ftsK - lolA sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

TTG AGC CAG GAA TAC ATT GAA GAC AAA GAA GTC ACA TTG ACA AAG TTA AGT

AGC GGC CGC CGC CTT CTG GAG GCG TTG CTG ATC CTT ATT GTC CTG TTT GCC

GTC TGG TTG ATG GCT GCC TTA CTA AGC TTT AAC CCT TCG GAC CCC AGC TGG

TCG CAA ACG GCC TGG CAT GAA CCT ATC CAT AAT TTA GGT GGG ATG CCC GGT

GCG TGG TTG GCA GAT ACG CTG TTC TTT ATT TTT GGC GTG ATG GCT TAC ACC

ATT CCC GTC ATT ATT GTC GGC GGT TGT TGG TTT GCC TGG CGT CAT CAG TCC

AGC GAC GAA TAC ATT GAT TAT TTT GCC GTT TCG CTA CGC ATC ATT GGC GTT

TTG GCG CTC ATC CTT ACC TCC TGT GGT CTG GCG GCA ATC AAC GCT GAC GAT

ATC TGG TAT TTT GCC TCC GGT GGC GTC ATT GGC AGC TTA CTA AGC ACT ACG

CTA CAA CCA CTG CTA CAC AGT AGC GGG GGA ACT ATT GCG CTG CTC TGC GTT

TGG GCA GCG GGC CTG ACG TTG TTC ACC GGT TGG TCA TGG GTG ACC ATT GCT

GAA AAA CTC GGC GGC TGG ATT TTA AAC ATT CTC ACC TTC GCC AGT AAT CGT

ACC CGT CGC GAT GAT ACC TGG GTC GAT GAA GAT GAG TAT GAA GAC GAC GAA

GAG TAT GAA GAT GAA AAT CAC GGC AAA CAG CAT GAA TCA CGC CGT GCC CGT

ATT CTT CGC GGC GCG CTA GCG CGT CGT AAA CGG TTG GCG GAA AAA TTC ATT

AAT CCG ATG GGG CGG CAA ACA GAC GCT GCG TTG TTC TCC GGT AAG CGG ATG

GAT GAT GAC GAA GAG ATT ACC TAC ACT GCA CGC GGT GTG GCT GCC GAC CCG

GAC GAC GTC CTA TTT TCG GGC AAT CGT GCA ACG CAG CCA GAA TAT GAC GAA

TAC GAT CCA TTA TTA AAC GGT GCG CCA ATT ACC GAA CCT GTC GCT GTA GCA

GCT GCT GCT ACC ACG GCG ACA CAA AGC TGG GCT GCG CCG GTT GAA CCT GTG

ACT CAG ACG CCG CCT GTT GCC TCT GTT GAT GTT CCA CCT GCG CAA CCT ACA

GTA GCC TGG CAG CCT GTA CCG GGT CCA CAA ACG GGA GAG CCG GTT ATT GCT

CCT GCA CCG GAA GGT TAC CCA CAG CAG TCA CAA TAT GCG CAG CCT GCA GTG

CAA TAT AAT GAG CCG CTG CAA CAA CCA GTA CAG CCG CAG CAG CCG TAT TAT

GCA CCT GCA GCT GAA CAA CCT GCG CAA CAG CCG TAT TAT GCC CCT GCG CCA

GAA CAA CCG GTG GCA GGT AAC GCC TGG CAA GCC GAA GAG CAG CAA TCC ACT

TTT GCT CCA CAG TCT ACA TAC CAG ACT GAG CAA ACT TAT CAG CAG CCA GCC

GCT CAG GAG CCG TTG TAC CAA CAG CCG CAA CCC GTT GAA CAG CAG CCT GTT

GTG GAG CCT GAA CCC GTT GTA GAA GAG ACA AAA CCC GCG CGT CCG CCG CTT

TAC TAC TTT GAA GAA GTT GAA GAG AAG CGA GCC CGT GAA CGT GAA CAA CTT

GCG GCC TGG TAT CAA CCG ATT CCA GAA CCG GTT AAA GAA CCA GAA CCG ATC

