narK - narG sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

ATG AGT CAC TCA TCC GCC CCC GAA AGG GCT ACT GGA GCT GTC ATT ACA GAT

TGG CGA CCG GAA GAT CCT GCG TTC TGG CAA CAA CGC GGT CAA CGT ATT GCC

AGC CGC AAC CTG TGG ATT TCC GTT CCC TGT CTG CTG CTG GCG TTT TGC GTA

TGG ATG TTG TTC AGC GCT GTT GCG GTG AAC CTA CCG AAA GTC GGC TTT AAT

TTT ACG ACC GAT CAG CTA TTT ATG TTG ACT GCG CTG CCT TCG GTT TCT GGC

GCG TTA TTA CGT GTT CCA TAC TCC TTT ATG GTT CCT ATC TTC GGT GGT CGT

CGC TGG ACG GCG TTC AGC ACC GGT ATT CTG ATT ATT CCT TGC GTC TGG CTG

GGT TTT GCC GTG CAG GAT ACC TCC ACG CCT TAT AGC GTC TTC ATC ATC ATC

TCT CTG CTA TGC GGC TTT GCT GGC GCG AAC TTC GCA TCC AGT ATG GCA AAC

ATC AGC TTC TTC TTT CCG AAA CAG AAG CAG GGT GGC GCG CTG GGT CTG AAT

GGT GGT CTG GGA AAC ATG GGC GTC AGC GTC ATG CAG TTG GTT GCT CCG CTG

GTG GTA TCA CTG TCG ATT TTC GCA GTA TTT GGT AGC CAG GGC GTC AAA CAG

CCG GAT GGG ACT GAG CTG TAT CTG GCG AAT GCG TCC TGG ATA TGG GTG CCG

TTC CTT GCC ATC TTC ACC ATT GCG GCG TGG TTT GGC ATG AAC GAT CTT GCT

ACC TCG AAA GCC TCC ATC AAG GAG CAG TTG CCG GTA CTC AAA CGG GGT CAT

CTG TGG ATT ATG AGC CTG CTG TAT CTG GCA ACC TTC GGC TCC TTC ATC GGC

TTC TCC GCG GGC TTT GCA ATG CTG TCA AAA ACG CAG TTC CCG GAT GTT CAG

ATT CTG CAA TAC GCT TTC TTC GGG CCG TTT ATT GGT GCG CTG GCG CGT TCT

GCA GGT GGT GCA TTA TCT GAC CGT CTG GGC GGA ACT CGT GTC ACG CTG GTG

AAC TTT ATT CTG ATG GCG ATT TTC AGC GGC CTG CTG TTC CTG ACC TTA CCG

ACT GAC GGG CAG GGC GGA AGC TTC ATG GCG TTC TTC GCG GTC TTC CTG GCG

CTG TTC CTG ACA GCT GGG CTG GGT AGT GGT TCC ACT TTC CAG ATG ATT TCA

GTG ATC TTC CGT AAA CTG ACA ATG GAT CGC GTG AAA GCA GAA GGG GGT TCT

GAC GAA CGT GCG ATG CGT GAA GCG GCA ACC GAC ACG GCG GCG GCG CTG GGT

TTC ATC TCT GCG ATT GGC GCG ATT GGT GGC TTC TTT ATC CCG AAA GCG TTT

GGT AGC TCG CTG GCA TTA ACG GGT TCG CCA GTC GGC GCA ATG AAG GTA TTT

TTG ATT TTC TAT ATC GCC TGC GTA GTG ATT ACC TGG GCG GTA TAT GGT CGG

CAT TCT AAA AAA TAA

ACCGTTACTCGTCATACTTCGGGTTACATGTGCTGCGGCTGCGTTCATTCACCCCAGTCAC

TTACTTTAGTAAGCTCCTGGGATTCATTCACTTGCCGCCTTCCTGTAAACCGAATTATATA

GAGTAAAATATTTGATTATCCTTTGCGCGGCATGATGTCGCGCTTTTTTTATGCGTCATTT

AGTTACAACATACTAATGTTATATGGTTTATTTCGCCGGATTTCATTAAGAGCCATTAATA

TGTTACCCATGGGGAATACTCCTTAATACCCATCTGCATAAAAATCTTAATAGTTTAAATA

ACTACAGGTATAAAACGTCTTAATTTACAGTCTGTTATGTGGTGGCTGTTAATTATCCTAA

AGGGGTATCTTAGGAATTTACTTTATTTTTCATCCCCATCACTCTTGATCGTTATCAATTC

CCACGCTGTTTCAGAGCGTTACCTTGCCCTTAAACATTAGCAATGTCGATTTATCAGAGGG

CCGACAGGCTCCCACAGGAGAAAACCG

ATG AGT AAA TTC CTG GAC CGG TTT CGC TAC TTC AAA CAG AAG GGT GAA ACC

