT GCC TCA ATG GTG GTG GTC

GGT AAC TTA TCC GAC GGT GCG TTT AAA ACC ACC GCC GTA TTA AGC GGT TAC

TCT TCA GGT ACC ACC TGG CTG GTG TTC TCG GCG TTT ACC TTA AGC GCC GCA

TTT GTG ACC ACC GGT TTA GGT AAA CGT ATT GCC TAT CTG CTG ATT GGT AAA

ATC GGT AAC ACC ACG CTG GGT CTG GGT TAC GTT ACG GTA TTC CTC GAT CTG

GTA CTG GCT CCG GCA ACA CCG TCT AAC ACC GCG CGT GCG GGC GGC ATT GTG

TTA CCG ATC ATC AAC AGC GTG GCG GTG GCT TTG GGG TCC GAA CCG GAA AAA

AGT CCG CGT CGT GTC GGA CAT TAC CTG ATG ATG TCC ATT TAC ATG GTC ACC

AAA ACC ACC AGC TAT ATG TTC TTT ACC GCA ATG GCG GGG AAC ATT CTG GCG

CTG AAA ATG ATC AAC GAC ATT CTG CAC CTG CAA ATT AGC TGG GGT GGA TGG

GCG CTG GCA GCC GGA TTG CCG GGC ATC ATT ATG CTG CTG GTC ACC CCG CTG

GTG ATT TAC ACC ATG TAT CCA CCA GAA ATT AAG AAG GTG GAT AAC AAA ACC

ATC GCT AAA GCG GGC CTT GCC GAA CTA GGA CCG ATG AAA ATC CGC GAA AAA

ATG CTG CTC GGT GTC TTT GTG CTG GCG CTG CTG GGC TGG ATT TTC AGT AAG

TCT CTG GGG GTT GAT GAA TCC ACC GTG GCA ATC GTT GTT ATG GCA ACC ATG

CTG CTG CTG GGT ATC GTT ACC TGG GAA GAC GTG GTT AAA AAT AAA GGC GGC

TGG AAT ACC TTA ATC TGG TAC GGC GGT ATT ATC GGC TTA AGC TCC TTA TTA

TCG AAA GTT AAA TTC TTC GAA TGG TTA GCT GAA GTC TTT AAA AAT AAC CTG

GCA TTT GAT GGT CAC GGT AAC GTT GCT TTC TTC GTT ATT ATT TTC CTC AGC

ATT ATC GTG CGT TAT TTC TTC GCT TCC GGT AGT GCC TAT ATC GTT GCT ATG

TTA CCG GTA TTT GCC ATG CTG GCG AAC GTC TCC GGC GCA CCG TTA ATG TTA

ACC GCG CTG GCA CTG TTG TTC TCC AAC TCC TAT GGC GGC ATG GTT ACT CAC

TAT GGC GGC GCG GCA GGT CCG GTC ATC TTT GGC GTG GGT TAT AAC GAT ATT

AAA TCC TGG TGG TTG GTC GGT GCG GTA CTG ACG ATA TTA ACC TTC CTG GTG

CAT ATC ACC CTC GGC GTG TGG TGG TGG AAT ATG CTG ATC GGC TGG AAC ATG

CTG TAA

ATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTT

ACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGCTTGTCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAG

