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     Genomics (Platform)


  Director : Bouchier Christiane (bouchier@pasteur.fr)


  abstract

 

Genomic platform (PF1) realize large-scale projects with several teams of Pasteur Institute as part of Genopole programm on Microbiology initiated by the Ministry of Education and Research. Genomic projects have been selected by a steering committee. These projects have been realized following a automation-based protocol. Genomic Platform belongs to Structure and dynamic of genomes department.



  report

cale

Situation at 10 january 2005

Projects completed since 2000

  • Complete genomic sequence of Candida glabrata (13 Mb)
  • Bernard Dujon - Unite de Génétique Moléculaire des Levures
  • Comparative Genomic - Tuberculosis complex
  • Karin Eiglmeier - Thierry Garnier - Unité de Génétique Moléculaire Bactérienne
  • Genome sequencing of Mycobacterium ulcerans
  • Timothy Stinear - Unité de Génétique Moléculaire Bactérienne
  • Genome sequencing of Legionella pneumophila strain Paris and strain Lens
  • Carmen Buchrieser - Laboratoire de Génomique des Microorganismes Pathogènes
  • PCR products sequencing - ORF of Helicobacter pylori
  • Agnés. Labigne - Unité de Pathogénie Bactérienne des Muqueuses
  • Molecular evolution of snake venom enzymes
  • Valérie Choumet - Unite des Venins
  • EST sequencing of Aspergillus nidulans
  • Christophe d'Enfert - Unite Biologie et Pathogénicité Fongiques
  • EST sequencing of Entamoeba histolytica
  • Nancy Guillen - Unité postulante de Biologie Cellulaire du Parasitisme
  • EST sequencing of Plasmodium yoelli
  • George Snounou - Unité de Parasitologie Biomédicale
  • EST sequencing of Theileria annulata
  • Gordon Langsley - Laboratoire de Signalisation Immunoparasitaire
  • Multilocus Sequence Typing of Candida albicans strains
  • Christophe d'Enfert - Unite Biologie et Pathogénicité Fongiques

Current projects

  • Molecular typing of CIP Bacteria strains
  • Chantal Bizet - Collection
  • Allelic diversity of Plasmodium falciparum
  • Odile Puijalon - Unité d'Immunologie Moléculaire des Parasites
  • Complete genomic sequence of Microcystis aeruginosa (4,6 Mb)
  • Nicole Tandeau de Marsac - Unité des Cyanobactéries
  • Genome sequencing of Vibrio lentus (souche Mel 32)
  • Didier Mazel - Unité Postulante Plasticité du Génome bactérien
  • Genome sequencing of Leptospira biflexa
  • Mathieu Picardeau - Unité de Bactériologie moléculaire et médicale
  • Genome sequencing of Streptococcus gallolyticus NEM2135
  • Patrick Trieu-Cuot- Laboratoire mixte IP-Necker de recherche sur les streptocoques et streptococcies
  • Genome sequencing of Helicobacter pylori (associée à un lymphome du MALT)
  • Agnés Labigne - Unité de Pathogénie bactérienne des muqueuses

Keywords: High-throughput sequencing, Genome, Sequence analysis



  web site

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  publications

puce Publications 2004 of the unit on Pasteur's references database


  personnel

  Office staff Researchers Scientific trainees Other personnel
  Saint-Martin Françoise martinf@pasteur.fr     Ma Laurence technicien sup

Magnier Arnaud technicien sup

Lavenir Rachel technicien sup, détachée du CRBIP

Tichit Magali technicienne de laboratoire

Zidane Nora technicien sup


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