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     Collection des Champignons


  Responsable : Bernard PAPIEROK (papierok@pasteur.fr)


  resume

 

Partie intégrante du Centre de Ressources Biologiques de l'Institut Pasteur, la Collection des Champignons entretient en culture près de 2500 souches de champignons ou d'Actinomycètes, isolées pour la plupart de lésions humaines. L'année 2005 a été marquée par l'obtention de la certification ISO 9001 version 2000. Aux activités de collection proprement dites s'ajoutent des investigations sur la systématique des Entomophthorales pathogènes d'insectes, en relation avec l'existence d'un important matériel original.



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La Collection des Champignons est un service spécialisé chargé d'entretenir et d'enrichir un ensemble de près de 2500 souches de champignons (filamenteux et levures) et d'Actinomycètes, isolées pour la majorité d'entre elles de lésions humaines. Selon les cas, ces souches ont été isolées de mycoses superficielles (peau et muqueuses), de mycoses sous-cutanées ou de mycoses profondes. Remarquablement varié à cet égard, cet ensemble comporte en outre des souches isolées de l'environnement (milieu aérien, sol, matières végétales en décomposition) ou d'invertébrés (insectes). Les missions du service sont fondamentalement celles d'une collection de microorganismes ; s'y greffe une activité de recherche liée à l'existence de souches originales directement récoltées par le personnel de la Collection.

Activités de collection

L'activité première du laboratoire est de conserver des souches fongiques en culture pure et contrôlée, et de les délivrer aux laboratoires de recherche académique ou industrielle, aux laboratoires d'analyses et aux établissements d'enseignement qui en font la demande. Quelque 600 souches ont ainsi été distribuées en 2005, soit sous forme de cultures lyophilisées, soit sous forme de culture sur pente à un état de croissance et de fructification optimal. La Collection des Champignons a notamment fourni une partie des isolats utilisés dans les travaux pratiques du Cours de Mycologie Médicale 2005 de l'Institut Pasteur. Elle a également préparé les cultures fongiques pour le Cours de Mycologie Médicale de l'Institut d'Infectiologie de Berne (Suisse). Elle réalise en outre des expertises, avec l'identification de souches isolées de l'environnement : contaminants de process industriels, de milieux ambiants, etc.

La Collection des Champignons est enregistrée sous le numéro 344 avec l'acronyme UMIP dans le World Directory of Collections of Cultures of Micro-organisms (WDCM).

Démarche Qualité et certification

Pour toutes les activités de collection proprement dites, une démarche qualité et un plan d'organisation associé ont été mis en œuvre, la Collection des Champignons étant dès l'origine partie intégrante du Centre de Ressources Biologiques de l'Institut Pasteur (CRBIP).

Les efforts réalisés dans ce domaine au cours des dernières années ont abouti à la certification ISO 9001 version 2000, délivrée par L'Association Française d'Assurance Qualité en juillet 2005. Cette certification porte sur l'acquisition, la production, la conservation et la distribution de matériels biologiques. Forts de ce résultat, le CRBIP, et donc la Collection des Champignons, sont maintenant passés à l'étape suivante, qui est l'obtention de l'accréditation suivant la norme NF17025. La réalisation de cette nouvelle étape implique la validation des méthodes d'identification utilisées.

Systématique et spécificité parasitaire des Entomophthorales pathogènes d'insectes

L'année précédente a vu une collaboration s'établir avec Cezary TKACZUK (Katedra Ochrony Roslin, Akademia Podlaska, Siedlce, Pologne) à propos d'une espèce d'Entomophthorale (Zygomycètes) récoltée en juin 2004 sur une espèce de Coléoptère chrysomélide (à la fois sur larves et sur adultes) dans l'est de la Pologne. Il s'agit d'une espèce de Zoophthora, genre dont la majorité des espèces infectent des Hémiptères ou des Lépidoptères. L'espèce trouvée en Pologne se distingue des espèces de ce genre connues à ce jour au niveau notamment des conidies primaires et des conidies secondaires de type capillaire. D'une manière intéressante, ce matériel est présentement comparé à celui trouvé en mai 2005 sur une autre espèce de Coléoptère dans le centre de la France, cette fois uniquement sur larves. Ces investigations devraient aider à cerner davantage les limites de la spécificité parasitaire d'un groupe de champignons remarquable par le rôle efficace d'ennemi naturel qu'il joue à l'égard des populations de nombreux insectes.

Mots-clés: Mycologie, Collection de souches, qualité, CRB, Entomophthorales, systématique



  publications

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  personnel

  Secrétariat Chercheurs Stagiaires Autre personnel
  KIREDJIAN, Martine, Chef de laboratoire à l’Institut Pasteur, mkiredji@pasteur.fr

PAPIEROK, Bernard, Chef de laboratoire à l’Institut Pasteur, papierok@pasteur.fr

COURBON, Céline, Étudiante en Master Professionnel

OLIVIER, Grazziella, Élève en Certificat d’Aptitude Professionnelle

  PIETFROID, Alain, Technicien supérieur de laboratoire

ROUFFAUD, Marie-Ange, Assistant-Ingénieur CNRS


Rapports d'activité 2005 - Institut Pasteur
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