o472 - o316 sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

ATG AGC CAG TCA CTG TTT AGC CAA CCA TTG AAC GTT ATT AAC GTC GGC ATC

GCC ATG TTT AGC GAT GAC CTG AAA AAG CAG CAT GTA GAA GTG ACT CAA CTC

GAC TGG ACG CCG CCG GGG CAG GGC AAT ATG CAG GTG GTG CAG GCG CTG GAT

AAC ATT GCC GAT TCG CCG CTG GCG GAC AAA ATC GCC GCC GCT AAC CAG CAG

GCG CTG GAG CGT ATT ATC CAG TCG CAT CCG GTG CTG ATT GGT TTT GAT CAG

GCG ATT AAC GTG GTG CCG GGC ATG ACG GCG AAA ACC ATT CTT CAC GCC GGG

CCG CCG ATC ACC TGG GAA AAA ATG TGC GGC GCG ATG AAA GGC GCG GTC ACC

GGA GCG CTG GTG TTC GAA GGA CTG GCG AAA GAT CTC GAC GAG GCG GCT GAA

CTG GCG GCT TCC GGG GAG ATC ACC TTC TCG CCG TGT CAC GAG CAC GAC TGC

GTG GGA TCG ATG GCG GGT GTT ACC TCG GCC TCG ATG TTT ATG CAC ATC GTA

AAA AAC AAA ACC TAC GGC AAC ATC GCT TAT ACC AAC ATG AGC GAG CAG ATG

GCG AAG ATT TTG CGT ATG GGC GCT AAC GAC CAG AGC GTG ATT GAC CGC CTG

AAC TGG ATG CGT GAT GTG CAG GGA CCA ATA CTG CGC GAC GCG ATG AAA ATT

ATC GGC GAA ATC GAT CTG CGC TTA ATG CTG GCG CAG GCG CTG CAT ATG GGC

GAT GAG TGC CAT AAC CGC AAT AAC GCC GGG ACG ACA CTG CTG ATT CAG GCG

CTG ACG CCG GGG ATT ATT CAG GCG GGT TAT TCC GTC GAG CAA CAG CGC GAA

GTG TTT GAG TTT GTC GCC AGC AGC GAC TAC TTC TCC GGC CCG ACG TGG ATG

GCG ATG TGT AAA GCG GCG ATG GAT GCG GCG CAT GGC ATC GAA TAC AGC ACC

GTG GTC ACC ACC ATG GCG CGT AAC GGC GTC GAG TTC GGC CTG CGG GTC AGC

GGC CTG CCG GGG CAA TGG TTT ACC GGC CCG GCG CAG CAG GTG ATC GGC CCG

ATG TTT GCC GGT TAT AAG CCG GAA GAT TCG GGG CTG GAT ATC GGC GAC AGC

GCC ATC ACC GAA ACC TAC GGT ATT GGC GGA TTT GCT ATG GCG ACC GCG CCC

GCT ATC GTC GCG CTG GTG GGC GGC ACG GTG GAA GAA GCT ATT GAT TTC TCC

CGT CAG ATG CGC GAA ATC ACC CTC GGT GAA AAC CCC AAC GTC ACC ATT CCG

CTG CTC GGT TTT ATG GGC GTG CCG TCG GCA ATC GAC ATC ACC CGC GTG GGT

AGC AGC GGC ATT CTG CCG GTG ATC AAC ACC GCC ATC GCC CAT AAA GAT GCG

GGC GTC GGC ATG ATT GGC GCG GGC ATT GTG CAT CCA CCT TTT GCC TGC TTC

GAG AAA GCC ATT CTT GGC TGG TGC GAA CGT TAC GGC GTC TGA

CCTACATGTTCATGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGAATGGCGCAAGAA

TCTGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGCATCAGGCATTTGTCACCATTGCCGGATGCGGCGTGA

ACGCCTTATCCGGCCTACGAATGGCGCAAGAATCTGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGCATCA

GGCATTTGCCACCACTGCCGGATGCGGCGTGGACGCCTTATCCGGCCTACGAGTGGCGCGA

GAATCTGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGCATCAGGCATTTGTCACCATTGCCGGATGCGGCG

TGAACGCCTTATCCGGCCTACGAGTGGCGCGAGAATTGTAGGCCTGATAAGCGTAGCGCAT

CAGGCAGTCTGGCGTTGGTCATAACCCCATCACCCTCTGTAGCGGACATAACAAC

ATG AAA GAG CTT GTG GTC GTT GCC ATT GGT GGC AAC AGC ATT ATC AAA GAT

AAC GCC AGC CAG TCG ATT GAG CAT CAG GCG GAG GCG GTG AAA GCC GTC GCC

GAT ACG GTG CTG GAA ATG CTG GCT TCC GAT TAC GAC ATT GTG CTG ACC CAC

GGC AAC GGG CCG CAG GTC GGG CTG GAT TTA CGC CGT GCG GAG ATT GCC CAC

AAG CGC GAA GGG CTG CCC TTA ACG CCG CTG GCG AAC TGT GTG GCA GAT ACG

CAG GGC GGC ATC GGC TAT CTG ATC CAA CAG GCG CTG AAT AAC CGG CTG GCG

CGT CAC GGC GAG AAG AAA GCC GTC ACC GTG GTG ACT CAG GTG GAA GTG GAT

AAA AAC GAT CCA GGT TTT GCC CAT CCC ACC AAG CCC ATC GGC GCA TTC TTT

AGT GAC AGC CAG CGT GAC GAA TTA CAA AAG GCA AAC CCT GAC TGG TGT TTT

GTT GAA GAT GCC GGG CGG GGC TAT CGC CGC GTG GTC GCC TCG CCG GAA CCG

AAA CGT ATT GTC GAA GCA CCT GCC ATT AAA GCG CTG ATC CAA CAA GGT TTT

GTC GTA ATT GGC GCG GGC GGC GGT GGA ATT CCG GTA GTG CGT ACT GAC GCG

GGA GAT TAC CAA AGC GTG GAC GCG GTT ATC GAC AAA GAT CTC TCT ACC GCG

CTG CTG GCC CGT GAA ATT CAC GCC GAC ATT CTT GTG ATC ACC ACT GGC GTC

GAA AAA GTG TGT ATT CAC TTT GGC AAA CCG CAG CAG CAG GCG CTC GAT CGG

GTG GAT ATT GCC ACC ATG ACC CGC TAT ATG CAG GAA GGG CAT TTC CCG CCC

GGC AGC ATG TTG CCA AAA ATC ATC GCC AGC CTG ACA TTT TTA GAA CAA GGC

GGC AAA GAA GTG ATT ATC ACC ACG CCG GAA TGC CTG CCT GCG GCG CTG CGC

GGC GAA ACG GGC ACT CAT ATT ATT AAA ACG TAA

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

o472 - o316 sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.