mgtA - yjgF sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.
Direct repeats bracketing BIMEs are underlined.

ATG TTT AAA GAA ATT TTT ACC CGG CTC ATT CGC CAT TTA CCT TCC CGT CTG

GTT CAT CGT GAT CCA TTG CCT GGC GCG CAG CAG ACA GTG AAT ACG GTG GTC

CCG CCG TCC TTA AGT GCG CAT TGC CTG AAA ATG GCG GTG ATG CCC GAA GAA

GAA TTG TGG AAA ACG TTC GAC ACC CAT CCG GAA GGG TTA AAT CAG GCG GAA

GTG GAA TCT GCC CGC GAA CAA CAT GGT GAA AAT AAA TTA CCC GCA CAA CAA

CCG TCG CCG TGG TGG GTA CAT TTA TGG GTC TGC TAT CGC AAC CCC TTT AAT

ATT TTA CTC ACC ATT CTC GGC GCT ATT TCT TAC GCC ACG GAA GAT TTA TTT

GCT GCG GGC GTT ATC GCG CTA ATG GTC GCT ATT TCT ACG TTG CTG AAC TTT

ATT CAG GAA GCA CGT TCC ACT AAA GCG GCA GAT GCC CTG AAA GCG ATG GTC

AGC AAT ACT GCG ACG GTG CTG CGC GTA ATT AAC GAC AAA GGC GAA AAT GGC

TGG CTG GAG ATC CCG ATC GAC CAG CTG GTG CCC GGC GAT ATT ATA AAA CTG

GCG GCG GGA GAT ATG ATC CCG GCA GAT TTA CGT ATC TTG CAG GCG CGG GAT

CTG TTC GTC GCT CAG GCG TCG TTA ACC GGT GAG TCT CTG CCC GTA GAA AAA

GCC GCT ACC ACT CGC CAG CCG GAG CAC AGC AAT CCG CTG GAG TGC GAC ACG

CTG TGT TTT ATG GGC ACC ACC GTG GTG AGC GGC ACG GCA CAA GCA ATG GTG

ATT GCT ACA GGT GCC AAT ACC TGG TTT GGT CAA CTG GCG GGG CGT GTT AGT

GAG CAG GAA AGC GAG CCG AAT GCC TTT CAG CAA GGG ATC AGC CGC GTC AGT

ATG CTG CTG ATT CGC TTT ATG CTG GTG ATG GCA CCG GTG GTG CTG TTA ATC

AAT GGT TAC ACC AAA GGC GAC TGG TGG GAA GCG GCG CTG TTT GCG CTT TCG

GTC GCG GTA GGC CTA ACG CCG GAA ATG TTG CCG ATG ATT GTT ACC TCG ACG

CTG GCG CGC GGC GCA GTA AAG CTG TCG AAA CAG AAA GTG ATC GTC AAA CAT

CTG GAT GCT ATT CAG AAC TTT GGC GCA ATG GAT ATT CTG TGC ACT GAT AAA

ACC GGC ACC CTG ACG CAG GAT AAA ATT GTG CTG GAG AAT CAT ACC GAT ATC

TCC GGT AAA ACC AGC GAA CGC GTG CTG CAT AGC GCG TGG TTG AAC AGT CAT

TAT CAG ACC GGA CTT AAA AAC CTG CTC GAT ACA GCG GTG CTC GAA GGT ACG

GAT GAA GAG TCA GCG CGC TCG CTG GCC AGT CGT TGG CAA AAA ATT GAT GAG

ATT CCG TTT GAT TTC GAG CGT CGC CGG ATG TCG GTG GTA GTG GCA GAA AAT

ACC GAG CAC CAT CAG CTG GTT TGC AAA GGT GCA TTG CAG GAA ATC CTC AAT

GTG TGT TCG CAG GTG CGT CAC AAT GGC GAG ATT GTG CCG CTC GAT GAC ATC

ATG CTG CGT AAG ATT AAG CGG GTT ACT GAT ACG CTG AAT CGT CAG GGG CTG

CGC GTG GTT GCG GTG GCG ACG AAA TAC CTG CCA GCG CGT GAA GGA GAT TAC

CAG CGG GCG GAT GAA TCC GAC CTG ATC CTC GAA GGA TAT ATT GCT TTT CTT

GAT CCG CCA AAA GAG ACA ACC GCT CCG GCA CTG AAG GCA TTA AAA GCG AGT

