clpP - clpX sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

ATG TCA TAC AGC GGA GAA CGA GAT AAT TTG GCC CCT CAT ATG GCG CTG GTG

CCG ATG GTC ATT GAA CAG ACC TCA CGC GGT GAG CGC TCT TTT GAT ATC TAT

TCT CGT CTA CTT AAG GAA CGC GTC ATA TTT CTG ACC GGC CAG GTC GAA GAC

CAT ATG GCT AAC CTG ATC GTG GCG CAG ATG CTG TTC CTG GAA GCG GAA AAC

CCG GAA AAA GAT ATC TAT CTG TAC ATT AAT TCT CCT GGC GGC GTA ATT ACT

GCG GGG ATG TCC ATC TAT GAC ACC ATG CAG TTT ATT AAG CCA GAC GTC AGC

ACC ATT TGT ATG GGA CAG GCG GCC TCT ATG GGG GCG TTT CTG CTG ACT GCC

GGG GCG AAA GGC AAA CGT TTC TGC TTG CCG AAC TCT CGC GTC ATG ATC CAC

CAG CCG CTG GGC GGC TAC CAG GGC CAG GCG ACG GAT ATT GAA ATT CAC GCC

CGC GAA ATT TTG AAA GTA AAA GGG CGC ATG AAT GAA CTT ATG GCG CAT CAT

ACG GGT CAA TCT CTT GAG CAG ATT GAA CGT GAT ACT GAG CGC GAT CGC TTC

CTC TCC GCG CCT GAA GCG GTA GAG TAC GGT TTG GTT GAC TCA ATT TTG ACC

CAT CGT AAT TGA

TGCCCTGTTACGCAAGTGTGCCGCTATACACTTCATCCTTCACGCTACCTCGGTGTTGGCT

GCCAGCGCGCCTCCCAGTGACTTACTTATGTAAGCGCCTGCAGAGTCGACGAGTTGCCGCC

TTGATGTAGCTCGAATGATTTTGTGTATATACTAATGAAGGGCGGCACAACGCTGATTAGC

GGCTTGCGCCTGAGAATGGCATTTGCGTCGTCGTGTGCGGCACAAAGAACAAAGAAGAGGT

TTTGACTC

ATG ACA GAT AAA CGC AAA GAT GGC TCG GGC AAA TTG TTG TAC TGC TCT TTT

TGC GGC AAA AGC CAG CAT GAA GTG CGC AAG CTG ATT GCC GGT CCA TCC GTG

TAT ATC TGC GAC GAA TGC GTC GAT TTA TGT AAC GAC ATT ATT CGC GAA GAA

ATT AAA GAA GTT GCT CCG CAC CGT GAA CGT AGT GCG CTG CCG ACG CCG CAT

GAA ATT CGT ACC CAC CTG GAC GAT TAC GTT ATC GGC CAG GAG CAG GCG AAA

AAA GTG CTG GCG G*G GCG GTC TAT AAC CAC TAC AAG CGT CTG CGT AAC GGC

GAT ACC AGC AAT GGC GTC GAG TTA GGT AAA AGC AAC ATT CTG CTG ATT GGA

CCG ACC GGT TCC GGT AAA ACG CTG CTG GCG GAA ACG CTG GCG CGC TTG CTG

GAT GTG CCG TTC ACT ATG GCG GAT GCG ACC ACG CTA ACC GAA GCG GGT TAC

GTT GGT GAA GAC GTC GAG AAT ATC ATT CAG AAA CTG TTG CAG AAA TGC GAC

TAC GAC GTG CAA AAA GCG CAG CGT GGG ATT GTC TAC ATT GAT GAA ATC GAT

AAG ATT TCG CGT AAA TCA GAC AAT CCG TCC ATT ACC CGC GAT GTT TCC GGC

GAA GGC GTA CAG CAG GCG TTG CTG AAA CTG ATC GAA GGC ACC GTC GCC GCG

GTT CCA CCG CAG GGC GGT CGC AAA CAT CCG CAG CAG GAG TTC TTA CAG GTA

GAT ACC TCT AAG ATT CTG TTT ATC TGC GGC GGC GCG TTT GCC GGT CTG GAT

AAA GTG ATC GCT AAC CGT GTT GAA ACC GGC TCC GGC ATT GGT TTT GGC GCG

ACG GTG AAA GCG AAG TCC GAC AAA GCC AGC GAA GGC GAG CTG TTG TCG CAG

GTT GAA CCG GAA GAT TTG ATC AAA TTT GGT CTG ATT CCT GAG TTT ATC GGT

CGT CTG CCA GTG GTA GCG ACG CTG AAT GAA CTC AGC GAA GAA GCG CTG ATT

CAA ATC CTG AAA GAG CCG AAA AAT GCG CTG ACC AAG CAG TAT CAG GCG CTG

TTT AAC CTG GAA GGC GTC GAT CTG GAA TTC CGT GAC GAA GCG CTG GAC GCT

ATC GCC AGG AAA GCA ATG GCG CGT AAA ACC GGC GCC CGT GGC CTG CGT TCT

ATC GTC GAA GCG GCG CTG CTG GAT ACC ATG TAC GAT TTG CCA TCT ATG GAA

GAC GTC GAA AAA GTG GTG ATC GAC GAG TCC GTT ATT GCC GGT CAG AGT AAG

CCG TTG CTG ATT TAC GGC AAA CCG GAA GCG CAG GCT TCT GGC GAA TAA

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier pasteur.fr.

clpP - clpX sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.