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     Génétique des biofilms - URA CNRS2172


  Responsable : Jean-Marc GHIGO (jmghigo@pasteur.fr)


  resume

 

Les populations de microorganismes fixés sur une surface sont appelées biofilms. Fréquemment nuisible en milieux industriel et médical, le contrôle du biofilm représente à la fois un enjeu de santé publique et un enjeu économique. Notre objectif est d'identifier les facteurs cellulaires impliqués dans la formation des biofilms. La mise en évidence de tels facteurs devrait contribuer à une meilleure compréhension de ce mode de vie et aboutir au développement de stratégies de contrôle du biofilm.



  rapport

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Etude de la formation de biofilms chez les bactéries.

Travaux réalisés en 2004

I- Identification de nouvelles adhésines chez la bactérie Escherichia coli

Nous avons développé une méthode qui combine la technique de recombinaison d'ADN linéaire à l'aide des fonctions du phage λ avec l'insertion dirigée d'une cassette de répression/expression plaçant ainsi un promoteur pBAD fonctionnel devant le gène cible, directement sur le chromosome bactérien. Cette méthode permet à la fois l'inactivation d'un gène et la modulation fine de son expression.Nous avons utilisée cette stratégie pour explorer le rôle de gènes de fonctions inconnus codant potentiellement pour des adhésines de surfaces. Nous avons ainsi montré que l'expression de yfaL, yeeJ, ypjA et ycgV contribue au potentiel d'adhésion de la bactérie Escherichia coli. Cette approche rapide peut être utilisée chez de nombreuses entérobactéries pour étudier la fonctions de gènes inconnus ou cryptiques lors d'étude post-génomiques.

Roux, A, Beloin, C. and Ghigo, J.M. A combined inactivation/expression strategy to study gene function in physiological conditions: application to the identification of new adhesins in E. coli. J. Bacteriol. In press

II- Analyse moléculaire de la formation des biofilms chez la levure Candida glabrata

Dans le cadre d'un Programme Transversal de Recherche (PTR) avec le groupe de Françoise Dromer (Guilhem Janbon) (Unité Postulante de Mycologie Moléculaire) et Christophe d'Enfert (Unité Postulante Biologie et Pathogénicité Fongique) un crible génétique à été développé, menant à l'identification d'une nouvelle adhésine, Epa6p chez la levure pathogène Candida glabrata. Nous avons démontré que l'expression de Epa6 est régulée à la fois par les conditions de vie en biofilm et la kinase Yak1p selon une voie de régulation faisant intervenir la machinerie de répression sub-telomérique

Iraqui,I. ;Aubert, S. ;Dromer, F. ; Ghigo, J.M. D'enfert, C. And G. Janbon Epa6p Is A Major Adhesin Responsible For Biofilm Formation In Candida Glabrata Mol Microbiol. In press

Mots-clés: Biofilm, Escherichia coli, candida glabrata



  publications

puce Toutes les publications 2004 sur notre base de données


  personnel

  Secrétariat Chercheurs Stagiaires Autre personnel
  Sylviane Guesdon cayre@pasteur.fr Ghigo Jean-Marc, Chef de laboratoire IP, jmghigo@pasteur.fr

Beloin Christophe, Post-doc. cbeloin@pasteur.fr

Da Re Sandra, Post-doc. sdare@pasteur.fr

Valle Jaione, Post-doc. jvalle@pasteur.fr

Roux Agnès, Boursière MRT, 3 eme année de thèse, agroux@pasteur.fr

Latour-Lambert Patricia, Tech. Sup . Lab. IP lambertp@pasteur.fr

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