prpE - codB sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

ATG TCT TTT AGC GAA TTT TAT CAG CGT TCG ATT AAC GAA CCG GAG CAG TTC

TGG GCC GAG CAG GCC CGG CGT ATT GAC TGG CAG ACG CCC TTT ACG CAA ACG

CTC GAT CAC AGC AAT CCG CCG TTT GCC CGT TGG TTT TGT GAA GGC CGA ACC

AAC TTG TGC CAC AAC GCC ATC GAC CGC TGG CTG GAG AAA CAG CCA GAG GCG

CTG GCG CTG ATT GCC GTC TCT TCG GAA ACA GAA GAA GAG CGC ACC TTT ACC

TTT CGT CAG CTG CAT GAC GAA GTG AAC GCG GTG GCC TCA ATG TTG CGT TCA

TTG GGT GTG CAG CGC GGC GAT CGG GTG CTG GTG TAT ATG CCG ATG ATT GCC

GAA GCG CAT ATT ACT CTG CTG GCC TGC GCG CGC ATT GGC GCT ATT CAC TCG

GTG GTG TTT GGT GGA TTT GCC TCG CAC AGC GTG GCG GCG CGA ATT GAT GAC

GCT AAA CCG GTG CTG ATT GTC TCG GCT GAT GCC GGA GCG CGC GGT GGC AAA

ATC ATT CCC TAT AAA AAA TTG CTC GAC GAT GCG ATA AGT CAG GCG CAG CAC

CAG CCA CGC CAT GTT TTG CTG GTG GAT CGC GGG CTG GCG AAA ATG GCG CGC

GTC AGC GGG CGG GAT GTC GAT TTC GCG TCG TTG CGC CAT CAA CAC ATC GGC

GCG CGG GTA CCG GTG GCG TGG CTG GAA TCC AAC GAA ACC TCC TGC ATT CTC

TAC ACT TCC GGC ACG ACC GGC AAA CCT AAA GGC GTG CAG CGT GAC GTC GGC

GGA TAT GCG GTG GCG CTG GCG ACC TCG ATG GAC ACC ATT TTT GGC GGC AAA

GCG GGC AGC GTG TTC TTT TGC GCA TCG GAT ATC GGC TGG GTG GTG GGG CAT

TCG TAT ATC GTT TAC GCG CCG CTG CTG GCG GGG ATG GCG ACT ATC GTT TAC

GAA GGA TTG CCG ACC TGG CCG GAC TGC GGC GTG TGG TGG ACA ATC GTC GAG

AAA TAT CAG GTT AGC CGG ATG TTC TCA GCG CCG ACC GCC ATT CGC GTG CTG

AAA AAA TTC CCT ACC GCT GAA ATT CGC AAA CAC GAT CTC TCG TCG CTG GAA

GTG CTC TAT CTG GCT GGA GAA CCG CTG GAC GAG CCG ACC GCC AGT TGG GTG

AGC AAT ACG CTG GAT GTG CCG GTC ATC GAC AAC TAC TGG CAG ACC GAA TCC

GGC TGG CCG ATT ATG GCG ATT GCT CGC GGT CTG GAC GAC AGG CCG ACG CGT

CTG GGA AGC CCC GGT GTG CCG ATG TAT GGC TAT AAC GTG CAG TTG CTT AAT

GAA GTC ACC GGC GAA CCG TGT GGC GTC AAC GAG AAA GGG ATG CTG GTG GTG

GAA GGG CCG CTG CCG CCG GGG TGT ATT CAG ACC ATC TGG GGC GAC GAC GGC

CGC TTT GTG AAG ACT TAC TGG TCG CTG TTT TCC CGC CCG GTG TAC GCC ACC

TTT GAC TGG GGC ATC CGT GAC GCT GAC GGT TAT CAC TTT ATT CTC GGG CGC

ACT GAC GAT GTA ATT AAC GTT GCC GGG CAT CGG CTG GGG ACG CGC GAG ATT

GAA GAG AGT ATC TCC AGC CAT CCG GGC GTT GCC GAA GTG GCG GTG GTT GGG

GTG AAA GAT GCG CTG AAA GGG CAG GTG GCG GTG GCG TTT GTC ATT CCG AAA

GAG AGC GAC AGT CTG GAA GAT CGT GAT GTG GCG CAC TCG CAA GAG AAG GCG

ATT ATG GCG CTG GTG GAC AGC CAG ATT GGC AAC TTT GGC CGC CCG GCG CAC

