melB - yjdF sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

ATG ACT ACA AAA CTC AGT TAT GGA TTT GGA GCG TTC GGG AAG GAT TTT GCG

ATC GGC ATT GTG TAT ATG TAC CTC ATG TAT TAC TAC ACC GAT GTC GTC GGG

CTG TCT GTG GGT TTG GTC GGT ACT TTG TTT CTG GTG GCG AGG ATC TGG GAT

GCT ATT AAC GAT CCG ATT ATG GGA TGG ATT GTA AAT GCT ACG CGA TCG CGA

TGG GGT AAG TTC AAA CCC TGG ATC CTG ATC GGT ACG TTG GCA AAC TCT GTA

ATC TTA TTT CTC CTC TTT AGT GCG CAT CTG TTT GAA GGT ACT ACT CAG ATT

GTC TTT GTT TGC GTG ACC TAC ATC CTC TGG GGC ATG ACT TAC ACC ATT ATG

GAT ATT CCC TTC TGG TCG CTG GTT CCA ACC ATC ACG CTC GAT AAA CGT GAG

CGC GAA CAA CTG GTT CCT TAT CCG CGT TTT TTT GCC AGT CTG GCA GGC TTT

GTT ACG GCA GGT GTG ACG CTA CCA TTT GTT AAT TAT GTC GGC GGT GGC GAT

CGG GGA TTT GGC TTT CAG ATG TTC ACT CTG GTA CTG ATC GCC TTT TTT ATT

GTT TCA ACC ATC ATC ACT CTG CGC AAT GTG CAT GAA GTC TTT TCG TCA GAC

AAT CAA CCG TCT GCT GAA GGA AGC CAT CTG ACA CTT AAA GCC ATC GTT GCG

CTA ATT TAT AAA AAC GAT CAG CTT TCA TGC CTC TTG GGT ATG GCT CTT GCT

TAT AAT GTA GCC AGC AAC ATT ATT ACC GGC TTT GCT ATC TAT TAT TTC TCA

TAT GTT ATC GGT GAT GCG GAT TTG TTC CCC TAT TAT CTG TCG TAT GCG GGA

GCT GCT AAC CTG GTG ACG TTA GTA TTC TTC CCA CGC TTA GTT AAA TCA TTA

TCC CGA CGC ATT TTA TGG GCC GGA GCA TCT ATT CTT CCG GTG TTA AGC TGT

GGT GTT CTC CTG TTA ATG GCA TTA ATG AGC TAT CAC AAC GTC GTC CTC ATT

GTG ATT GCG GGT ATT TTG CTG AAT GTG GGA ACG GCG CTT TTC TGG GTA TTA

CAG GTC ATC ATG GTG GCA GAT ATC GTT GAT TAC GGT GAA TAT AAA CTG CAC

GTA CGC TGT GAA AGT ATC GCT TAC TCC GTG CAG ACT ATG GTG GTG AAG GGC

GGT TCA GCC TTT GCG GCT TTT TTC ATT GCG GTT GTG TTA GGG ATG ATT GGC

TAT GTA CCG AAT GTT GAA CAG TCT ACG CAA GCC CTA TTA GGT ATG CAG TTT

ATT ATG ATT GCT CTA CCA ACT CTG TTT TTC ATG GTA ACG CTG ATT CTC TAC

TTC CGT TTC TAT CGC CTC AAT GGT GAC ACG CTG CGC AGG ATC CAG ATC CAT

CTG CTG GAT AAA TAT CGC AAA GTA CCG CCC GAG CCT GTT CAT GCT GAT ATT

CCG GTC GGT GCA GTG AGT GAT GTG AAA GCC TGA

CGTGGACAATAGCTAACGAAAATGGCCTGATGCGATATGTTTATCAGGCCACGTCTTAATG

TAATGCTTTGGATTTGCAAATTTTGTAGACCGGATAAGGAATTCACGCCGCATCCGGCATC

AACAAAGCGCAAGTTG

TTA TCC GGT TAT CAA GCC AAA GCG CCG TAG CTG GCG GCA ATG AAA GCG AGC

GAG GAA TAT CAC CGT CGT TAA TGC GCC AAG CAG CGC GCA GAA CAT ATC GGA

TTG CGT GTC CCA CTG GTC GCC CTG GGT GCC GAG AAA ATC ATC CGC TCC CTG

ACC CAT TGC CAG CGC TGC CCA CCA CTC GAT TAA TTC ATA CAT CGC GCT TAT

CGC CAG CGC CAC GCA GCA GAC CAG GAA CGC CAC CAT TTT ACG TCC GCG CAC

GTA CAT CCC GCG AAC GAG AAT TTC TCG TGC CAC CAG TGC AGG CAC CAG CCC

CTG GAA AAA GTG CCC CAG CTT GTC ATA CGG ATT ACG ACT CAA CCC CAG CCA

TTC CTG CAC CTC AAA ACC AAC GGG GAC TTT CGC GTA GGT GTA TTG TCC GCC

GAC CAT CAG GAT GAT GGC GTG AAG GAA AAT GAG CGT ATA GAG CAG CGG CGT

TAA CGG ATA ACG TCT GGC GGT GGC AAG CAG TAG CTG CAC GAC AAT AAT CAC

CGG TGT CAC TTC CAT CAG CCA GGT GAG TTT GTC ATG GGC CGA AAT GCC GGT

ATA AAT CAG GAT TAA CGT TAG CGT CAG TGC GCT GGT GTT AAG AAT TAA CGG

CTT GAG TGT GCG GGT CAT

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

melB - yjdF sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.