cstA - ybdH sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

ATG AAC AAA TCA GGG AAA TAC CTC GTC TGG ACA GTG CTC TCT GTA ATG GGA

GCA TTT GCT CTG GGA TAC ATT GCT TTA AAT CGT GGG GAA CAG ATC AAC GCG

CTG TGG ATT GTG GTG GCG TCG GTC TGT ATC TAT CTG ATC GCT TAC CGT TTT

TAT GGG CTG TAT ATC GCC AAA AAT GTG CTG GCG GTT GAC CCG ACG CGT ATG

ACG CCA GCG GTG CGC CAT AAC GAC GGG CTG GAC TAT GTG CCG ACG GAC AAG

AAA GTG CTG TTC GGT CAC CAT TTT GCG GCC ATT GCC GGA GCA GGT CCG CTG

GTG GGG CCG GTA CTG GCG GCG CAA ATG GGC TAC CTG CCG GGG ATG ATC TGG

CTG CTC GCT GGG GTG GTT CTC GCC GGT GCG GTG CAG GAT TTC ATG GTG CTG

TTT GTT TCT ACG CGC CGT GAC GGT CGC TCG CTG GGT GAG CTG GTC AAA GAA

GAG ATG GGG CCA ACC GCC GGG GTG ATT GCG CTG GTG GCC TGC TTT ATG ATC

ATG GTC ATT ATC CTT GCA GTG CTG GCG ATG ATC GTG GTG AAA GCC CTG ACT

CAT AGC CCG TGG GGA ACA TAT ACC GTT GCG TTC ACC ATT CCG CTG GCG CTG

TTT ATG GGG ATC TAC CTG CGC TAT CTG CGT CCG GGG CGT ATT GGC GAA GTG

TCG GTC ATC GGT CTG GTA TTC CTG ATT TTC GCC ATT ATC TCT GGC GGC TGG

GTG GCA GAA AGT CCG ACC TGG GCA CCG TAC TTT GAC TTT ACC GGC GTG CAG

TTG ACC TGG ATG CTG GTG GGT TAC GGT TTT GTG GCG GCG GTG CTG CCG GTG

TGG TTA CTG CTG GCC CCG CGT GAC TAC CTC TCT ACC TTC CTG AAA ATC GGG

ACT ATC GTC GGT CTG GCG GTA GGC ATT TTG ATT ATG CGC CCG ACG CTG ACC

ATG CCT GCG CTG ACC AAA TTT GTC GAT GGC ACT GGC CCG GTA TGG ACC GGT

AAC CTG TTC CCG TTC CTG TTT ATC ACC ATC GCC TGT GGC GCG GTG TCT GGC

TTC CAT GCG CTG ATC TCT TCT GGG ACC ACG CCG AAG ATG CTG GCG AAC GAA

GGG CAG GCG TGC TTT ATC GGC TAC GGT GGG ATG TTA ATG GAA TCC TTC GTG

GCG ATT ATG GCG CTG GTT TCC GCC TGT ATC ATC GAT CCG GGC GTG TAT TTT

GCC ATG AAC AGC CCG ATG GCG GTG CTG GCT CCG GCA GGG ACG GCG GAT GTG

GTC GCT TCT GCC GCG CAG GTG GTG AGT AGC TGG GGC TTT AGC ATT ACA CCA

GAT ACG CTA AAC CAG ATT GCC AGC GAA GTG GGT GAA CAG TCG ATC ATT TCC

CGT GCG GGC GGT GCG CCG ACG CTG GCG GTG GGG ATG GCC TAC ATT CTG CAC

GGC GCG CTG GGC GGC ATG ATG GAT GTG GCG TTC TGG TAT CAC TTC GCC ATT

TTG TTT GAA GCA CTG TTT ATT CTG ACG GCG GTG GAT GCA GGT ACG CGT GCT

GCG CGC TTT ATG TTG CAG GAT CTG CTG GGC GTG GTG TCT CCT GGC CTG AAG

CGG ACC GAT TCA CTG CCT GCT AAC CTG CTG GCA ACA GCG CTG TGC GTA CTG

GCG TGG GGC TAC TTC CTC CAT CAG GGC GTG GTC GAT CCG CTG GGC GGC ATT

AAC ACT CTG TGG CCG CTG TTT GGT ATT GCC AAC CAG ATG CTG GCA GGG ATG

GCG CTG ATG CTC TGT GCC GTG GTG TTG TTC AAG ATG AAA CGT CAA CGT TAC

GCC TGG GTG GCG CTG GTA CCA ACG GCC TGG CTG CTG ATT TGT ACC CTG ACC

