mhpE - mhpT sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

ATG AAC GGT AAA AAA CTT TAT ATC TCG GAC GTC ACA TTG CGT GAC GGT ATG

CAC GCC ATT CGT CAT CAG TAT TCG CTG GAA AAC GTT CGC CAG ATT GCC AAA

GCA CTG GAC GAT GCC CGC GTG GAT TCG ATT GAA GTG GCC CAC GGC GAC GGT

TTG CAA GGT TCC AGC TTT AAC TAT GGT TTC GGC GCA CAT AGC GAC CTT GAA

TGG ATT GAA GCG GCG GCG GAT GTG GTG AAG CAC GCC AAA ATC GCG ACG TTG

TTG CTG CCA GGA ATC GGC ACT ATT CAC GAT CTG AAA AAT GCC TGG CAG GCT

GGC GCG CGG GTG GTT CGT GTG GCA ACG CAC TGT ACC GAA GCT GAT GTT TCC

GCC CAG CAT ATT CAG TAT GCC CGC GAG CTC GGA ATG GAC ACC GTT GGT TTT

CTG ATG ATG AGC CAT ATG ACC ACG CCG GAG AAT CTC GCC AAG CAG GCA AAG

CTG ATG GAA GGC TAC GGT GCG ACC TGT ATT TAT GTG GTG GAT TCT GGC GGT

GCG ATG AAC ATG AGC GAT ATC CGT GAC CGT TTC CGC GCC CTG AAA GCA GAG

CTG AAA CCA GAA ACG CAA ACT GGC ATG CAC GCT CAC CAT AAC CTG AGT CTT

GGC GTG GCG AAC TCT ATC GCG GCG GTG GAA GAG GGC TGC GAC CGA ATC GAC

GCC AGC CTC GCG GGA ATG GGC GCG GGC GCA GGT AAC GCA CCG CTG GAA GTG

TTT ATT GCC GCC GCG GAT AAA CTG GGC TGG CAG CAT GGG ACC GAT CTC TAT

GCG TTA ATG GAT GCC GCC GAC GAC CTG GTG CGT CCG TTG CAG GAT CGA CCG

GTA CGA GTC GAT CGC GAA ACG CTG GCG CTG GGA TAC GCT GGT GTT TAC TCG

AGC TTC CTG CGT CAC TGT GAA ACG GCG GCG GCG CGT TAT GGC TTA AGT GCG

GTG GAT ATT CTC GTT GAG CTG GGC AAA CGC CGG ATG GTT GGC GGC CAG GAG

GAT ATG ATC GTT GAC GTG GCG CTG GAT CTG CGC AAC AAC AAA TAA

TGATGACTGCCGAGAACGTGCATTTTGTATGCCCATCCCAGCACGACTGCCGGATGCGGCG

TGAACGCCTTATCCGGCCTACGGATGGCGTGAGAATTTGTAGGTCTGATAAGACGCGTTAG

CGTCGCATCAGGCATCTGCGCACGACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTAC

GGATGGCGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGTTAGCGTCGCATCAGGCATCTGCGC

ACGACTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGTGGCGCGAGAATTTGTAG

GCCTGATAAGACGCGTTAGCGTCGCATCAGGCATCTGCGCACGACTGCCGGATGCGGCGTA

AACGCCTTATCCGGCCTACGGATGGCGCGGGAATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGTTAGCG

TCGCATCAGGCATCTGCACACGACTGCCGGATGCGATAAACGTCTTGTCCGGCCTACATTT

CGCCCGTAGGCAGTCATTAAATAGTTCTGATTACGCGGCTGGCA

ATG TAT CAG TCG CGA TTC ACC TGC ACT CGC AAC GAG GTT CAT CTT ATG TCG

ACT CGT ACC CCT TCA TCA TCT TCA TCC CGC CTG ATG CTG ACC ATC GGG CTT

TGT TTT TTG GTC GCT CTG ATG GAA GGG CTG GAT CTT CAG GCG GCT GGC ATT

GCG GCG GGT GGC ATC GCC CAG GCT TTC GCA CTC GAT AAA ATG CAA ATG GGC

TGG ATA TTT AGC GCC GGA ATA CTC GGT TTG CTA CCC GGC GCG TTG GTT GGC

GGA ATG CTG GCG GAC CGT TAT GGT CGC AAG CGC ATT TTG ATT GGC TCA GTT

GCG CTG TTT GGT TTG TTC TCA CTG GCA ACG GCG ATT GCC TGG GAT TTC CCC

TCA CTG GTC TTT GCG CGG CTG ATG ACC GGT GTC GGG CTG GGG GCG GCG TTG

CCG AAT CTT ATC GCC CTG ACG TCT GAA GCC GCG GGT CCA CGT TTT CGT GGG

ACG GCA GTG AGC CTG ATG TAT TGC GGT GTT CCC ATT GGC GCG GCG CTG GCG

GCG ACA CTG GGT TTC GCG GGG GCA AAC TTA GCA TGG CAA ACG GTG TTT TGG

GTA GGT GGT GTG GTG CCG TTG ATT CTG GTG CCG CTA TTA ATG CGC TGG CTG

CCG GAG TCG GCG GTT TTC GCT GGC GAA AAA CAG TCT GCG CCA CCA CTG CGT

GCC TTA TTT GCG CCA GAA ACG GCA ACC GCG ACG CTG CTG CTG TGG TTG TGT

TAT TTC TTC ACT CTG CTG GTG GTC TAC ATG TTG ATC AAC TGG CTA CCG CTA

CTT TTG GTG GAG CAA GGA TTC CAG CCA TCG CAG GCG GCA GGG GTG ATG TTT

GCC CTG CAA ATG GGG GCG GCA AGC GGG ACG TTA ATG TTG GGC GCA TTG ATG

GAT AAG CTG CGT CCA GTA ACC ATG TCG CTA CTG ATT TAT AGC GGC ATG TTA

GCT TCG CTG CTG GCG CTT GGA ACG GTG TCG TCA TTT AAC GGT ATG TTG CTG

GCG GGA TTT GTC GCG GGG TTG TTT GCG ACA GGT GGG CAA AGC GTT TTG TAT

GCC CTG GCA CCG TTG TTT TAC AGT TCG CAG ATC CGC GCA ACA GGT GTG GGA

ACA GCC GTG GCG GTA GGG CGT CTG GGG GCT ATG AGC GGT CCG TTA CTG GCC

GGG AAA ATG CTG GCA TTA GGC ACT GGC ACG GTC GGC GTA ATG GCC GCT TCT

GCA CCG GGT ATT CTT GTT GCT GGG TTG GCG GTG TTT ATT TTG ATG AGC CGG

AGA TCA CGA ATA CAG CCG TGC GCC GAT GCC TGA

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

mhpE - mhpT sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.