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     Epidémiologie des Maladies émergentes


  Responsable : FONTANET Arnaud (fontanet@pasteur.fr)


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L'unité de recherche et d'expertise en épidémiologie des maladies émergentes a été créée le 1er juillet 2001. Les principaux thèmes de recherche de l'unité sont 1) les modes de transmission et les moyens de prévention des infections à agents pathogènes émergents et 2) la recherche clinique, avec notamment les cohortes d'histoire naturelle et les essais thérapeutiques. La majeure partie des projets de l'unité est réalisée dans les pays en développement, de préférence en collaboration avec les instituts du Réseau International des Instituts Pasteur et des Instituts Associés, et concerne l'épidémiologie du VIH, du virus de l'hépatite C (VHC), du virus de l'hépatite B (VHB), du coronavirus du SRAS, et du virus de la dengue.



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Introduction

L'unité de recherche et d'expertise en épidémiologie des maladies émergentes a été créée le 1er juillet 2001.

Les principaux thèmes de recherche de l'unité sont 1) les modes de transmission et les moyens de prévention des infections à agents pathogènes émergents et 2) la recherche clinique, avec notamment les cohortes d'histoire naturelle et les essais thérapeutiques concernant le traitement des infections par le VIH, le VHC, et le VHB. " Agents pathogènes émergents " est pris au sens large du terme, à savoir les agents récemment apparus sous forme épidémique en population humaine (par exemple, le VIH et le coronavirus du SRAS), les agents récemment identifiés (par exemple, le VHC), et les agents ayant récemment gagné de nouvelles zones géographiques (par exemple, virus de la dengue).

Le travail d'expertise de l'unité consiste à contribuer à la réflexion stratégique de l'IP dans des domaines où l'épidémiologie joue un rôle prépondérant, à apporter un soutien méthodologique en épidémiologie et biostatistiques aux autres unités de l'IP, et à participer aux activités d'enseignement de l'épidémiologie au sein du campus et dans les instituts du réseau. Dans cette perspective, un effort important a été consacré à la préparation d'un enseignement en épidémiologie et biostatistiques au sein de l'Ecole Pasteurienne d'Infectiologie, et au développement d'un plan de formation en recherche clinique pour les instituts du réseau.

La majeure partie des projets de l'unité est réalisée dans les pays en développement, de préférence en collaboration avec les instituts du Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP).

Projets en cours

1) Épidémiologie et traitement des infections par le VHC en Égypte (A. Fontanet et A. Paez)

L'Égypte est le pays où la prévalence de l'infection par le VHC est la plus élevée au monde, atteignant 45% chez les plus de 40 ans en zone rurale. Le nombre de personnes infectées par le VHC a été estimé à huit millions en 1999 (Ministère de la Santé Égyptien). L'origine d'une telle épidémie est attribuée au traitement de masse de la bilharziose par injections intraveineuses dans les années 1960-1982.

Ce projet, dont A. Fontanet et M.K. Mohamed sont les responsables scientifiques, vient d'obtenir une deuxième phase de financement (2006-8) par l'ANRS (projet d'épidémiologie génétique en collaboration avec Laurent Abel, INSERM U550 et étude des hépatites aiguës C au Caire) et par le Wellcome Trust (étude des interactions entre hépatite C et athérosclérose en collaboration avec Nishi Chaturvedi, Imperial College, Londres). Le projet est articulé autour de deux sites d'étude : 1) une cohorte villageoise de 4000 participants au nord-ouest du Caire, et 2) un système de surveillance des hépatites aiguës C au Caire.

2) Projet EPISARS : prévention de la réémergence du SRAS (Coordination : A. Fontanet et L. Baril).

Dans les suites de l'épidémie du SRAS en Chine, un projet financé conjointement par la Commission Européenne, le ministère des Affaires Etrangères français, et le Ministry of Sciences and Technology chinois a été mis en place pour prévenir la ré-émergence du SRAS. Les objectifs du projet sont l'identification du réservoir animal du SRAS, la prévention de sa réémergence en population humaine, et le suivi clinique et immunologique d'une cohorte de patients convalescents de l'épidémie de 2003 à Pékin. Le travail sur la recherche du réservoir animal se fait en étroite collaboration avec le Museum National d'Histoire Naturelle (G. Véron), et l'Agence Française de Sécurité des Aliments (F. Moutou). Nos autres partenaires à l'Institut Pasteur sont la CIBU (JC Manuguerra) et le Centre Pasteur de Hong-Kong (R. Altmeyer).

3) Essai randomisé de traitement de l'hépatite chronique B au Sénégal (Coordination : M. Vray et P.S. Mbaye).

L'infection par l'hépatite B est un problème majeur de santé publique au Sénégal avec une prévalence de sujets porteurs de l'AgHBs supérieure à 15 %. Le but du projet est d'évaluer une stratégie thérapeutique pragmatique applicable au Sénégal ou autres PED pour les patients relevant d'un traitement. L'objectif d'HEPADAK 2, étude randomisée, sans insu, est d'évaluer l'efficacité d'une stratégie thérapeutique associant LAM et vaccin thérapeutique (12 injections Engerix B en intradermique sur 6 mois) sur le contrôle de la réplication virale chez des patients porteurs d'une infection HBV réplicative avec perturbation des transaminases par rapport à un groupe sous Lamivudine seule. Les patients seront ensuite traités pendant une période de 1 an et suivis une année supplémentaire sans traitement dans le cadre du protocole puis pris en charge dans le cadre du programme national. Ce projet se fait en étroite collaboration avec l'Institut Pasteur de Dakar, et est financé par l'ANRS. L'étude a démarré en septembre 2005.