GCA GGC TGG CAG AAA GCG TTT AGC CCG GAT GCG AAA GTC GGC TTC CTG GCC

ATT GCT AAT AAG TTC CAG GCA ATG ATC GAC AGC GGC AAT ATT CCG TCG CAG

TAT ACT GAG TCA CAG CTG GCG CAA CTG GTG TTC AAC AAC CGT CTG GAT GCC

GGG TTA ACC ATC TTC TTT ATG GTG GTC GTG GTG GTT CTG GCA CTG TTC TCG

ATT AAG ACG GCA CTT GCG GCA TTG AAA GAT CCG AAG CCA ACG GCG AAA GAA

ACG CCG TAT GAA CCA ATG CCG GAA AAT GTC GAG GAG ATC GTG GCG CAG GCA

AAA GGC GCA CAC TAA

AGTCAGAGTGAGGGGGGGATGTTGGCGAATGTTGGCTTAGTGCCCAGGGTTCCCTCTCACC

CTAACCCTCTCCCCGGTGGGGCGAGGGGACTGACCGAGCGCGTTGATAGCATTTGTAGGCC

GGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCACTCTTTCAGCAACATGGTTAGCGGAGGCCAAGA

TGTTTGATTCACTGGCAAAAGCCGGAAAATATTTAGGTCAGGCGGCGAAGCTGATGATTGG

TATGCCTGATTACGACAACTATGTCGAACATATGCGGGTTAACCATCCCGATCAAACGCCG

ATGACCTACGAAGAGTTTTTCCGTGAGCGGCAGGACGCGCGCTACGGTGGAAAAGGCGGCG

CGCGCTGCTGCTAAATTTGTACG

TCA GGC TTT AAA CGA TTC CAC TTT TTT GAA CGC TGC ACG CAA CGT ATC TGG

TGT CAG CGT GAC TGG CAG GTA ATG AAT GGA CTC CAC CGG ACG CAG GGT GTG

GGC AAT CAC TTT GTC GAT CTC CGC CTG ATT ATT GAT ATC CAC TTC CAG CTC

CGC CAG TGT AGT CGG CAG ATG AAA ACG CTG ATA CGC TCC AGT TAA TTG CGC

CAG CAC ATC ATC CTG ACC CAG CAA GGC GCT TTG CAC CAG AAT TCC GTA GGC

GAC TTT GGT GCC GTG GAG AAA CTT CTC GGT TTG CGG CAG CAC GGT CAG ACC

GTT ATG CAC GGC ATG AGC TGC CGC CAC ACG CGT AAA ACG ATC GCC CAG ACC

ACC AAC CAT CCC ACC ACC AGC AAT AAT AGC ATC CAC CAC ATC GCA AAA TGA

TTG CGT TAA CTG TTG ATT TTG CTG ATC GCT CAG CGC CTG TTC GCT ACT GTT

TAA CAA GAC GTC GCG AAT GGC TTG CGC ATT ATT GAT CCC CAG TCG CAC GGT

TAG CGG CAA CGT TTC TGG TTG CGG AGC CAG CAC CAC CGC TTC ATA CCA TTT

CGC CAG CGT GTC ACC GAT CCC CGC CAG CAG ATA TTG TTG CGG TGC ATT GAG

GAT AAT CTC CGG TTC CAC CAG CAC CAT AAA ATT GGC GTC GTC GAA AAT CTC

ATA ATG CAG CGC CTG TCC GGC ATC ATT ATA CCA GAC GGA GAG CGG TGT CCA

GGC GGC GCA GGT GGC GGC GAT CGT CGG AAC GGC AAC AAA CGG CAG ACC GAG

ACG GCG GGC GAG GGC TTT CGC GGT GTC GAG CAG TGC ACC GCC ACC GAC GCC

AAT CAC CAC GCT GCG GTC GTC ACC GGA CTC AGC CGC CAG TTG TTG TAC ATC

GCT TTC GCT GCA ATG ACC GCG AAA CAA AAT ATG CTT TGC CCC TGG CAG TCC

AAA CGC TGG CGG AAG TTT GGT TTG CGC CGC AGC AAT GGC GCG TTT GCC GTA

GAT CCA CAC CGC GCG AGA AAG TTG TTC ATC AGT GAA AAA ATC GTG CAG GTG

ATT GAA ACT TCC TGG ATG TGA AAA GTA GTT AGC CGG GCC GAC GAC CAC GCG

GAT AGG ATT GTG AGG CAT

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

cstA - ybdH sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.