TTT GCC GAT GGG CAT GGC CAG CTT CTC AAT ACC AAC CGT GAC TGG GAG GAT

GGA TAT CGC CAG CGT TGG CAG CAT GAC AAA ATC GTC CGC TCT ACC CAC GGG

GTA AAC TGC ACC GGC TCC TGC AGC TGG AAA ATC TAC GTC AAA AAC GGT CTG

GTC ACC TGG GAA ACC CAG CAG ACT GAC TAT CCG CGT ACC CGT CCG GAT CTG

CCA AAC CAT GAA CCT CGC GGC TGC CCG CGC GGT GCC AGC TAC TCC TGG TAT

CTT TAC AGT GCC AAC CGC CTG AAA TAC CCG ATG ATG CGC AAA CGC CTG ATG

AAA ATG TGG CGT GAA GCG AAG GCG CTG CAT AGC GAT CCG GTT GAG GCA TGG

GCT TCT ATC ATT GAA GAC GCC GAT AAA GCG AAA AGC TTT AAG CAG GCG CGT

GGA CGC GGT GGA TTT GTT CGT TCT TCC TGG CAG GAG GTG AAC GAA CTG ATC

GCC GCA TCT AAC GTT TAC ACC ATC AAA AAC TAC GGC CCG GAC CGT GTT GCT

GGT TTC TCG CCA ATT CCG GCA ATG TCG ATG GTT TCT TAC GCA TCG GGT GCA

CGC TAT CTC TCG CTG ATT GGC GGT ACT TGC TTA AGC TTC TAC GAC TGG TAC

TGC GAC TTG CCT CCT GCG TCT CCG CAA ACC TGG GGC GAG CAA ACT GAC GTA

CCG GAA TCT GCT GAC TGG TAC AAC TCC AGC TAC ATC ATC GCC TGG GGG TCA

AAC GTG CCG CAG ACG CGT ACC CCG GAT GCT CAC TTC TTT ACT GAA GTG CGT

TAC AAA GGG ACC AAA ACT GTT GCC GTC ACA CCA GAC TAC GCT GAA ATC GCC

AAA CTG TGC GAT CTG TGG CTG GCA CCG AAA CAG GGC ACC GAT GCG GCA ATG

GCG CTG GCG ATG GGC CAC GTA ATG CTG CGT GAA TTC CAC CTC GAC AAC CCA

AGC CAG TAT TTC ACC GAC TAT GTG CGT CGC TAC ACC GAC ATG CCG ATG CTG

GTG ATG CTG GAA GAA CGC GAC GGT TAC TAC GCT GCA GGT CGT ATG CTG CGC

GCT GCT GAT CTG GTT GAT GCG CTG GGC CAG GAA AAC AAT CCG GAA TGG AAA

ACT GTC GCC TTT AAT ACC AAT GGC GAA ATG GTT GCG CCG AAC GGT TCT ATT

GGC TTC CGC TGG GGC GAG AAG GGC AAA TGG AAT CTT GAG CAG CGC GAC GGC

AAA ACT GGC GAA GAA ACC GAG CTG CAA CTG AGC CTG CTG GGT AGC CAG GAT

GAG ATC GCT GAG GTA GGC TTC CCG TAC TTT GGT GGC GAC GGC ACG GAA CAC

TTC AAC AAA GTG GAA CTG GAA AAC GTG CTG CTG CAC AAA CTG CCG GTG AAA

CGC CTG CAA CTG GCT GAT GGC AGC ACC GCC CTG GTG ACC ACC GTT TAT GAT

CTG ACG CTG GCA AAC TAC GGT CTG GAA CGT GGC CTG AAC GAC GTT AAC TGT

GCA ACC AGC TAT GAC GAT GTG AAA GCT TAT ACC CCG GCC TGG GCC GAG CAG

ATT ACC GGC GTT TCT CGC AGC CAG ATT ATT CGC ATC GCC CGT GAA TTT GCC

GAT AAC GCT GAT AAA ACG CAC GGT CGT TCG ATG ATT ATC GTC GGT GCG GGG

CTG AAC CAC TGG TAT CAC CTC GAT ATG AAC TAT CGT GGT CTG ATC AAC ATG

CTG ATT TTC TGC GGC TGT GTC GGT CAG AGC GGG GGC GGC TGG GCG CAC TAT

GTA GGT CAG GAA AAA CTG CGT CCG CAA ACC GGC TGG CAG CCG CTG GCG TTT

GCC CTT GAC TGG CAG CGT CCG GCG CGT CAC ATG AAC AGC ACT TCT TAT TTC

TAT AAC CAC TCC AGC CAG TGG CGT TAT GAA ACC GTC ACG GCG GAA GAG TTG

CTG TCA CCG ATG GCG GAC AAA TCC CGC TAT ACC GGA CAC TTG ATC GAC TTT

