alr - tyrB sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.

ATG CAA GCG GCA ACT GTT GTG ATT AAC CGC CGC GCT CTG CGA CAC AAC CTG

CAA CGT CTT CGT GAA CTG GCC CCT GCC AGT AAA ATG GTT GCG GTG GTG AAA

GCG AAC GCT TAT GGT CAC GGT CTT CTT GAG ACC GCG CGA ACG CTC CCC GAT

GCT GAC GCC TTT GGC GTA GCC CGT CTC GAA GAA GCT CTG CGA CTG CGT GCG

GGG GGA ATC ACC AAA CCT GTA CTG TTA CTC GAA GGC TTT TTT GAT GCC AGA

GAT CTG CCG ACG ATT TCT GCG CAA CAT TTT CAT ACC GCC GTG CAT AAC GAA

GAA CAG CTG GCT GCG CTG GAA GAG GCT AGC CTG GAC GAG CCG GTT ACC GTC

TGG ATG AAA CTC GAT ACC GGT ATG CAC CGT CTG GGC GTA AGG CCG GAA CAG

GCT GAG GCG TTT TAT CAT CGC CTG ACC CAG TGC AAA AAC GTT CGT CAG CCG

GTG AAT ATC GTC AGC CAT TTT GCG CGC GCG GAT GAA CCA AAA TGT GGC GCA

ACC GAG AAA CAA CTC GCT ATC TTT AAT ACC TTT TGC GAA GGC AAA CCT GGT

CAA CGT TCC ATT GCC GCG TCG GGT GGC ATT CTG CTG TGG CCA CAG TCG CAT

TTT GAC TGG GTG CGC CCG GGC ATC ATT CTT TAT GGC GTC TCG CCG CTG GAA

GAT CGC TCC ACC GGT GCC GAT TTT GGC TGT CAG CCA GTG ATG TCA CTA ACC

TCC AGC CTG ATT GCC GTG CGT GAG CAT AAA GCC GGA GAG CCT GTT GGT TAT

GGT GGA ACC TGG GTA AGC GAA CGT GAT ACC CGT CTT GGC GTA GTC GCG ATG

GGC TAT GGC GAT GGT TAT CCG CGC GCC GCG CCG TCC GGT ACG CCA GTG CTG

GTG AAC GGT CGC GAA GTA CCG ATT GTC GGG CGC GTG GCG ATG GAT ATG ATC

TGC GTA GAC TTA GGT CCA CAG GCG CAG GAC AAA GCC GGG GAT CCG GTC ATT

TTA TGG GGC GAA GGT TTG CCC GTA GAA CGT ATC GCT GAA ATG ACG AAA GTA

AGC GCT TAC GAA CTT ATT ACG CGC CTG ACT TCA AGG GTC GCG ATG AAA TAC

GTG GAT TAA

TCGTTCTGTAATATTTGATTGTCTGTGCCGGATGCGGCGTGAATGCCTTATCCGGCCAATA

AAATCCTAAAAATTCAATAAGTTGATGTTCTTTCATGCTCTTATAAAGGTCGTGCCTCTGG

CGGATGTACGTTTGTCATGAGTCTCACTCTGTTGCTAATTGCCGTTCGCTCCTGAACATCC

ACTCGATCTTCGCCTTCTTCCGGTTTATTGTGTTTTAACCACCTGCCCGTAAACCTGGAGA

ACCATCGC

GTG TTT CAA AAA GTT GAC GCC TAC GCT GGC GAC CCG ATT CTT ACG CTT ATG

GAG CGT TTT AAA GAA GAC CCT CGC AGC GAC AAA GTG AAT TTA AGT ATC GGT

CTG TAC TAC AAC GAA GAC GGA ATT ATT CCA CAA CTG CAA GCC GTG GCG GAG

GCG GAA GCG CGC CTG AAT GCG CAG CCT CAT GGC GCT TCG CTT TAT TTA CCG

ATG GAA GGG CTT AAC TGC TAT CGC CAT GCC ATT GCG CCG CTG CTG TTT GGT

GCG GAC CAT CCG GTA CTG AAA CAA CAG CGC GTA GCA ACC ATT CAA ACC CTT

GGC GGC TCC GGG GCA TTG AAA GTG GGC GCG GAT TTC CTG AAA CGC TAC TTC

CCG GAA TCA GGC GTC TGG GTC AGC GAT CCT ACC TGG GAA AAC CAC GTA GCA

ATA TTC GCC GGG GCT GGA TTC GAA GTG AGT ACT TAC CCC TGG TAT GAC GAA

GCG ACT AAC GGC GTG CGC TTT AAT GAC CTG TTG GCG ACG CTG AAA ACA TTA

CCT GCC CGC AGT ATT GTG TTG CTG CAT CCA TGT TGC CAC AAC CCA ACG GGT

GCC GAT CTC ACT AAT GAT CAG TGG GAT GCG GTG ATT GAA ATT CTC AAA GCC

CGC GAG CTT ATT CCA TTC CTC GAT ATT GCC TAT CAA GGA TTT GGT GCC GGT

ATG GAA GAG GAT GCC TAC GCT ATT CGC GCC ATT GCC AGC GCT GGA TTA CCC

GCT CTG GTG AGC AAT TCG TTC TCG AAA ATT TTC TCC CTT TAC GGC GAG CGC

GTC GGC GGA CTT TCT GTT ATG TGT GAA GAT GCC GAA GCC GCT GGC CGC GTA

CTG GGG CAA TTG AAA GCA ACA GTT CGC CGC AAC TAC TCC AGC CCG CCG AAT

TTT GGT GCG CAG GTG GTG GCT GCA GTG CTG AAT GAC GAG GCA TTG AAA GCC

AGC TGG CTG GCG GAA GTA GAA GAG ATG CGT ACT CGC ATT CTG GCA ATG CGT

CAG GAA TTG GTG AAG GTA TTA AGC ACA GAG ATG CCA GAA CGC AAT TTC GAT

TAT CTG CTT AAT CAG CGC GGC ATG TTC AGT TAT ACC GGT TTA AGT GCC GCT

CAG GTT GAC CGA CTA CGT GAA GAA TTT GGT GTC TAT CTC ATC GCC AGC GGT

CGC ATG TGT GTC GCC GGG TTA AAT ACG GCA AAT GTA CAA CGT GTG GCA AAG

GCG TTT GCT GCG GTG ATG TAA

Back to the table of contents

Please send questions and comments to Sophie.Bachellier@pasteur.fr.

alr - tyrB sequence

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured : BOCEs and boxC, BIMEs and PUs , IRUs, RSAs and 29 bp repeats.

Intergenic regions are in italics. The following repeats are coloured :
BOCEs and boxC,
BIMEs and PUs ,
IRUs,
RSAs and 29 bp repeats.