E. coli W hpaC - cts1 sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

ATG CAA TTA GAT GAA CAA CGC CTG CGC TTT CGT GAC GCA ATG GCC AGC CTG

TCG GCA GCG GTA AAT ATT ATC ACC ACC GAG GGC GAC GCG GAC AAT GCG GGA

TTA CGG CAA CGG CCG TCT TGC TCG GTC ACG GAT ACA CCA CCA TCG CTG ATG

GTG TGC ATT AAC GCC AAC AGT GCG ATG AAC CCG GTT TTT CAG GGC AAC GGT

AAG TTG TGC GTC AAC GTC CTC AAC CAT GAG CAG GAA GTG ATG GCA CGC CAC

TTC GCG GGC ATG ACA GGC ATG GCG ATG GAA GAG CGT TTT AGC CTC TCA TGC

TGG CAA AAA GGT CCG CTG GCG CAG CCG GTG CTA AAA GGT TCG CTG GCC AGT

CTT GAA GGT GAG ATC CGC GAT GTG CAG GCA ATT GGC ACA CAT CTG GTG TAT

CTG GTG GAG ATT AAA AAC ATC ATC CTC AGT GCA GAA GGT CAC GGA CTT ATC

TAC TTT AAA CGC CGT TTC CAT CCG GTG ATG CTG GAA ATG GAA GCT GCG ATT

TAA

GCTCCAGCCCCTTCACGCATTCGTCGAAGGGGCATTTTTATTGTGATCTCAATCACATATC

CACCCGATGAATAATTCTTGCCCAACCGTCACCGCCATTCCTGACCGCTTACATCCCTAAA

ATAACCACTCAGTTATTTACCTTACTTTACGCGCGCGTATCTCTGGCAACATCACTGCAGG

ATAGCGGTCAATTTACCTCCTCAAACACAACGCAAACCTAGAACGGCTTCGGCCTATGATT

AACAAATTACTCTATGGATTTTGGTTTGGCAGGAAGGCAGCAAGTGAGTGAATCCCCGGGA

GCTTGCAACAGTAAGTGACAGGGGTGAACGAACGCAGCTGCCGCACCTGTAAGCCAAAAGA

CGACGAGTAAA

ATG CCA GGT TTT ACT ATG GAT ACG AAA AAA CTA TTC AAG CAC ATA CCC TGG

GTG ATT CTC GGA ATC ATC GGT GCA TTC TGC CTC GCG GTA GTT GCA TTA CGT

CGG GGG GAG CAC GTC AGC GCC CTG TGG ATC GTG GTC GCC TCT GTG TCG GTG

TAT CTG GTG GCG TAT CGC TAC TAC AGT TTG TAT ATC GCC CAG AAG GTG ATG

AAA CTC GAC CCC ACG CGC GCG ACG CCT GCG GTT ATT AAC AAC GAC GGT CTG

AAC TAC GTT CCG ACC AAC CGT TAC GTG TTG TTT GGT CAC CAC TTC GCC GCT

ATC GCC GGT GCT GGT CCG CTG GTT GGT CCG GTT CTC GCC GCG CAG ATG GGC

ATC CTA CCT GGC ACG CTG TGG CTG CTG GCG GGG GTA GTA CTG GCC GGT GCG

GTT CAG GAC TTT ATG GTG CTG TTT ATC TCC TCT CGC CGT AAC GGA CCA TCT

CTC GGT GAG ATG ATC AAA GAA GAG ATG GGA CCA CTA CCG GGG ACT ATC GCG

CTG TTT GGC TGT TTC TTA ATC ATG ATC ATC ATC CTC GCC GTC CTG GCG CTG

ATT GTG GTT AAA GCC CTG GCC GAA AGT CCG TGG GGT GTC TTC ACC GTT TGC

TCA ACC GTA CCG ATT GCG CTG TTT ATG GGT ATC TAC ATG CGC TTT ATC CGT

CCG GGG CGT GTG GGT GAA GTC TCT GTC ATT GGT ATC GTG CTG CTG GTT GCC

TCT ATC TAC TTC GGT GGC GTG ATT GCT CAC GAT CCG TAC TGG GGT CCG GCA

CTG ACC TTT AAA GAC ACC ACC ATT ACC TTC GCG CTG ATT GGC TAT GCG TTT

GTT TCC GCA CTG CTG CCG GTG TGG CTG ATC CTC GCA CCG CGC GAC TAT CTG

GCA ACC TTC CTG AAA ATC GGC GTT ATC GTC GGC CTG GCG CTG GGT ATC GTG

GTG CTG AAC CCG GAA CTG AAA ATG CCT GCG ATG ACC CAG TAC ATT GAC GGT

ACT GGC CCG CTG TGG AAA GGC GCT CTG TTC CCG TTC CTG TTC ATC ACC ATC

GCC TGT GGT GCG GTA TCT GGC TTC CAC GCG CTG ATC TCT TCC GGT ACG ACG

CCA AAA CTG CTG GCT AAC GAA ACC GAC GCG CGT TTC ATT GGC TAC GGC GCA

ATG CTG ATG GAG TCC TTC GTG GCG ATT ATG GCG CTG GTT GCA GCG TCC ATC

ATC GAA CCG GGT CTT TAC TTC GCG ATG AAT ACC CCG CCT GCT GGC CTT GGC

ATC ACC ATG CCT AAC CTG CAT GAA ATG GGT GGC GAG AAC GCG CCG ATC ATC

ATG GCG CAG CTG AAA GAC GTT ACC GCA CAC GCG CAG ACC GTC ACC TCC TGG

GGC TTC GTG ATT TCG CCA GAG CAG ATC CTG CAA ACC GCG AAA GAC ATT GGT

GAG CCT TCT GTC CTG AAC CGT GCA GGT GGT GCG CCA ACG CTG GCG GTA GGT

ATC GCT CAC GTG TTC CAC AAA GTG CTG CCA GTG GCT GAC ATG GGC TTC TGG

TAT CAC TTC GGT ATT CTG TTC GAA GCC CTG TTC ATC CTG ACC GCG CTG GAT

GCG GGT ACT CGT TCT GCC CGC TTT ATG CTG CAA GAC CTG CTG GGT AAC TTC

ATC CCG TTC CTG AAA AAA ACC GAC TCT CTG GTT GCC GGT ATC ATC GGT ACT

GCG GGC TGT GTG GGT CTG TGG GGC TAC CTG CTG TAT CAG GGC GTG GTC GAT

CCG CTG GGC GCG TTA AGA GCC TGT GGC CGC TGT TCG GTA TTT CCA ACC AGA

TGC TGG CAG CCG TAG

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

E. coli W hpaC - cts1 sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.