Collection des Champignons


  RESPONSABLEPAPIEROK Bernard / papierok@pasteur.fr
  MEMBRESDr KIREDJIAN Martine

  Rapport d'activité

Partie intégrante du Centre de Ressources Biologiques de l’Institut Pasteur, la Collection des Champignons entretient en culture près de 2500 souches de champignons ou d’Actinomycètes, isolées pour la plupart de lésions humaines. L’année 2006 a été marquée par le renouvellement de la certification ISO 9001 version 2000. Aux activités de collection proprement dites s’ajoutent des activités de recherche et d’expertise dans le domaine de la systématique, de la spécificité parasitaire et de l’écologie des champignons entomopathogènes.

La Collection des Champignons est un service spécialisé chargé d’entretenir et d’enrichir un ensemble de près de 2500 souches de champignons (filamenteux et levures) et d’Actinomycètes, isolées pour la majorité d’entre elles de lésions humaines. Selon les cas, ces souches ont été isolées de mycoses superficielles (peau et muqueuses), de mycoses sous-cutanées ou de mycoses profondes. Remarquablement varié à cet égard, cet ensemble comporte en outre des souches isolées de l’environnement (milieu aérien, sol, matières végétales en décomposition) ou d’invertébrés (insectes). Les missions du service sont fondamentalement celles d’une collection de microorganismes ; s’y greffe une activité de recherche et d’expertise liée à l’existence d’un matériel original, récolté le plus souvent directement par le personnel de la Collection.

Activités de collection

L’activité première du laboratoire est de conserver des souches fongiques en culture pure et contrôlée, et de les délivrer aux laboratoires de recherche académique ou industrielle, aux laboratoires d’analyses et aux établissements d’enseignement qui en font la demande. Quelque 500 souches ont ainsi été distribuées en 2006, soit sous forme de cultures lyophilisées, soit sous forme de culture sur pente à un état de croissance et de fructification optimal. Cette seconde forme est notamment mise à disposition pour les travaux pratiques des établissements d’enseignement, qu’ils soient de niveau secondaire ou de niveau supérieur. La Collection des Champignons réalise en outre des expertises, avec l’identification de souches isolées de l’environnement : contaminants de process industriels, de milieux ambiants, etc.

La Collection des Champignons est enregistrée sous le numéro 344 avec l’acronyme UMIP dans le World Directory of Collections of Cultures of Micro-organisms (WDCM).

Démarche Qualité

Pour toutes les activités de collection proprement dites, une démarche qualité et un plan d’organisation associé ont été mis en œuvre, la Collection des Champignons étant dès l’origine partie intégrante du Centre de Ressources Biologiques de l’Institut Pasteur (CRBIP).

Les efforts réalisés dans ce domaine au cours des dernières années ont abouti à la certification ISO 9001 version 2000, délivrée par l’Association Française d’Assurance Qualité en mars 2005 et renouvelée en avril 2006. Cette certification porte sur l’acquisition, la production, la conservation et la distribution de matériels biologiques. Fort de ce résultat, la Collection des Champignons a entrepris cette année la validation des méthodes de caractérisation/contrôle phénotypiques et moléculaires qu’elle utilise, cela de manière à se conformer aux recommandations de l’Organisation pour la Coopération et le Développement Économique (OCDE) relatives au fonctionnement des centres de ressources biologiques.

Recherche et expertise sur les champignons entomopathogènes

L’expertise acquise par le personnel de la Collection dans le domaine de la systématique, de la spécificité parasitaire et de l’écologie des champignons entomopathogènes concerne notamment le groupe des Entomophthorales (Zygomycètes). Elle est mise à profit dans le cadre de projets de recherche avec des chercheurs de l’INRA ou de collaborations établies soit avec des entomologistes français en poste dans des pays tropicaux (Brésil, Kenya), soit avec des entomologistes étrangers (Autriche, Pologne).

Mots-clés: Mycologie, Collection de souches, qualité, CRB, Entomophthorales, systématique

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An adult Diptera killed by an Entomophthorale



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