Madagascar : 180 souches identifiées.
- ALPHAVIRUS
- Babanki : 13 souches identifiées.
- HOMME : 3 souches
- Mammifères : 3 souches
- Moustiques : 7 souches
- FLAVIVIRUS
- Wesselsbron : 1 souche identifiée.
- West Nile : 80 souches identifiées.
- HOMME : 14 souches
- Oiseaux : 11 souches
- Moustiques : 55 souches
- Dakar Bat : 11 souches identifiées.
- Mammifères : 10 souches
- Moustiques : 1 souche
- BUNYAVIRUS
- PHLEBOVIRUS
- RVF (Zinga) : 28 souches identifiées.
- HOMME : 4 souches
- Mammifères : 17 souches
- Moustiques : 7 souches
- NAIROVIRUS
- Congo : 5 souches identifiées.
- ORBIVIRUS
- RHABDOVIRUS
- Perinet : 6 souches identifiées.
- Moustiques : 5 souches
- Autres Insectes : 1 souche
- NON CLASSES
- SOUCHE MIXTE
- AUTRES VIRUS
- Mengo : 17 souches identifiées.
- HOMME : 1 souche
- Mammifères : 1 souche
- Moustiques : 15 souches