AAC GTC CGT GCG GAA CGC ATG GGC TGG CTG CCG TCT GCA CCG CAG TTA GGC

ACT AAC CCG CTG ACT ATC GCT GGC GAA GCG GAA AAA GCC GGG ATG AAT CCG

GTG GAC TAT ACG GTG AAA TCC CTG AAA GAG GGT TCC ATC CGT TTT GCG GCA

GAA CAA CCA GAA AAC GGT AAA AAC CAC CCG CGC AAC CTG TTC ATC TGG CGT

TCT AAC CTG CTC GGT TCT TCC GGT AAA GGT CAT GAG TTT ATG CTC AAG TAC

CTG CTG GGG ACG GAG CAC GGT ATC CAG GGT AAA GAT CTG GGG CAA CAG GGC

GGC GTG AAG CCG GAA GAA GTG GAC TGG CAG GAC AAT GGT CTG GAA GGC AAG

CTG GAT CTG GTG GTT ACG CTG GAC TTC CGT CTG TCG AGC ACC TGT CTC TAT

TCC GAC ATC ATT TTG CCG ACG GCG ACC TGG TAC GAA AAA GAC GAC ATG AAT

ACT TCG GAT ATG CAT CCG TTT ATT CAC CCG CTG TCT GCG GCG GTC GAT CCG

GCC TGG GAA GCG AAA AGC GAC TGG GAA ATC TAC AAA GCC ATC GCG AAG AAA

TTC TCC GAA GTG TGC GTC GGC CAT CTG GGT AAA GAA ACC GAC ATC GTC ACG

CTG CCT ATC CAG CAT GAC TCT GCC GCT GAA CTG GCG CAG CCG CTG GAT GTG

AAA GAC TGG AAA AAA GGC GAG TGC GAC CTG ATC CCA GGT AAA ACC GCG CCA

CAC ATT ATG GTC GTA GAG CGC GAT TAT CCG GCG ACT TAC GAA CGC TTT ACC

TCT ATC GGC CCG CTG ATG GAG AAA ATC GGT AAT GGC GGT AAA GGG ATT GCC

TGG AAC ACC CAG AGC GAG ATG GAT CTG CTG CGT AAG CTC AAC TAC ACC AAA

GCG GAA GGT CCG GCG AAA GGC CAG CCG ATG CTG AAC ACC GCA ATT GAT GCG

GCA GAG ATG ATC CTG ACA CTG GCA CCG GAA ACC AAC GGT CAG GTA GCC GTG

AAA GCC TGG GCT GCC CTG AGC GAA TTT ACC GGT CGT GAC CAT ACG CAT CTG

GCG CTG AAT AAA GAA GAC GAG AAG ATC CGC TTC CGC GAT ATT CAG GCA CAG

CCG CGC AAA ATT ATC TCC AGC CCG ACC TGG TCT GGT CTG GAA GAT GAA CAC

GTT TCT TAC AAC GCC GGT TAC ACC AAC GTT CAC GAG CTG ATC CCA TGG CGT

ACG CTC TCT GGT CGT CAG CAA CTG TAT CAG GAT CAC CAG TGG ATG CGT GAT

TTC GGT GAA AGC CTG CTG GTT TAT CGT CCG CCG ATC GAC ACC CGT TCG GTG

AAA GAA GTG ATA GGC CAG AAA TCC AAC GGC AAC CAG GAA AAA GCG CTC AAC

TTC CTG ACG CCG CAC CAG AAG TGG GGT ATC CAC TCC ACC TAC AGC GAC AAC

CTG CTG ATG CTG ACT TTA GGT CGC GGT GGT CCG GTG GTC TGG TTG AGT GAA

GCC GAT GCC AAA GAT CTG GGT ATC GCC GAT AAC GAC TGG ATT GAA GTC TTC

AAC AGC AAC GGT GCT CTG ACT GCC CGT GCG GTT GTC AGC CAG CGT GTT CCG

GCA GGG ATG ACC ATG ATG TAC CAC GCG CAG GAA CGT ATC GTT AAC CTG CCT

GGT TCG GAA ATT ACC CAA CAG CGT GGT GGT ATC CAT AAC TCG GTC ACC CGT

ATC ACG CCG AAA CCG ACG CAT ATG ATC GGC GGC TAT GCC CAT CTG GCA TAC

GGC TTT AAC TAC TAT GGC ACC GTA GGT TCT AAC CGC GAT GAG TTT GTT GTA

GTG CGT AAG ATG AAG AAC ATT GAC TGG TTA GAT GGC GAA GGC AAT GAC CAG

GTA CAG GAG AGC GTA AAA TGA

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

narK - narG sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.