S. typhimurium mviM - mviN sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

GTG AGA ACA TTA CGG ATT GGC ATT GTC GGG TTA GGC GGT ATT GCG CAG AAG

GCC TGG CTG CCG GTA TTA ACC AAC ACC GCC GGA TGG ACG TTA CAG GGC GCC

TGG TCT CCT TCG CGG GAT AAA GCC TTA CGT ATT TGC GAA AGC TGG CGC ATA

CCG TAT GTG GAT TCG CTG GCG AAT TTA GCG TCC AGC TGC GAT GCG GTC TTT

GTC CAC TCC AGT ACC GCA AGC CAT TAT GCC GTG GTC AGC GAA CTT CTC AAT

GCC GGC GTC CAT GTC TGC GTG GAT AAA CCG CTG GCG GAA AAT CTA CGT GAT

GCC GAA CGG CTG GTG GCG CTG GCG GCG CAA AAA AAA TTG ACG CTG ATG GTT

GGC TTT AAT CGC CGT TTC GCG CCG CTG TAC CGC GAA CTG AAG ACG CGC CTC

GGC ACT GCG GCG TCA CTA CGT ATG GAT AAA CAT CGT ACC GAT AGC GTC GGG

CCG CAC GAC TTA CGT TTT ACT TTG CTG CAT GAC TAT CTG CAT GTC GTG GAT

ACC GCT CTG TGG CTG GCG GGC GGC GAG GCG CGC CTT GCC AGC GGC ACG TTG

CTC ACC AGC GAG TCC GGC GGA ATG TGC TAT GCG GAA CAT CAT TTT TCC GCC

GAC AAA CTA CAA ATT ACC ACC AGT ATG CAC CGG CGC GCC GGA AGT CAG CGT

GAA TCG GTC CAG GCC GTC ACC GAC GGC GGG CTA TAT GAC GTG ACG GAT ATG

CGT GAA TGG CGC GAA GAG CGC GGG CAG GGT ATT CTC ATC AAA CCC ATT CCT

AGT TGG CAA ACG ACG CTT GAA CAG CGT GGT TTT GTC GGA TGC GCG CGG CAT

TTC ATT GAC TGC GTA CAA AAT CAG ACG GTT CCG GAA ACG GCG GGG GAG CAG

GCG ATT TTG GCC CAG CGC GTC GTG GAG GCG CTG TGG CGG GAC GCC ATC AGC

GAA TAA

CCCTCTGTAACATCTGGCGGTAGTAATTCATCGTAATCCAGGTACTATACCCTCAATAATT

CGAGTTGCAGAAAAGCTAACGCACATGCAGCTCGAAGTATGGCGGGTATATATGCCCACTC

TACACAATACCTCTTTTCACAGTGAATAATGGCAAACCGTGGGGAGTCTGTAAGGCCTGAT

AAGACGTTTTAACGTCGCCGTCAGGCGCGGTGATACAGCCGGATACGGCAGAAGTTGCGTT

ATCCGGTCGATGGATCAGCC

ATG CAG GAG TTT TAC GCC AGG GTC TGG AAT ACA AAA GAA ATG AAT TTA TTG

AAA TCG CTG GCT GCC GTC AGC TCG ATG ACT ATG TTT TCA CGC GTG TTG GGC

TTT GCC CGT GAT GCG ATT GTC GCC AGA ATT TTT GGC GCA GGG ATG GCG ACC

GAC GCC TTT TTT GTG GCG TTT AAA CTC CCT AAT TTA CTA CGC CGG ATC TTT

GCC GAA GGC GCT TTT TCT CAG GCC TTT GTG CCT ATC CTG GCG GAA TAT AAG

AGC AAG CAG GGT GAA GAA GCG ACG CGG ATC TTT GTC GCT TAC GTT TCC GGC

CTG TTG ACG CTG GCA TTG GCC GTC GTG ACG GTG GCC GGT ATG CTG GCC GCC

CCG TGG GTG ATT ATG GTA ACC GCG CCG GGT TTT GCC GAT ACT GCG GAT AAA

TTC GCG CTG ACG ACG CAA CTG CTG CGG ATT ACA TTT CCC TAT ATT CTG CTG

ATC TCG CTG GCT TCA CTG GTT GGC GCC ATT CTC AAC ACC TGG AAT CGC TTC

TCT ATT CCC GCT TTT GCG CCG ACA TTT CTT AAT ATC AGC ATG ATC GGT TTT

GCA TTA TTC GCC GCG CCA TAC TTT AAT CCG CCG GTG CTG GCG TTA GCC TGG

GCA GTC ACC GTT GGC GGC GTG CTG CAA CTG GTG TAT CAA CTT CCG TAT TTG

AAA AAG ATC GGT ATG CTG GTG CTG CCG CGC ATT AAC TTT CGC GAC ACC GGG

GCG ATG CGG GTG GTC AAA CAG ATG GGG CCG GCG ATT TTG GGC GTT TCC GTC

AGT CAG ATC TCC CTT ATC ATC AAT ACC ATT TTC GCC TCG TTT CTG GCC TCC

GGC TCG GTC TCA TGG ATG TAC TAT GCC GAT CGG TTG ATG GAG TTC CCG TCC

GGC GTG CTG GGC GTG GCG TTG GGG ACC ATC TTG TTG CCG TCA TTG TCG AAA

AGC TTT GCC AGC GGC AAT CAT GAT GAG TAC TGC CGC CTG ATG GAC TGG GGG

CTG CGT TTG TGC TTT TTA CTG GCG TTG CCG AGC GCG GTA GCG TTA GGC ATT

CTG GCG AAG CCG CTG ACG GTC TCG CTG TTT CAG TAC GGT AAA TTC ACC GCC

TTT GAT GCG GCG ATG ACG CAG CGG GCG TTA ATC GCC TAT TCG GTG GGG CTG

ATT GGC TTG ATC GTC GTA AAA GTG CTG GCT CCG GGC TTC TAT TCT CGC CAG

GAT ATT AAA ACG CCG GTG AAA ATC GCC ATA GTG ACG TTA ATC ATG ACG CAG

TTA ATG AAC CTG GCG TTT ATT GGA CCG CTG AAA CAC GCC GGG CTG TCG CTC

TCT ATT GGT TTG GCG GCA TGT CTC AAT GCG TCG CTG CTG TAC TGG CAA CTG

CGC AAA CAG AAT ATC TTT ACG CCA CAA CCG GGC TGG ATG TGG TTC CTG ATG

CGT CTG ATC ATT TCC GTA CTG GTG ATG GCC GCC GTA TTG TTC GGC GTG TTG

CAT ATT ATG CCG GAG TGG TCG CAA GGG TCG ATG CTA TGG CGT TTG CTG CGT

TTG ATG GCG GTA GTG ATC GCG GGT ATC GCG GCC TAT TTC GCC GCG CTT GCC

GTG CTG GGC TTT AAA GTG AAA GAG TTT GTT CGC CGG ACG GCG TAA

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

S. typhimurium mviM - mviN sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.