GTC TGG TTT GTC TCG CAA TTG CCA AAA ACG CGA TCC GGA AAA ATG CTG CGC

CGC ACG ATC CAG GCG ATT TGC GAA GGA CGC GAT CCT GGA GAT CTG ACG ACC

ATT GAT GAT CCT GCG TCG TTG GAT CAG ATC CGC CAG GCG ATG GAA GAG TAG

GTTATTGTCGGATGCGTCGCGCGGTGCATCCGGCACTGTGTGCCGATGCCTGATGCGACGC

TGACGCGTTTTATCATGCCTACGGACCTGAACCGTAGGTCGGATAAGGCGCTCGCGTCGCA

TCCGACACCATGCTCAGATGCCTGATGCGACGCTGACGCGTCTTATCAGGCCTACCCACTG

TTTTTACACCGATAATTTTTCCCCCACCTTTTTGCACTCATTCATATAAAAAATATATTTC

CCCACGAAAACGATTGCTTTTTATCTTCAGATGAATAGAATGCGGCGGATTTTTTGGGTTT

CAAACAGCAAAAAGGGGGAATTTC

GTG TCG CAA GAT AAC AAC TTT AGC CAG GGG CCA GTC CCG CAG TCG GCG CGG

AAA GGG GTA TTG GCA TTG ACG TTC GTC ATG CTG GGA TTA ACC TTC TTT TCC

GCC AGT ATG TGG ACC GGC GGC ACT CTC GGA ACC GGT CTT AGC TAT CAT GAT

TTC TTC CTC GCA GTT CTC ATC GGT AAT CTT CTC CTC GGT ATT TAC ACT TCA

TTT CTC GGT TAC ATT GGC GCA AAA ACC GGC CTG ACC ACT CAT CTT CTT GCT

CGC TTC TCG TTT GGT GTT AAA GGC TCA TGG CTG CCT TCA CTG CTA CTG GGC

GGA ACT CAG GTT GGC TGG TTT GGC GTC GGT GTG GCG ATG TTT GCC ATT CCG

GTG GGT AAG GCA ACC GGG CTG GAT ATT AAT TTG CTG ATT GCC GTT TCC GGT

TTA CTG ATG ACC GTC ACC GTC TTT TTT GGC ATT TCG GCG CTG ACG GTT CTT

TCG GTG ATT GCG GTT CCG GCT ATC GCC TGC CTG GGC GGT TAT TCC GTG TGG

CTG GCT GTT AAC GGC ATG GGC GGC CTG GAC GCA TTA AAA GCG GTC GTT CCC

GCA CAA CCG TTA GAT TTC AAT GTC GCG CTG GCG CTG GTT GTG GGG TCA TTT

ATC AGT GCG GGT ACG CTC ACC GCT GAC TTT GTC CGG TTT GGT CGC AAT GCC

AAA CTG GCG GTG CTG GTG GCG ATG GTG GCC TTT TTC CTC GGC AAC TCG TTG

ATG TTT ATT TTC GGT GCA GCG GGC GCT GCG GCA CTG GGC ATG GCG GAT ATC

TCT GAT GTG ATG ATT GCT CAG GGC CTG CTG CTG CCT GCG ATT GTG GTG CTG

GGG CTG AAT ATC TGG ACC ACC AAC GAT AAC GCA CTC TAT GCG TCG GGT TTA

GGT TTC GCC AAC ATT ACC GGG ATG TCG AGC AAA ACC CTT TCG GTA ATC AAC

GGT ATT ATC GGT ACG GTC TGC GCA TTA TGG CTG TAT AAC AAT TTT GTC GGC

TGG TTG ACC TTC CTT TCG GCA GCT ATT CCT CCA GTG GGT GGC GTG ATC ATC

GCC GAC TAT CTG ATG AAC CGT CGC CGC TAT GAG CAC TTT GCG ACC ACG CGT

ATG ATG AGT GTC AAT TGG GTG GCG ATT CTG GCG GTC GCC TTG GGG ATT GCT

GCA GGC CAC TGG TTA CCG GGA ATT GTT CCG GTC AAC GCG GTA TTA GGT GGC

GCG CTG AGC TAT CTG ATC CTT AAC CCG ATT TTG AAT CGT AAA ACG ACA GCA

GCA ATG ACG CAT GTG GAG GCT AAC AGT GTC GAA TAA

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

prpE - codB sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.