fliA - fliC sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

TTA TAA CTT ACC CAG TTT AGT GCG TAA CCG TTT AAT AGC CTG GCT GTG TAA

CTG ACT GAC CCG CGA TTC CCC GAC CTC CAG CAC CGC GCC AAT CTC TTT GAG

ATT CAG CTC TTC CTG GTA ATA GAG GGT TAA TAC CAG TTT TTC GCG CTC CGG

CAA CGT TTC GAT GGC TTC CAT CAC CCG CTG GCG CAG ATT ACT GTC CAG TAG

TTG TTG TAG CGG GTT TTC TCG CTG ATG ATC ATC AGT AAC CAG TTC GAT GCT

ATC GCC GTG CTC TTC GCG CCA CTC ATC GTA GGA GAA GAG CTG GCT GTT ATT

GGT GTC GAG CAA CAT TTG GCG ATA ATC GGC AAT ATC GAT CCC TAA ACG TTC

CGC TAC CTC AGT TTC CGT GGC GTT GCG GCC AAG TTC CTG CTC CAG TTG CCC

TAT TGC CTG TGC CAC TTC ACG CGC GTT GCG TCG CAC GCT GCG CGG CAC CCA

GTC ACG GCT GCG AAG TTC ATC CAG CAT AGC GCC ACG GAT ACG CTG CAC TGC

GTA AGT TGT AAA TGC CGT TCC TTG TAG GGC GTC ATA GCG TTC GAC GGC ATT

AAG TAA CCC AAT GCC GCC CGC CTG TAG CAG ATC GTC AAG TTC CAC GCT CGC

GGG CAG TCG AAC CTG CAG GCG CAA TGC TTC GTG ACG CAC CAG CGG GAC ATA

ACG CTG CCA CAG CGA GTG TTT ATC CAT TAC ACC TTC AGC GGT ATA GAG TGA

ATT CAC

GATAAACAGCCCTGCGTTATATGAGTTATCGGCATGATTATCCGTTTCTGCAGGGTTTTTA

ATCGGACGATTAGTGGGTGAAATGAGGGGTTATTTGGGGGTTACAGGTAAATTCCAGGCAG

AAAAAAACCCCGCCGGTGGCGGGGAAGCACGTTGCTGACAAATTGCGCTTTATGTTGCCGG

ATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAATGTGCAAATTCAATAAATTGCAATTCA

ACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGCATCAGGCAATTTGGCGTTGCCGTCAGTCTCAGTTA

ATCAGGTTACAACGA

TTA ACC CTG CAG CAG AGA CAG AAC CTG CTG CGG TAC CTG GTT AGC TTT TGC

CAA CAC GGA GTT ACC GGC CTG CTG GAT GAT CTG CGC TTT CGA CAT ATT GGA

CAC TTC GGT CGC ATA GTC GGC GTC CTG AAT ACG GGA CTG CGC TTC AGA CAG

GTT GGT AGT GGT GTT GTT CAG GTT GGT AAC CGC GGA ATC CAG ACG GTT TTG

CAC CGC ACC GAG GGA AGA ACG GAA TTT GTC TAC AGA TGC GAT AGC ATC GTC

CAG CGC TTT CAG CGG ATC CGT GGT TTT ACC ATT TGC AAC AGC AGT CAG AGC

CTC ACC ACC AGC AGT CAA ACC TGT TTG CAG ATT ACC GCC ATT TAA ATC GGC

AGA ATC GTA TGT TTT ACC ATC AAT ATC GAC CAC TTC TGT TTT GCC ATC ATC

TCC GCC CAG TTT GAC CGC GGT TGG AGA ACT GGC GGC ACC GGA AGA GTC AGT

ATA GGT AAT AGT TTT AAC AGA AAC AGC ACC AGT AGT TTC ATT CAC ATC CGC

AGC GTA AAG ATT GCC ATT TGT ATC TTT AAG CGC ATA TGT ATC GGT ATC ATT

ACC CTT GGA ATC CTG CAG TTT TAC TAA GCT AAC AGC ACC AAG GTT GGC AGT

TGC GGA ACC TGC AGT ATT ATC AAT CTG AAC AGG TGT ACC GCC TGA AGT GAT

AGT TGT AGC TTT AGT AGT ATT TGC ATC AGT TAC AGT TGC ATT TGC CGT TGC

TCC AGT CGC CAT TGT CAC TGT ACC ATC ATT AGC AAC TGT TAC TGC GTA ATA

CTT CCC ATC GTT ATC ACC ACC GGT GAT TTT CGC ATA GTA ATC ATT ACC ATT

ATC AGT ATA AAC ACC CTC AAT TGA AGC TGG GTT AGT TCC GCC AGT ATC AGT

GGC TGC TTC CGT AGA AAG GGT AAT TCC AGT AAG TTT AAT ATT GTT TGT GGT

GGT AGC ACC AAA AGC AGT TAC TGG AGC ACT AGT GGT AAC TGT ATC GTT ATT

TTT AAC GCT AAA ACC ATC AAG GCC AAG AGT TTT AGC ATC AAT CTG CTT CAG

ATC GAT AGT GAT AGT CTG GTT ATC ATT TGC GCC AAC CTG GAT TTT CAT GGA

GCC ATT TTT TGC CAG CAC GTT CAC GCC GTT GAA CTG GGT CTG ACC AGA TAC

GCG GTC AAT TTC ATC CAG ACG GGA TTT AAT TTC GTC CTG GAT AGA AGA CAG

ATC AGA CTC AGA GTT AGT ACC GGT AGT GGC CTG TAC CGT CAG TTC ACG CAC

ACG CTG TAA GTT GTT GTT GAT TTC GGA CAG CGC GCC TTC GGT GGT CTG CGC

AAC GGA GAT ACC GTC GTT GGC GTT ACG GGC CGC CTG AGT CAG GCC TTT AAT

GTT AGA GGT GAA ACG GTT AGC AAT CGC CTG ACC CGC TGC GTC ATC CTT CGC

GCT GTT AAT ACG CAA GCC AGA AGA CAG ACG CTC GAT AGA ACT CGA CAG CGC

AGA CTG GTT CTT GTT GAT ATT ATT TTG AGT GAT CAG CGA GAG GCT GTT GGT

ATT AAT GAC TTG TGC CAT

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

fliA - fliC sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.