nagE - glnS sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

ATG AAT ATT TTA GGT TTT TTC CAG CGA CTC GGT AGG GCG TTA CAG CTC CCT

ATC GCG GTG CTG CCG GTG GCG GCA CTG TTG CTG CGA TTC GGT CAG CCA GAT

TTA CTT AAC GTT GCG TTT ATT GCC CAG GCG GGC GGT GCG ATT TTT GAT AAC

CTC GCA TTA ATC TTC GCC ATC GGT GTG GCA TCC AGC TGG TCG AAA GAC AGC

GCT GGT GCG GCG GCG CTG GCG GGT GCG GTA GGT TAC TTT GTG TTA ACC AAA

GCG ATG GTG ACC ATC AAC CCA GAA ATT AAC ATG GGT GTA CTG GCG GGT ATC

ATT ACC GGT CTG GTT GGT GGC GCA GCC TAT AAC CGT TGG TCC GAT ATT AAA

CTG CCG GAC TTC CTG AGC TTC TTC GGC GGC AAA CGC TTT GTG CCG ATT GCC

ACC GGA TTC TTC TGC CTG GTG CTG GCG GCC ATT TTT GGT TAC GTC TGG CCG

CCG GTA CAG CAC GCT ATC CAT GCA GGC GGC GAG TGG ATC GTT TCT GCG GGC

GCG CTG GGT TCC GGT ATC TTT GGT TTC ATC AAC CGT CTG CTG ATC CCA ACC

GGT CTG CAT CAG GTA CTG AAC ACC ATC GCC TGG TTC CAG ATT GGT GAA TTC

ACC AAC GCG GCG GGT ACG GTT TTC CAC GGT GAC ATT AAC CGC TTC TAT GCC

GGT GAC GGC ACC GCG GGG ATG TTC ATG TCC GGC TTC TTC CCG ATC ATG ATG

TTC GGT CTG CCG GGT GCG GCG CTG GCG ATG TAC TTC GCA GCA CCG AAA GAG

CGT CGT CCG ATG GTT GGC GGT ATG CTG CTT TCT GTT GCT GTT ACT GCG TTC

CTG ACC GGT GTG ACT GAG CCG CTG GAA TTC CTG TTC ATG TTC CTT GCT CCG

CTG CTG TAC CTC CTG CAC GCA CTG CTG ACC GGT ATC AGC CTG TTT GTG GCA

ACG CTG CTG GGT ATC CAC GCG GGC TTC TCT TTC TCT GCG GGG GCT ATC GAC

TAC GCG TTG ATG TAT AAC CTG CCG GCC GCC AGC CAG AAC GTC TGG ATG CTG

CTG GTG ATG GGC GTT ATC TTC TTC GCT ATC TAC TTC GTG GTG TTC AGT TTG

GTT ATC CGC ATG TTC AAC CTG AAA ACG CCG GGT CGT GAA GAT AAA GAA GAC

GAG ATC GTT ACT GAA GAA GCC AAC AGC AAC ACT GAA GAA GGT CTG ACT CAA

CTG GCA ACC AAC TAT ATT GCT GCG GTT GGC GGC ACT GAC AAC CTG AAA GCG

ATT GAC GCC TGT ATC ACC CGT CTG CGC CTT ACA GTG GCT GAC TCT GCC CGC

GTT AAC GAT ACG ATG TGT AAA CGT CTG GGT GCT TCT GGG GTA GTG AAA CTG

AAC AAA CAG ACT ATT CAG GTG ATT GTT GGC GCG AAA GCA GAA TCC ATC GGC

GAT GCG ATG AAG AAA GTC GTT GCC CGT GGT CCG GTA GCC GCT GCG TCA GCT

GAA GCA ACT CCG GCA ACT GCC GCG CCT GTA GCA AAA CCG CAG GCT GTA CCA

AAC GCG GTA TCT ATC GCG GAG CTG GTA TCG CCG ATT ACC GGT GAT GTC GTG

GCA CTG GAT CAG GTT CCT GAC GAA GCA TTC GCC AGC AAA GCG GTG GGT GAC

GGT GTG GCG GTG AAA CCG ACA GAT AAA ATC GTC GTA TCA CCA GCC GCA GGG

ACA ATC GTG AAA ATC TTC AAC ACC AAC CAC GCG TTC TGC CTG GAA ACC GAA

AAA GGC GCG GAG ATC GTC GTC CAT ATG GGT ATC GAC ACC GTA GCG CTG GAA

GGT AAA GGC TTT AAA CGT CTG GTG GAA GAG GGT GCG CAG GTA AGC GCA GGG

CAA CCG ATT CTG GAA ATG GAT CTG GAT TAC CTG AAC GCT AAC GCC CGC TCG

ATG ATT AGC CCG GTG GTT TGC AGC AAT ATC GAC GAT TTC AGT GGC TTG ATC

