HOMME : 639 souches identifiées.
- ALPHAVIRUS
- Semliki Forest, 21 souches identifiées : RCA (21).
- Chikungunya, 56 souches identifiées : Origine africaine inconnue (2), Cameroun (2), Côte d'Ivoire (2), RCA (13), Sénégal (37).
- Igbo Ora, 9 souches identifiées : Origine africaine inconnue (1), Côte d'Ivoire (6), RCA (2).
- Sindbis, 2 souches identifiées : Origine africaine inconnue (2).
- Babanki, 6 souches identifiées : Cameroun (1), Madagascar (3), RCA (2).
- Middelburg, 2 souches identifiées : Origine africaine inconnue (2).
- FLAVIVIRUS
- Wesselsbron, 17 souches identifiées : Côte d'Ivoire (1), RCA (12), Sénégal (4).
- Usutu, 1 souche identifiée : RCA (1).
- West Nile, 23 souches identifiées : Madagascar (14), RCA (7), Sénégal (2).
- Koutango, 1 souche identifiée : Sénégal (1).
- Yellow Fever, 159 souches identifiées : Burkina Faso (54), Cameroun (1), Côte d'Ivoire (28), Ethiopie (6), Liberia (2), Mali (4), Mauritanie (1), RCA (3), Sénégal (60).
- Zika, 10 souches identifiées : RCA (1), Sénégal (9).
- Spondweni, 1 souche identifiée : Cameroun (1).
- Kedougou, 1 souche identifiée : RCA (1).
- Dengue 1, 2 souches identifiées : Sénégal (2).
- Dengue 2, 6 souches identifiées : Côte d'Ivoire (1), Sénégal (5).
- Dengue 4, 3 souches identifiées : Sénégal (3).
- BUNYAVIRUS
- Bunyamwera, 1 souche identifiée : Sénégal (1).
- Ilesha, 22 souches identifiées : Cameroun (2), Madagascar (1), RCA (11), Sénégal (8).
- Shokwe, 1 souche identifiée : Côte d'Ivoire (1).
- Ngari, 3 souches identifiées : Sénégal (3).
- Bwamba, 8 souches identifiées : Cameroun (2), RCA (6).
- Tanga, 1 souche identifiée : Burkina Faso (1).
- Nyando, 1 souche identifiée : RCA (1).
- PHLEBOVIRUS
- RVF (Zinga), 232 souches identifiées : Madagascar (4), Mauritanie (213), RCA (12), Sénégal (3).
- NAIROVIRUS
- Congo, 12 souches identifiées : Burkina Faso (1), Mauritanie (6), RCA (1), Sénégal (4).
- Dugbe, 3 souches identifiées : RCA (3).
- BUNYAVIRUS-LIKE
- Kasokero, 1 souche identifiée : Sénégal (1).
- Tataguine, 17 souches identifiées : Cameroun (1), RCA (7), Sénégal (9).
- Bangui, 1 souche identifiée : RCA (1).
- ORBIVIRUS
- Orungo, 1 souche identifiée : Sénégal (1).
- RHABDOVIRUS
- Le Dantec, 1 souche identifiée : Sénégal (1).
- NON CLASSES
- Somone, 1 souche identifiée : RCA (1).
- SOUCHE MIXTE
- AUTRES VIRUS
- Herpes, 1 souche identifiée : RCA (1).
- Coxsackie B4, 1 souche identifiée : RCA (1).
- Coxsackie B5, 1 souche identifiée : Cameroun (1).
- Mengo, 8 souches identifiées : Côte d'Ivoire (4), Madagascar (1), RCA (3).