4) DENFRAME : ‘Innovative Diagnostic Tools and therapeutic approaches for dengue disease'. (Coordination: L Baril et P Despres).

La dengue est une pathologie virale à transmission vectorielle (Aedes) présente en milieu tropical. L'OMS estime le nombre de cas annuel autour de 100 millions et environ 50000 décès. Ce projet DENFRAME est financé par la CE (FP6-2003-INCO-DEV2) pour 3 années (Nov 2005-Oct 2008). Treize institutions sont impliquées dont 5 institutions du RIIP (IP Paris, IP Ho Chi Minh Ville, IP Cambodge, Centre Pasteur de Hong Kong et IP de la Guyane). La mise en place d'une étude clinique incluant les familles de patients ayant une dengue prouvée est en cours dans 4 pays (Cambodge, Vietnam, Brésil et Guyane). L'objectif est de connaître le profil immunologique, en particulier l'immunité innée, des personnes ayant une dengue symptomatique et des personnes infectées mais peu ou pas symptomatiques afin de mieux comprendre les mécanismes physiopathologiques qui conduisent à des formes hémorragiques létales. Le projet a également un versant qui concerne l'amélioration des outils du diagnostic virologique et une approche de développement thérapeutique antivirale.

5) Immunogénicité des vaccins du Programme Elargi de Vaccination (PEV) chez les enfants infectés par le VIH en Afrique (Coordination : L. Baril, I. Gouandjika, M.C. Teijokem).

Ce projet a pour objectif principal d'évaluer la réponse aux vaccins utilisés dans le PEV chez les enfants infectés par le VIH-1 par transmission verticale de la mère à l'enfant et de les comparer à des enfants non infectés par le VIH-1 en Afrique sub-saharienne. Le projet a été conduit dans le cadre d'une Action Concertée des Instituts Pasteur (ACIP) en collaboration avec le Centre Pasteur du Cameroun et l'Institut Pasteur de Bangui. Les résultats ont montré une moins bonne réponse des enfants infectés par le VIH sur l'ensemble des valences vaccinales ce qui pourrait conduire à un renforcement du calendrier vaccinal chez ces enfants. Une deuxième phase incluant un suivi prospectif des enfants infectés par le VIH est envisagée au Cameroun afin de confirmer ces premiers résultats (recherche de soutien financier en cours).

6) Réponse au traitement anti-rétroviral au Cambodge (A. Fontanet et Y. Madec)

Ce projet s'effectue en collaboration avec Médecins Sans Frontières (MSF) et Epicentre et repose sur les données du programme d'accès aux soins de MSF pour les patients infectés par le VIH à Phnom Penh (Cambodge). L'analyse des données de cette cohorte de patients permet d'étudier l'efficacité des trithérapies dans le contexte des pays en développement.

7) Modélisation mathématique de la transmission du VIH en Afrique sub-Saharienne (M. Garenne, P. Leclerc et A. Matthews)

Les pays d'Afrique sub-Saharienne comptabilisent plus de 80% des décès attribuables au VIH/SIDA. Dans certaines régions du sud de l'Afrique, près de 50% des femmes sont infectées à l'âge de 25 ans. De tels pourcentages ne sont pas compatibles avec les données épidémiologiques disponibles concernant les taux de transmission par rapport sexuel à risque, et le nombre de partenaires cumulé par femme. Des approches innovantes seront testées en modélisation pour tenter de reproduire par simulation le profil épidémique retrouvé dans ces régions.

Mots-clés: épidémiologie, recherche clinique, pays en développement, VIH, VHC, VHB, SRAS, dengue



  publications

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  personnel

  Secrétariat Chercheurs Stagiaires Autre personnel
  Thépaut Sylvana, IP, sthepaut@pasteur.fr

Marie-Anne Lin (projet SRAS), IP, lin@pasteur.fr

Fontanet Arnaud, IP, fontanet@pasteur.fr

Baril Laurence, IP, baril@pasteur.fr

Garenne Michel, IRD, mgarenne@pasteur.fr

Vray Muriel, INSERM, vray@pasteur.fr

Lefrançois Rémi, interne de santé publique, remaille@pasteur.fr

Leclerc Pauline, étudiante en doctorat de santé publique, modélisation VIH Afrique du Sud, leclerc@pasteur.fr

Paez Adela, étudiante en doctorat d’épidémiologie, hépatite C Egypte.

Matias Gonçalo, M2 épidémiologie, ulcère du Buruli Cameroun.

Nicolay Nathalie, M2 épidémiologie, hépatite C Egypte.

Lydie Beniguel, moniteur d’étude clinique, beniguel@pasteur.fr

Marie-Hélène Chang, assistante base de données, mhchang@pasteur.fr

Chartier Loïc, IP, responsable base de données, chartier@pasteur.fr

Madec Yoann; IP, biostatisticien, ymadec@pasteur.fr


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