cueO - gcd sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

ATG CAA CGT CGT GAT TTC TTA AAA TAT TCC GTC GCG CTG GGT GTG GCT TCG

GCT TTG CCG CTG TGG AGC CGC GCA GTA TTT GCG GCA GAA CGC CCA ACG TTA

CCG ATC CCT GAT TTG CTC ACG ACC GAT GCC CGT AAT CGC ATT CAG TTA ACT

ATT GGC GCA GGC CAG TCC ACC TTT GGC GGG AAA ACT GCA ACT ACC TGG GGC

TAT AAC GGC AAT CTG CTG GGG CCG GCG GTG AAA TTA CAG CGC GGC AAA GCG

GTA ACG GTT GAT ATC TAC AAC CAA CTG ACG GAA GAG ACA ACG TTG CAC TGG

CAC GGG CTG GAA GTA CCG GGT GAA GTC GAC GGC GGC CCG CAG GGA ATT ATT

CCG CCA GGT GGC AAG CGC TCG GTG ACG TTG AAC GTT GAT CAA CCT GCC GCT

ACC TGC TGG TTC CAT CCG CAT CAG CAC GGC AAA ACC GGG CGA CAG GTG GCG

ATG GGG CTG GCT GGG CTG GTG GTG ATT GAA GAT GAC GAG ATC CTG AAA TTA

ATG CTG CCA AAA CAG TGG GGT ATC GAT GAT GTT CCG GTG ATC GTT CAG GAT

AAG AAA TTT AGC GCC GAC GGG CAG ATT GAT TAT CAA CTG GAT GTG ATG ACC

GCC GCC GTG GGC TGG TTT GGC GAT ACG TTG CTG ACC AAC GGT GCA ATC TAC

CCG CAA CAC GCT GCC CCG CGT GGT TGG CTG CGC CTG CGT TTG CTC AAT GGC

TGT AAT GCC CGT TCG CTC AAT TTC GCC ACC AGC GAC AAT CGC CCG CTG TAT

GTG ATT GCC AGC GAC GGT GGT CTG CTA CCT GAA CCA GTG AAG GTG AGC GAA

CTG CCG GTG CTG ATG GGC GAG CGT TTT GAA GTG CTG GTG GAG GTT AAC GAT

AAC AAA CCC TTT GAC CTG GTG ACG CTG CCG GTC AGC CAG ATG GGG ATG GCG

ATT GCG CCG TTT GAT AAG CCT CAT CCG GTA ATG CGG ATT CAG CCG ATT GCT

ATT AGT GCC TCC GGT GCT TTG CCA GAC ACA TTA AGT AGC CTG CCT GCG TTA

CCT TCG CTG GAA GGG CTG ACG GTA CGC AAG CTG CAA CTC TCT ATG GAC CCG

ATG CTC GAT ATG ATG GGG ATG CAG ATG CTA ATG GAG AAA TAT GGC GAT CAG

GCG ATG GCC GGG ATG GAT CAC AGC CAG ATG ATG GGC CAT ATG GGG CAC GGC

AAT ATG AAT CAT ATG AAC CAC GGC GGG AAG TTC GAT TTC CAC CAT GCC AAC

AAA ATC AAC GGT CAG GCG TTT GAT ATG AAC AAG CCG ATG TTT GCG GCG GCG

AAA GGG CAA TAC GAA CGT TGG GTT ATC TCT GGC GTG GGC GAC ATG ATG CTG

CAT CCG TTC CAT ATC CAC GGC ACG CAG TTC CGT ATC TTG TCA GAA AAT GGC

AAA CCG CCA GCG GCT CAT CGC GCG GGC TGG AAA GAT ACC GTT AAG GTA GAA

GGT AAT GTC AGC GAA GTG CTG GTG AAG TTT AAT CAC GAT GCA CCG AAA GAA

CAT GCT TAT ATG GCG CAC TGC CAT CTG CTG GAG CAT GAA GAT ACG GGG ATG

ATG TTA GGG TTT ACG GTA TAA

AAAGACCGTATTCGGAAATATGCCCGGATCTCTCCGGGCATTAAACTGATGACAAACGCAA

ATCTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACGCTAGCTGTGCAATCCATTGATTTTGCA

CAATTTTGTAGGCTGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCATGAACAACGCGCACGTTGT

CAGCAATCTGAGCAAGTC

TTA CTT CAC ATC ATC CGG CAG CGC ATA AGC CAC AAT ATA GTC GCC CAT CTT

CGT ACC AAA TGA ACC GTG ACC GCC TGC GGA GAT CAC CAC ATA CTG CTT ACC

ATT CAC TTC ATA GGT CAT TGG CGT AGC CTG ACC ACC CGC TGG TAA ACG ACC

CTG CCA CAG TTT TTC ACC GTT GCT CAT GTT GTA AGC GCG CAG GTA GTT ATC

TGC CGT AGC GGC GAT AAA CAG CAC GTT ACC CGC CGT GGA GAT TGG CCC GCC

CAG CAT CGG CAT ACC CAT ATT GAA CGG CAC CGG AAC CGG CAT CGG GAA CGG

CAT ACT GTC CTG CGG CGT ACC AAT ACG TTT CTT CCA CAC CAC TTC ATT AGT

TTT CAG ATC CAG CGC CGA GAT ATA ACC CCA TGC TGG CTG TTT ACA TGG CAG

ACC AAA TGG TGA GAG GAA CGG GTT GAG CGT GAC ACC ATA CGG TAC ACC GTA

CTG TGG CTG AAT GCC GGA TTC CGT ACC CGT GCC TTT GGC ATC TTT CGG CTG

CTC CAT CGG GTT GCC AGG ACC ACG CGG GAT CAG TTT CGA AAC AAA CGG CAG

TGC CAT TGG GTT GGC AAT CGC CAC TTC ACG ATT TGG ATC AAC GGA AAT CCC

GCC CCA TTC GAA CAT CCC CAG GTT ACC CGG GAA GAC CAG CGT ACC CTG TTC

AGA TGG CGG GGT GAA AAT GCC TTC ATA GCG CAT CTG GTG GAA CAT CAC GCG

GCA CAC CAG TTG GTC AAA CAT GGT GGC TCC CCA CAT ATC CGC ACC GCT CAA

ATC TTT CGT CGG ACG GAA GCT CAG TTC AGA AAA CGG TTG AGT TGG GGT TAC

GTA ATC GCC TTT CGC TGC ACC TTG GGG AAC CGG TTT TTC CGG TGC CGG AAC

CAC CAG TTC GCC ATT ACG ACG ATC GAG CAC AAA AAT GTT GCC GGT TTT CGC

CGG AGC GTA AAT AAC TGG CAC TTT CTG ACC ATT AAC GGT GAT GTC CGC CAG

CGT CGG CTG TGC CGG AAG ATC CAT GTC CCA CAG GTC GTG GTG AAC GGT CTG

GTA GCT CCA CGC CAG TTT CCC GGT AGT GGC ATT CAG CGC CAG AAT CGA GCT

GGC ATA ACG TTC CTG TTC CGG TGT GCG GTT ACC GCC CCA GAT ATC CGG CGT

GGT CAC GCC CAT CGG CAG ATA GAC CAG ATC CAG CTT CGC GTC ATA GGC CGC

TGG TGC CCA GGA GTT TGG CGA GTT AAA GGT AAA GGT GTG TTC GTC AGA CGG

GAT TGC GTT CGG ATC TTT CGC GCC GGG ATC AAA AGC CCA CAG CAG CTC CCC

GGT GTT GAC ATC AAA ACC ACG GAT CAC GCC AGA CGT TTC GCG GGT TGA GAA

GTT ATC GGT AAC TGA ACC GGC CAT CAC GAT GGT TTT ATC GGT GAT AAT CGG

TGG CGA AGT CGG TTC ATA CAG ACC CGG TTT GGT GTC TGG CAT ATT GCT TTG

CAG ATT GAG CAC GCC TTT ATT GGC GAA GGT TTC GCA CAG TTT GCC GTT TTC

AGC GTT AAT CGC AAT CAG TCG ACC ATC ATT GAC CGG AAG AAT GAT ACG ACG

CGG GCA ATC CGC CAT CAC TTC CGG CGA AGC GGT TTC TGC TTT GGC TTC ATG

ATA AGA GAC ACC ACG GCA GGT TAC GTG CTG GAA AGA CTC GTT GGT TTT CAG

CTC AGG ATC GTA ATG CCA TTT CTC TTT GCC GCT GGC GGC ATC AAG CGC AAA

CAG GCG CTG GTG AGC GGT ACA CAG GTA AAG GGT GTC GCC CAC TTT AAT CGG

CGT CAC TTC ATT GGT GAT TTC ACC CGG ATC GTT CGG CTG CTT CAC ATC GCC

AGT ACG GAA CAC CCA GGC TTC TTT CAG ATT ATG GAC GTT ATC GGC GTT AAT

TTG TTT CAG CGG CGA AAA GCG TTG ACC TTC CTG ATT ACG ACC ATA GGC AGG

CCA GTC CTG ATC GGC TAC GGG GGA GAT AGC TTC AGC AGG TGT GGC ATC GGC

GCT TAA GGT GCC GTT GAT CTC CTG CGG ATC GTT AAA TCC GGC CCA GGT CAG

GAT ACC ACC GCT AAT CAG CAG TGC GAC CAC CAG TGC GGC AAC TGC GCC GCT

GGC AGG AAT GAC CAG GCG ACG CCA GAC AAA CGG CAG GAT CAG CCA GAT GCC

GAA GAA GAC CAG AAT GTC GCT GCG CGG AGT CAG CGC CCA GAA GTC GAA ACC

AAC TTC CCA GAC GCC CCA AAT CAT GGT GCC GAG CAG CAG GGC TGC GTA TAG

CCA AAG CGC GGC GCG TTT ACT GCG CCA CAG CAT CCA GGC GAC GCC GAG CAT

CAC AAG GCC AGC GAT AGG GTA GTA CCA GGA GCC GCC AAT CGC GAC CAG CCA

GCC TCC GCC AAT GAG TAG ATA CAG CCC GCA AAG CGC TGC AAA AAG GGC TGT

TAG CGT GAC GAG TAA TCG TCG CGA GCC TGT ATT GTT AAT TGC CAT

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

cueO - gcd sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.