ATT AAA GCT CAG GGC CAT ATT GTG GCG GGT CAA ACA CCG CTG TAT GAA ATC

AAA AAG TAA

TCTGCTTTATGCCTGATGCGACGCTTGAGCGTCGCATCCAACAATGACAAGCGGTGGAGAT

CTTCTCTGCCGCTTTTTTTTTCATCAATCATCCCCATAATCCTTGTTAGATTATCAATTTT

AAAAAACTAACAGTTGTCAGCCTGTCCCGCTTATAAGATCATACGCCGTTATACGTTGTTT

ACGCTTTGAGGAATCCACG

ATG AGT GAG GCA GAA GCC CGC CCG ACT AAC TTT ATC CGT CAG ATC ATC GAT

GAA GAT CTG GCC AGT GGT AAG CAC ACC ACA GTA CAC ACC CGT TTC CCG CCG

GAG CCG AAT GGC TAT CTG CAT ATT GGC CAT GCG AAA TCT ATC TGC CTG AAC

TTC GGG ATC GCC CAG GAC TAT AAA GGC CAG TGC AAC CTG CGT TTC GAC GAC

ACT AAC CCG GTA AAA GAA GAT ATC GAG TAT GTT GAG TCG ATC AAA AAC GAC

GTA GAG TGG TTA GGT TTT CAC TGG TCT GGT AAC GTC CGT TAC TCC TCC GAT

TAT TTT GAT CAG CTC CAC GCC TAT GCG ATC GAA CTG ATC AAT AAA GGC CTG

GCG TAC GTT GAT GAA CTG ACG CCG GAA CAG ATC CGC GAA TAC CGC GGC ACC

CTG ACG CAA CCG GGT AAA AAC AGC CCG TAC CGC GAC CGC AGC GTT GAA GAG

AAC CTG GCG CTG TTC GAA AAA ATG CGT GCC GGT GGT TTT GAA GAA GGT AAA

GCC TGC CTG CGT GCG AAA ATC GAC ATG GCT TCA CCG TTT ATC GTG ATG CGC

GAT CCG GTG CTG TAC CGT ATT AAA TTT GCT GAA CAC CAC CAG ACT GGC AAC

AAG TGG TGC ATC TAC CCG ATG TAC GAC TTC ACC CAC TGC ATC AGC GAT GCC

CTG GAA GGT ATT ACG CAC TCT CTG TGT ACG CTT GAG TTC CAG GAC AAC CGT

CGT CTG TAC GAC TGG GTA CTG GAC AAC ATC ACG ATT CCT GTT CAC CCG CGC

CAG TAT GAG TTC TCG CGC CTG AAT CTG GAA TAC ACC GTG ATG TCC AAG CGT

AAG TTG AAC CTG CTG GTG ACC GAC AAG CAC GTT GAA GGC TGG GAT GAC CCG

CGT ATG CCG ACC ATT TCC GGT CTG CGT CGT CGT GGT TAC ACT GCG GCT TCT

ATT CGT GAG TTC TGC AAA CGC ATC GGC GTG ACC AAG CAG GAC AAC ACC ATT

GAG ATG GCG TCG CTG GAA TCC TGC ATC CGT GAA GAT CTC AAC GAA AAT GCG

CCG CGC GCA ATG GCG GTT ATC GAT CCG GTG AAA CTG GTT ATC GAA AAC TAT

CAG GGC GAA GGC GAA ATG GTT ACC ATG CCG AAC CAT CCG AAC AAA CCG GAA

ATG GGC AGC CGT CAG GTG CCG TTT AGC GGT GAG ATT TGG ATT GAT CGC GCC

GAT TTC CGC GAA GAA GCT AAC AAG CAG TAC AAA CGT CTG GTG CTG GGT AAA

GAA GTG CGT CTG CGT AAT GCT TAT GTG ATT AAG GCA GAA CGC GTC GAG AAA

GAT GCC GAA GGT AAT ATC ACC ACC ATC TTC TGT ACT TAT GAC GCC GAT ACC

TTA AGC AAA GAT CCG GCA GAT GGT CGT AAA GTC AAA GGT GTT ATT CAC TGG

GTG AGC GCG GCA CAT GCG CTG CCG GTT GAA ATC CGT TTG TAT GAC CGT CTG

TTC AGC GTG CCT AAC CCA GGT GCT GCG GAT GAT TTC CTG TCG GTG ATT AAC

CCG GAA TCG CTG GTG ATC AAA CAG GGC TTT GCT GAA CCG TCG CTG AAA GAT

GCG GTT GCG GGT AAA GCA TTC CAG TTT GAG CGT GAA GGT TAC TTC TGC CTC

GAT AGC CGC CAT TCT ACG GCG GAA AAA CCG GTA TTT AAC CGC ACC GTT GGG

CTG CGT GAT ACC TGG GCG AAA GTA GGC GAG TAA

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

nagE - glnS sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.