AAA TCT TCG CTG AAA GCA CCT TCT GTT GCA GCA GTA CCT CCA GTA GAA GCC

GCT GCC GCT GTT TCC CCG CTG GCA TCT GGC GTG AAA AAA GCG ACA CTG GCG

ACG GGG GCT GCC GCA ACC GTT GCC GCG CCA GTC TTC AGT CTG GCA AAT AGC

GGT GGA CCG CGT CCT CAG GTC AAA GAG GGG ATT GGT CCG CAG TTG CCA CGA

CCG AAA CGT ATC CGC GTG CCA ACT CGT CGT GAA CTG GCG TCT TAC GGT ATT

AAG CTG CCC TCA CAG CGT GCG GCG GAA GAA AAA GCC CGT GAA GCC CAG CGC

AAT CAG TAC GAT TCT GGC GAT CAG TAC AAC GAT GAT GAA ATC GAT GCG ATG

CAG CAG GAT GAA CTG GCA CGT CAG TTC GCC CAG ACA CAG CAG CAA CGC TAT

GGC GAA CAG TAT CAA CAT GAT GTG CCC GTA AAC GCA GAA GAT GCA GAT GCT

GCG GCA GAG GCT GAA CTG GCT CGT CAG TTT GCG CAA ACT CAA CAA CAA CGT

TAT TCC GGC GAA CAA CCG GCT GGG GCG AAT CCG TTC TCG CTG GAT GAT TTT

GAA TTT TCG CCA ATG AAA GCG TTG CTG GAT GAT GGT CCA CAC GAA CCG TTG

TTT ACG CCA ATT GTT GAA CCT GTA CAG CAG CCG CAA CAA CCG GTT GCA CCG

CAG CAG CAA TAT CAG CAG CCG CAA CAA CCA GTT CCG CCG CAG CCG CAG TAT

CAG CAG CCA CAA CAG CCG GTT GCG CCG CAG CCA CAA TAT CAG CAG CCG CAA

CAA CCG GTT GCG CCA CAG CAG CAA TAT CAG CAG CCG CAA CAA CCG GTT GCG

CCG CAG CAG CAG TAT CAG CAG CCA CAA CAG CCA GTT GCG CCA CAA CCG CAG

GAT ACC CTG CTT CAT CCG CTG TTG ATG CGT AAT GGC GAC AGC CGT CCG TTG

CAT AAA CCG ACG ACG CCG CTG CCT TCT CTG GAT TTG CTG ACA CCG CCG CCG

AGC GAA GTG GAG CCG GTA GAT ACC TTT GCG CTT GAA CAA ATG GCT CGC CTG

GTG GAA GCG CGT CTG GCT GAT TTC CGT ATT AAA GCC GAT GTC GTC AAT TAC

TCT CCG GGG CCG GTT ATC ACT CGC TTT GAA TTG AAC CTG GCA CCG GGC GTA

AAA GCG GCG CGC ATT TCT AAC TTG TCA CGG GAC CTT GCC CGT TCA CTT TCG

ACG GTG GCG GTG CGT GTC GTT GAA GTT ATT CCT GGC AAA CCC TAT GTA GGT

CTG GAG TTA CCG AAT AAA AAA CGA CAA ACC GTT TAT CTG CGC GAA GTT TTG

GAT AAC GCC AAA TTC CGC GAT AAT CCG TCG CCA TTA ACC GTG GTG CTG GGT

AAA GAT ATC GCC GGT GAG CCG GTG GTT GCC GAT CTG GCG AAA ATG CCG CAC

TTG TTG GTT GCG GGG ACT ACC GGT TCC GGT AAA TCT GTC GGT GTG AAC GCG

ATG ATC CTG AGC ATG CTT TAT AAA GCA CAG CCA GAA GAT GTG CGT TTC ATC

ATG ATC GAC CCG AAA ATG CTG GAG CTT TCG GTT TAT GAA GGC ATT CCG CAT

CTG TTA ACG GAA GTC GTT ACT GAT ATG AAA GAT GCC GCC AAC GCG CTG CGC

TGG TGT GTT AAC GAG ATG GAG CGT CGG TAT AAA CTG ATG TCT GCG CTG GGT

