gabT - gabP sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

ATG AAC AGC AAT AAA GAG TTA ATG CAG CGC CGC AGT CAG GCG ATT CCC CGT

GGC GTT GGG CAA ATT CAC CCG ATT TTC GCT GAC CGC GCG GAA AAC TGC CGG

GTG TGG GAC GTT GAA GGC CGT GAG TAT CTT GAT TTC GCG GGC GGG ATT GCG

GTG CTC AAT ACC GGG CAC CTG CAT CCG AAG GTG GTG GCC GCG GTG GAA GCG

CAG TTG AAA AAA CTG TCG CAC ACC TGC TTC CAG GTG CTG GCT TAC GAG CCG

TAT CTG GAG CTG TGC GAG ATT ATG AAT CAG AAG GTG CCG GGC GAT TTC GCC

AAG AAA ACG CTG CTG GTT ACG ACC GGT TCC GAA GCG GTG GAA AAC GCG GTA

AAA ATC GCC CGC GCC GCC ACC AAA CGT AGC GGC ACC ATC GCT TTT AGC GGC

GCG TAT CAC GGG CGC ACG CAT TAC ACG CTG GCG CTG ACC GGC AAG GTG AAT

CCG TAC TCT GCG GGC ATG GGG CTG ATG CCG GGT CAT GTT TAT CGC GCG CTT

TAT CCT TGC CCG CTG CAC GGC ATA AGC GAG GAT GAC GCT ATC GCC AGC ATC

CAC CGG ATC TTC AAA AAT GAT GCC GCG CCG GAA GAT ATC GCC GCC ATC GTG

ATT GAG CCG GTT CAG GGC GAA GGC GGT TTC TAC GCC TCG TCG CCA GCC TTT

ATG CAG CGT TTA CGC GCT CTG TGT GAC GAG CAC GGG ATC ATG CTG ATT GCC

GAT GAA GTG CAG AGC GGC GCG GGG CGT ACC GGC ACG CTG TTT GCG ATG GAG

CAG ATG GGC GTT GCG CCG GAT CTT ACC ACC TTT GCG AAA TCG ATC GCG GGC

GGC TTC CCG CTG GCG GGC GTC ACC GGG CGC GCG GAA GTA ATG GAT GCC GTC

GCT CCA GGC GGT CTG GGC GGC ACC TAT GCG GGT AAC CCG ATT GCC TGC GTG

GCT GCG CTG GAA GTG TTG AAG GTG TTT GAG CAG GAA AAT CTG CTG CAA AAA

GCC AAC GAT CTG GGG CAG AAG TTG AAA GAC GGA TTG CTG GCG ATA GCC GAA

AAA CAC CCG GAG ATC GGC GAC GTA CGC GGG CTG GGG GCG ATG ATC GCC ATT

GAG CTG TTT GAA GAC GGC GAT CAC AAC AAG CCG GAC GCC AAA CTC ACC GCC

GAG ATC GTG GCT CGC GCC CGC GAT AAA GGC CTG ATT CTT CTC TCC TGC GGC

CCG TAT TAC AAC GTG CTG CGC ATC CTT GTA CCG CTC ACC ATT GAA GAC GCT

CAG ATC CGT CAG GGT CTG GAG ATC ATC AGC CAG TGT TTT GAT GAG GCG AAG

CAG TAG

CGCCGCTCCTATGCCGGAGGCGACGCTGCGCGTCTTGTCCGGCCTACGGGGATCCAGGTCG

GATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGACAATCTGTACGTGAACAGGAAGAAATCTATGTTGGC

CGGGTAAGGCGGAGCCGCTCTCCGGCAAAAAGAATCAATAACAATTATACGCGTGACCCGG

CGCGGGAAATGTCGGGGCGCTCTCCCAAGTGACACACTTTCGAGAGGATTCAGG

ATG GGG CAA TCA TCG CAA CCA CAT GAG TTA GGC GGC GGG CTG AAG TCA CGC

CAC GTC ACC ATG TTG TCT ATT GCC GGT GTT ATC GGC GCA AGT CTG TTT GTC

GGT TCC AGC GTC GCC ATC GCC GAA GCG GGC CCG GCG GTA TTA CTG GCC TAT

CTG TTC GCC GGG CTA CTG GTG GTT ATG ATT ATG CGG ATG TTG GCG GAA ATG

GCG GTT GCC ACG CCC GAT ACC GGT TCG TTT TCC ACC TAT GCC GAT AAA GCC

ATT GGT CGC TGG GCG GGC TAT ACC ATC GGC TGG TTG TAC TGG TGG TTT TGG

GTA CTG GTT ATC CCG CTG GAA GCC AAC ATC GCC GCC ATG ATC CTG CAC TCA

TGG GTT CCA GGC ATT CCC ATC TGG TTA TTT TCC CTC GTC ATT ACC CTC GCC

TTA ACT GGC AGT AAC TTA TTA AGC GTT AAA AAC TAC GGC GAA TTT GAG TTC

TGG CTG GCG CTG TGC AAA GTC ATC GCT ATC CTG GCC TTT ATT TTC CTT GGT

GCA GTC GCA ATT AGC GGT TTT TAC CCG TAT GCC GAA GTG AGC GGG ATC TCA

AGA TTG TGG GAT AGC GGC GGC TTT ATG CCC AAC GGT TTC GGT GCG GTA TTA

AGC GCG ATG TTG ATC ACC ATG TTC TCG TTT ATG GGC GCA GAA ATT GTC ACC

ATT GCC GCC GCG GAA TCC GAC ACG CCG GAA AAA CAT ATT GTC CGC GCC ACC

AAC TCG GTT ATC TGG CGT ATT TCT ATC TTC TAT TTA TGT TCT ATT TTT GTC

GTC GTG GCA TTA ATT CCG TGG AAT ATG CCC GGA CTA AAA GCC GTC GGT TCT

TAT CGC TCG GTA CTG GAA TTG CTC AAT ATT CCC CAT GCG AAA TTA ATC ATG

GAC TGC GTG ATA TTA CTT TCC GTA ACC AGT TGC CTG AAC TCG GCG CTG TAT

ACC GCG TCA AGG ATG CTC TAC TCC TTA AGT CGT CGC GGT GAT GCT CCC GCG

GTA ATG GGT AAA ATC AAC CGC AGT AAA ACC CCG TAC GTG GCG GTG TTA CTC

TCC ACC GGC GCG GCA TTC TTA ACG GTG GTG GTG AAC TAT TAC GCG CCT GCG

AAG GTA TTT AAA TTT CTG ATC GAC AGC TCC GGC GCT ATC GCC CTG CTG GTT

TAT TTA GTC ATC GCC GTT TCA CAG TTG CGG ATG CGC AAA ATT CTG CGA GCA

GAA GGA AGC GAA ATT CGC TTG CGA ATG TGG CTT TAT CCG TGG CTC ACC TGG

CTA GTC ATC GGC TTT ATT ACC TTT GTG TTG GTA GTG ATG CTA TTC CGT CCG

GCG CAA CAG TTA GAA GTG ATC TCC ACC GGC TTA TTA GCG ATA GGG ATT ATC

TGT ACC GTG CCA ATT ATG GCT CGC TGG AAA AAG CTG GTA TTG TGG CAA AAA

ACA CCC GTT CAT AAT ACG CGC TGA

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

gabT - gabP sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.