GGA ATT ACC GTA AAA ATC CTT ACT GGC GAC AGT GAG TTA GTT GCA GCG AAA

GTG TGC CAT GAA GTG GGG CTG GAC GCG GGA GAG GTG GTC ATT GGT AGT GAT

ATT GAA ACG CTA TCT GAC GAC GAA CTG GCA AAT CTT GCA CAG CGT ACC ACG

CTG TTT GCC CGC CTG ACG CCG ATG CAT AAA GAA CGC ATT GTG ACC TTA CTG

AAG CGC GAA GGG CAT GTG GTT GGC TTT ATG GGC GAT GGT ATT AAT GAT GCG

CCC GCC TTA CGC GCT GCG GAT ATC GGC ATT TCT GTG GAC GGC GCG GTA GAT

ATT GCC CGT GAA GCG GCT GAT ATC ATC CTG CTG GAA AAA AGC CTG ATG GTG

CTG GAA GAG GGG GTT ATT GAG GGA CGT CGC ACT TTC GCC AAC ATG CTG AAA

TAC ATC AAA ATG ACG GCG AGC TCT AAC TTC GGT AAT GTG TTC AGC GTG CTG

GTA GCG AGT GCT TTC TTG CCC TTC CTG CCG ATG TTG CCG TTA CAC TTG CTT

ATT CAG AAC CTG CTG TAC GAT GTG TCA CAG GTG GCG ATC CCG TTT GAT AAC

GTC GAC GAC GAG CAA ATT CAA AAG CCG CAG CGT TGG AAT CCG GCG GAT CTG

GGG CGC TTT ATG ATC TTC TTC GGA CCG ATC AGC TCG ATC TTC GAT ATT TTG

ACG TTT TGC CTG ATG TGG TGG GTA TTC CAT GCC AAC ACG CCG GAA ACG CAA

ACG CTG TTC CAG TCG GGA TGG TTT GTG GTG GGC TTA CTG TCG CAA ACG CTG

ATT GTG CAT ATG ATC CGC ACC CGC CGT GTG CCG TTT ATT CAG AGC TGT GCA

TCG TGG CCG TTA ATG ATC ATG ACC GTG ATC GTG ATG ATT GTC GGG ATC GCA

TTG CCG TTT TCA CCG CTG GCC AGT TAT CTG CAA TTA CAG GCG CTG CCG TTA

AGC TAT TTC CCG TGG CTG GTT GCG ATT CTG GCA GGG TAT ATG ACA TTA ACC

CAG TTG GTG AAA GGG TTC TAT AGC CGT CGT TAC GGC TGG CAA TAA

AGAATAAACTGGGCACGATAGCCCCGATTCAGATTGTAGACAAAGTGAGTTTTGTTCATGC

CGGATGCGGCGTAAATGCCTTATCCGGCCAACAAATTCAATAAATTGCAGGAATCACGTAG

GCCTGATAAGCGTAGCGCATCAGGCGATTTTGCGTTTGTCATCAGACTTAATCCGGGCATG

ATAGCCCGGATTTCCATCAAGA

TTA GCG ACG AAC AGC GAT CGC TTC GAT CTC AAT CTT CAC GTC TTT CGG CAG

ACG GGC AAC TTC AAC GCA AGA ACG TGC CGG GAA GGT GGC GTT GTG TTC GGT

GAA GAA GGC TTC GTA AGT GGC GTT TAC GGT TGC GAA GTC GTT CAG ATC TTT

TAC AAA CAC GGT AGT TTT AAC GAT GTC GCC CAC TTT CAG GCC AGC GGC TTC

GAC GAT CGC TTT TAC GTT ATC CAG CGA CTG ACG TGC CTG TGC AGC GAC GTC

TGC CGG TAC TTC GCC CGT TTT CGG ATT TAC CGG GAT CTG ACC GGA GGT GAT

GAT CAT ATT GCC CAG ATC AAC GCC CTG TAC GTA AGG ACC GAT AGC TGC CGG

TGC ATT TTC CGT CGC GAT AGT TTT GCT CAT GAT TTC TCC TTT ATT ACA GCG

GTA AAA AGT CTG GCT CAT

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

mgtA - yjgF sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats. Direct repeats bracketing BIMEs are underlined.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.
Direct repeats bracketing BIMEs are underlined.