entD - fepA sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

TTA ATC GTG TTG GCA CAG CGT TAT GAC TAT CTT TTC TTT TAT CTG CCA GTG

CAC AGC AAA CAT CTC ATT CTC ACG ATG AAT GAT GAC CTG CTG TTT ATT CCA

GCT AAT TAT CTG ATA GTC CAG AAA ACC TGC ATC AGT TTG GAT CTC ACT TGC

CTT AAA TGC GCT CTC TTT GGC GGA AAA TGC CAG TGT CAG CGC CAG AGA AAA

GGC TAA ACC GCA GTC TGC GAG TCG CTC GTG TTC CGC TGG TGT AAT AAT GTT

GTC TGT CAA TTC TCT TGC GGT TTG TAC AGA AAA AAT TTC TTC TAT ATC AAT

GCC AAT CGG TTG ACG AGA TAC CAC GGC TAA TGC CGT AGT CCC ACA GTG GCT

AAT ACT GCC GTA TAC CTC CGC AGG CCA GAC AGG TTG GCG TAG CTC GCC GAT

TGC GGG CAC ACA TTT ATA GCC ATA TTC CCG CAA AGC ATA AAC AGC AGC GAT

CCG TCC GGC TAA ATG CTC TGT TTT ACG TTT ACG TCC AGC GTG TTG CAG TTG

TGC GTA GTG CGG CAG CCA GAG TAA ATC CTG CTC ACA AAA ATT CGC CGG ATC

GAA CTC AAC AAA ATG CAG CGT ATG TCC GGC AAA GGG GAG GGA GGT ATG CGT

AGT TTT CAT ATC GAC CAT

ATTCGAGACTGATGACAAACGCAAAACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACATGG

TCCTGCAATATATTGAATTGGCAAGATTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATC

CGGCATGAACGACGCGCACTTTGTCAACAATCTGACGTTAGCA

TCA GAA GTG GGT GTT TAC GCT CAT ATA CCA CGT ACG TCC CGG CTC GTT ATA

GGT ATA CGC CCC GGC ACC GGC GAT ATA GTT GGC CCC TGC CAA ATC GCC CGT

GGT CTG GGC ATT ACC CGC ACG CCA CAA ACG TTT GTC GAA CAG ATT GTC CAC

GCC GCC GGT CAG ACT GAC ATT CTT CGT CAC ATC CCA GGT CGC GCT CAG GCC

AAC AAT GCT GTA AGG ACT AAT TTC TTT GGT TTC CGG TCC AAC CGC TGG CTG

ACC TTT ATA GTT GTA CTT CTT CGG CTG CTG CTT GCC GTA CCA GGT GAA GGT

CGT TTG CAT CGA CAA ATC TTC CCG TGC CTG CCA GCT CAG CGT TGA GTT CAA

CGT ATA CTC CGG GAT GAT CGA CAA ACG GTC GCC CGT GGT TTT GTT TTC ACT

CTT CAG CAT ATA AGT GAT GTT ATT GGT CCA CAT CAC CGT TTC GCT AAC CGG

TAC GTT TAA CGA TCC TTC CAG ACC TTC AAC CAC CGC TTT CGG CAC GTT ATC

CCA CTG ATA GAG ATC GGT GCC GAC TGC GTT TTG CCC TAC AGC CAC ATA GCC

CGC TTC AAT CTT ATT GCG ATA ATC GTT ACG GAA CCA GGT GAC GCC CGC CAG

CCA CCC GTC GCG TTT GAA CTC CAG ACC AAT CTC TTT GTT GAT GCT GGT TTC

TGC TTT CAG GTC ATC GTT ACC TTG CAG ATA GCA GCC GCC CGC GCT GGC ATA

GCA ACC CTG ACC TTT ACT GTA GAG AAT GTA GTT CGG GTT AGT CTG GTA CAG

GCT CGG CGC TTT ATA AGC ACG GGC GAT GCC CAT TTT CAG CGT GAA GTC ATC

GCC TAA ACC TTG CGA TAT GTT CAG CGC CGG GCT CCA GTT ATT GCC GAC AAT

ACT GTG ATG ATC GAA ACG CAG CCC CGG CGT TAC GAT GGT GCT GTC AGT CAG

CTC CAT GTT GTT TTC GGC AAA CAG CGA GAA AAT TTC TGC TTT TGA ATA CGG

GCT ACG GTC GGT GGT ACT CAC GCC ATC AAT AGC GCC ACC GGT ATT CGT TCC

GGT CAG TGC CTG GGT GTT GGA ACT TAA GTC CTT CAT CCG TTG CTG ATT CCA

CTC CGT ACC CAG CGT CAG CGT CTG GTT AAC GAG GAA ATC AAT CGG CAG GTT

AAC TTC GCT GTG CAG CAT CAC GTC ATC AAG ATC GAT ATC GAC GAA ATC CTG

TGT CGC TTT TTC GTT AAA TTT CCC TTC GGT ACC GCC CGC CAG ACC TTC CGG

AAT ACG CGA GTT ACG GGT GTG TTC GTA CTG CAC CCA GTT GCT GGT GGT CAC

GCC GTT ATC CCA GCC ACC GTT CCA GGT CAG CGC GTA GTT CTG GCG ATA CAG

ACG GTT GGT TTC ATC GCC ATA TTT CGA GCG GGT ATA GGA ATC GGA GTT GGT

ATT CTG GGT GTC GCC CGC ATA CAG GTT ACC CTG GCG GCT GTA ACC TGC TTC

CAG TTC CAG CGA TTG CAA TGG CGC GAA ATC CCA GCG CAC CAC GCC ATT AAT

ATC TTT GTT GAT TAC CCC TTC GCG CCC GGC TGG TAA CGT CGT GGC ATA CGT

TCC GGC ACG CGC GGA CTG ATG GCC CTG GTT GAT ATC CCA CGC GTC AGC CTG

GGT TTT GTC GAG GTT GCC ATA CAA ACG GAA GCT GAA TTC GTC GCC CAG CGG

ACC GGT CAG GCT AAA GTT AGT GCG TTT GGT GGC ACC TTC CTC TTT ATG TTC

TGG CGC ATT GAA ATA TGC GTC CCA GGA GCC GTG CCA CTC GCC GCT GCC TTT

TTT GGT AAT GAT GTT AAC CAC GCC GCC CGC CGC GCC GTT GCC ATA ACG CGC

AGC TGC CGG ACC ACG CAG AAC TTC AAT ACG TTC AAT CAT TTC AGG TGG CAC

CCA GGA AGT ATC ACC ACG GGT ATC GCG CTC GCC ACG CCA GCC CTG ACG CAC

CGA GTT ACG GCT GCT TAC CGG CTT GCC GTC AAT CAA AAT CAG CGT GTT TTC

CGG ACC CAT ACC GCG AAT ATC AAT CTG TCG GTT ATT CCC ACG CTG ACC ACT

GGT GGA GTT ACC GGT CAG GTT AAC GCC TGG CAT GGT ACG GAT GAT CTT CGA

CAC ATC GCG GGC AAC CGG GTT TTT GCG GAT TTC ATC TGC GGT GAT GGT CGA

AAC GCC AGG CGC CTG TAA GTT CTG CTC GGC GGC GGT AAC GAC AAT AGT ATC

GTC ATG TGA AAC AGG AGT ATC GGT CGG CTC TTG TGC CTG CGC TAC CCC ATA

AAT CCC CAG ATT GAC CAA CAA GGC CAG GGA ATG AAT CTT CTT GTT CAT

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

entD - fepA sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.