AGTATATCCATTTATTATCTTTCTGCGCACTTCACG

GTG CGC AGA TAT CTG GAG CAT TTG ATG ATC AAG TTA TCT GAA AAA GGC GTG

TTT CTC GCC AGT AAT AAC GAA ATA ATT GCC GAA GAA CAT TTC ACC GGC GAA

ATT AAA AAA GAA GAA GCC AAA AAA GGC ACT ATT GCC TGG TCT ATT CTC TCT

TCG CAT AAT ACG TCC GGA AAT ATG GAT AAA CTT AAA ATT AAG TTT GAT TCA

TTA GCC TCT CAC GAT ATT ACC TTT GTT GGT ATT GTA CAG ACC GCT AAA GCG

TCC GGT ATG GAA CGT TTC CCG CTG CCG TAT GTG CTG ACC AAC TGC CAT AAC

TCA CTC TGC GCC GTC GGC GGC ACT ATT AAC GGT GAT GAC CAT GTT TTT GGT

TTA TCG GCG GCC CAG CGT TAT GGC GGT ATT TTT GTG CCT CCG CAT ATT GCG

GTC ATC CAT CAA TAT ATG CGT GAG ATG ATG GCA GGC GGC GGC AAA ATG ATC

CTC GGG TCA GAC AGC CAC ACC CGT TAC GGT GCA TTA GGG ACA ATG GCA GTC

GGT GAG GGC GGC GGT GAG TTG GTA AAA CAG CTG CTT AAT GAC ACC TGG GAT

ATC GAC TAT CCG GGC GTG GTT GCG GTG CAT CTG ACC GGA AAA CCT GCG CCG

TAT GTG GGG CCA CAG GAT GTG GCG CTG GCT ATC ATT GGC GCG GTG TTC AAA

AAC GGT TAC GTC AAA AAC AAA GTC ATG GAG TTC GTT GGA CCG GGC GTT AGC

GCG CTC TCT ACC GAT TTC CGT AAC AGC GTT GAC GTG ATG ACC ACT GAA ACG

ACC TGT TTA AGT TCT GTC TGG CAA ACC GAT GAA GAA GTC CAT AAC TGG CTG

GCG CTG CAC GGT CGC GGC CAG GAT TAC TGC CAG CTT AAC CCT CAA CCG ATG

GCG TAC TAC GAT GGC TGC ATC AGC GTT GAT TTA AGC GCC ATC AAA CCA ATG

ATT GCG CTG CCG TTC CAC CCG AGC AAC GTG TAT GAA ATC GAC ACA CTG AAC

CAG AAC CTG ACC GAC ATT CTG CGT GAG ATT GAA ATT GAG TCC GAA CGC GTG

GCG CAC GGT AAA GCC AAA CTC TCG CTG CTG GAT AAA GTG GAA AAT GGT CGC

CTG AAA GTG CAG CAG GGG ATT ATC GCG GGC TGT TCT GGC GGT AAC TAC GAA

AAC GTC ATC GCG GCG GCG AAT GCA CTG CGC GGT CAA TCC TGT GGC AAT GAC

ACC TTC TCG CTG GCA GTT TAC CCG TCA TCA CAG CCG GTG TTT ATG GAT CTC

GCC AAA AAA GGT GTG GTA GCA GAT TTG ATT GGC GCA GGC GCA ATC ATC AGA

ACC GCG TTC TGC GGC CCA TGC TTT GGC GCG GGC GAT ACG CCA ATC AAC AAC

GGT TTG AGT ATT CGC CAC ACC ACG CGT AAC TTC CCG AAC CGC GAA GGC TCT

AAG CCA GCT AAT GGG CAG ATG TCA GCG GTG GCG TTG ATG GAC GCT CGT TCT

ATC GCT GCG ACT GCG GCA AAC GGT GGC TAT TTA ACC TCT GCC AGC GAA CTT

GAT TGC TGG GAC AAC GTG CCG GAG TAC GCC TTC GAT GTA ACG CCG TAT AAA

AAC CGT GTT TAT CAG GGC TTT GTG AAA GGG GCA ACT CAG CAA CCG CTG ATT

TAC GGG CCG AAC ATT AAA GAC TGG CCG GAA TTG GGT GCG CTG ACT GAC AAT

ATC GTC CTG AAA GTG TGC TCG AAG ATC CTC GAC GAA GTG ACC ACC ACC GAC

GAA CTG ATT CCT TCC GGT GAA ACC TCT TCT TAT CGT TCA AAT CCG ATT GGT

CTG GCG GAG TTT ACC CTG TCT CGC CGC GAT CCC GGT TAT GTT AGC AGA AGT

AAA GCG ACT GCT GAG CTG GAA AAT CAG CGT CTG GCG GGG AAT GTC AGC GAG

CTG ACA GAG GTG TTT GCG CGC ATT AAG CAG ATT GCT GGT CAG GAG CAT ATT

GAT CCG CTG CAA ACT GAA ATT GGC AGC ATG GTC TAT GCG GTG AAA CCA GGC

GAT GGT TCT GCG CGT GAA CAG GCG GCG AGC TGC CAG CGT GTG ATT GGC GGT

CTG GCG AAT ATT GCC GAG GAG TAC GCG ACT AAA CGC TAT CGT TCT AAC GTC

ATC AAC TGG GGG ATG TTA CCG CTG CAA ATG GCG GAA GTA CCA ACC TTT GAA

GTG GGG GAT TAC ATT TAC ATC CCT GGC ATT AAA GCG GCG CTG GAT AAT CCG

GGT ACG ACG TTT AAA GGT TAT GTG ATC CAT GAA GAT GCG CCG GTA ACG GAA

ATT ACG CTC TAT ATG GAA AGT CTG ACT GCT GAA GAG CGC GAG ATT ATC AAG

GCG GGT AGT TTG ATT AAC TTC AAT AAA AAC CGT CAG ATG TAA

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

ybhI - ybhJ sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.