Portail IP   bandeau_genéral
imprimer
Imprimer
     Collection des Champignons


  Responsable : Bernard PAPIEROK (papierok@pasteur.fr)


  resume

 

Directement partie prenante dans le projet de création du "Centre de Ressources Biologiques de l'Institut Pasteur", la Collection des Champignons entretient en culture plus de 2300 souches de champignons (filamenteux ou levures) ou d'Actinomycètes, isolées pour la plupart de lésions humaines. Aux activités de collection proprement dites s'ajoutent des investigations sur la systématique et la phylogénie d'Entomo-phthorales des genres Basidiobolus et Conidiobolus, qui ont la particularité de comporter des espèces à potentialité pathogène pour l'homme et pour des invertébrés.



  rapport

cale

La Collection des Champignons est un service spécialisé en charge d'une collection de plus de 2300 souches de champignons (filamenteux et levures) et d'Actinomycètes, isolées pour la majorité d'entre elles de lésions humaines. Remarquablement varié à cet égard, cet ensemble comporte en outre des souches isolées de l'environnement (milieu aérien, sol, matières végétales en décomposition) ou d'invertébrés (insectes). Les missions du service sont fondamentalement celles d'une collection de microorganismes ; s'y greffe une activité de recherche liée à l'existence de souches originales.

L'activité première du laboratoire est de conserver des souches fongiques en culture pure et contrôlée, et de les fournir aux laboratoires de recherche académique ou industrielle, aux laboratoires d'analyses et aux établissements d'enseignement qui en font la demande. Plus de 600 souches ont ainsi été distribuées en 2004. La Collection des Champignons a fourni également l'essentiel des isolats utilisés dans les travaux pratiques du Cours de Mycologie Médicale 2004 de l'Institut Pasteur. Elle réalise en outre des expertises en matière d'identification. Pour toutes les activités de collection proprement dites, une démarche qualité et un plan d'organisation associé ont été mis en œuvre, la Collection des Champignons étant directement partie prenante dans le projet de création du "Centre de Ressources Biologiques de l'Institut Pasteur" (CRBIP).

De plus, le laboratoire mène des investigations sur la caractérisation, la systématique et l'écologie des champignons filamenteux. En relation avec les connaissances acquises et avec le matériel récolté, ces travaux portent sur des Zygomycètes de l'ordre des Entomophthorales, principalement des espèces des genres Basidiobolus et Conidiobolus.

Enfin, grâce à des collaborations établies notamment dans le cadre d'actions européennes, la Collection des Champignons a poursuivi l'étude de la systématique et de l'écologie d'Entomophthorales responsables de mycoses chez des insectes dans le centre et l'est de l'Europe.

Caractérisation moléculaire de souches de Basidiobolus spp. (Marie JUILLARD-CONDAT, Marie-Ange ROUFFAUD, Martine KIREDJIAN, Bernard PAPIEROK)

Le laboratoire a continué à s'impliquer dans la caractérisation moléculaire de souches de mêmes espèces ou d'espèces plus ou moins proches du genre Basidiobolus. Ce genre a en effet ceci de particulier, avec le genre Conidiobolus, de comporter des espèces essentiellement saprophytes mais qui sont plus ou moins irrégulièrement isolées soit de lésions chez l'homme ou d'autres mammifères, soit de cadavres d'insectes ou d'autres arthropodes. De plus, certaines espèces de Conidiobolus sont uniquement connues comme pathogènes d'insectes. Jusqu'à présent, les investigations avaient fait intervenir le séquençage de la région ITS1-5,8S-ITS2 de l'ADNr. En 2004, les travaux ont porté sur le séquençage de la petite sous-unité de l'ADN mitochondrial chez des souches de Basidiobolus spp.

Un produit d'amplification PCR d'environ 600 pb a d'abord été obtenu. Un pourcentage d'homologie de l'ordre de 97 % a été noté entre les séquences de cette région pour la grande majorité des souches analysées, et cela quel que soit leur substrat d'origine (matières végétales en décomposition, fèces de reptiles, cadavres d'insectes ou lésions humaines). L'étude des régions flanquantes de la région amplifiée a débuté au moyen de la technique de la TAIL-PCR. Après détermination d'amorces dégénérées ou spécifiques adéquates, des amplifications ont été obtenues. Les séquences apparaissent extrêmement homogènes entre les souches.

Systématique et écologie des Entomophthorales pathogènes d'insectes dans le centre et l'est de l'Europe (Bernard PAPIEROK)

L'année précédente, la collaboration établie avec Rudolf WEGENSTEINER (Institut für Forstentomologie, Forstpathologie und Forstschutz, Universität für Bodenkultur Wien, Autriche) avait conduit à la mise en évidence, chez des Homoptères autres que les Aphididae (Psyllidae, Delphacidae, Cercopidae), de mycoses dues à des Entomophthorales relativement peu connues des genres Erynia et Zoophthora. Les souches en cause ont été étudiées cette année, simultanément avec des souches d'une espèce de Zoophthora récoltées en juin 2004 sur une espèce de Coléoptère dans l'est de la Pologne (collaboration établie avec Cezary TKACZUK, Katedra Ochrony Roslin, Akademia Podlaska, Siedlce, Pologne, dans le cadre d'une action COST).

Mots-clés: Mycologie, Collection de souches, Entomophthorales, Basidiobolus, caractérisation, ADN mitochondrial



  publications

puce Toutes les publications 2004 sur notre base de données


  personnel

  Secrétariat Chercheurs Stagiaires Autre personnel
    KIREDJIAN, Martine, Chef de laboratoire à l’Institut Pasteur, mkiredji@pasteur.fr

PAPIEROK, Bernard, Chef de laboratoire à l’Institut Pasteur, papierok@pasteur.fr
JUILLARD-CONDAT, Marie, Étudiante en Master Professionnel

COUPILLAUD, Aude, Étudiante en Maîtrise des Sciences et Techniques

COUTANSON, Monique, Technicienne supérieure de laboratoire

PIETFROID, Alain, Technicien supérieur de laboratoire

ROUFFAUD, Marie-Ange, Assistant-Ingénieur CNRS


Rapports d'activité 2004 - Institut Pasteur
filet

Debut de Page recherche Portail Institut Pasteur

En cas de problèmes, de remarques, ou de questions concernant cette page Web écrire à rescom@pasteur.fr