GTG CGT AAT CTG GCG GGT TAT AAC GAA AAA ATT GCT GAA GCC GAT CGC ATG

ATG CGT CCG ATT CCA GAC CCG TAC TGG AAG CCG GGT GAC AGT ATG GAT GCC

CAG CAT CCG GTG CTG AAA AAA GAA CCA TAC ATT GTG GTG TTG GTT GAC GAA

TTT GCC GAC CTG ATG ATG ACG GTA GGT AAA AAA GTG GAA GAG CTG ATA GCA

CGT CTG GCG CAA AAA GCC CGT GCC GCG GGT ATC CAC CTC GTA CTG GCA ACT

CAG CGT CCA TCG GTT GAT GTT ATT ACT GGT CTG ATT AAA GCG AAT ATT CCG

ACC CGT ATC GCC TTT ACC GTA TCC AGT AAG ATT GAC TCA CGT ACC ATT CTT

GAT CAG GCT GGC GCG GAA TCA CTG CTG GGT ATG GGG GAT ATG CTC TAC TCT

GGG CCG AAC TCC ACG TTG CCG GTA CGT GTC CAT GGT GCT TTT GTT CGC GAT

CAG GAA GTT CAT GCC GTG GTG CAG GAC TGG AAA GCG CGT GGT CGC CCA CAG

TAT GTT GAT GGC ATC ACC TCC GAC AGC GAA AGC GAA GGT GGT GCG GGT GGT

TTC GAT GGC GCT GAA GAA CTG GAT CCG TTG TTC GAT CAG GCG GTG CAG TTT

GTC ACT GAA AAA CGC AAA GCG TCA ATT TCT GGC GTA CAG CGT CAG TTC CGC

ATT GGT TAT AAC CGT GCA GCG CGT ATT ATC GAA CAG ATG GAA GCG CAG GGG

ATT GTC AGC GAA CAG GGG CAC AAC GGT AAT CGT GAA GTG CTG GCC CCA CCG

CCG TTT GAC TAA

CTAATGCATCGTATGCCGGATAAGGCGCGGTAGCGTCGCATCCGGCACTCTATCAACTGAA

AATTCAGTATTTTCTTCTTTCCTCAAGCTGATTATTAGCCTGGAATAGAGAGTAGAGGGAA

CTCCCGATCGGGAGTGACGTAATTTGAGGAATA

ATG ATG AAA AAA ATT GCC ATC ACC TGT GCA TTA CTC TCA AGC TTA GTA GCA

AGC AGC GTT TGG GCT GAT GCC GCA AGC GAT CTG AAA AGC CGC CTG GAT AAA

GTC AGC AGC TTC CAC GCC AGC TTC ACA CAA AAA GTG ACT GAC GGT AGC GGC

GCG GCG GTG CAG GAA GGT CAG GGC GAT CTG TGG GTG AAA CGT CCA AAC TTA

TTC AAC TGG CAT ATG ACA CAA CCT GAT GAA AGC ATT CTG GTT TCT GAC GGT

AAA ACA CTG TGG TTC TAT AAC CCG TTC GTT GAG CAA GCT ACG GCA ACC TGG

CTG AAA GAT GCC ACC GGT AAT ACG CCG TTT ATG CTG ATT GCC CGC AAC CAG

TCC AGC GAC TGG CAG CAG TAC AAT ATC AAA CAG AAT GGC GAT GAC TTT GTC

CTG ACG CCG AAA GCC AGC AAT GGC AAT CTG AAG CAG TTC ACC ATT AAC GTG

GGA CGT GAT GGC ACA ATC CAT CAG TTT AGC GCG GTG GAG CAG GAC GAT CAG

CGC AGC AGT TAT CAA CTG AAA TCC CAG CAA AAT GGG GCT GTG GAT GCA GCG

AAA TTT ACC TTC ACC CCG CCG CAA GGC GTC ACG GTA GAT GAT CAA CGT AAG

TAG

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

ftsK - lolA sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.