Unité: Analyse et microséquençage des protéines

Responsable: d'Alayer Jacques

La plate-forme d'Analyse et de Microséquençage des Protéines a poursuivi ses deux activités : le microséquençage chimique des protéines et l'analyse des protéines par la technologie des ProteinChipsTM (Ciphergen); technologie qui combine la capture des protéines sur différentes surfaces chimiques et l'analyse par spectrométrie de masse de type MALDI-TOF.

Ces activités ont été réalisées tant au bénéfice de l'Institut Pasteur qu'au bénéfice des laboratoires extérieurs.

En juillet 2003, le laboratoire a déménagé dans le bâtiment Génopole.

Le microséquençage des protéines est resté sa principale activité. La détermination des séquences est faite, soit à partir de protéines et peptides purifiés ou partiellement purifiés, soit à partir de fragments internes. Fragments internes obtenus par coupure enzymatique des protéines et purifiés par chromatographie de type HPLC avant analyse. Les séquences sont déterminées par séquençage automatique selon la méthode chimique décrite par Edman (deux séquenceurs Applied Biosystems sont disponibles : un ABI 473A et un ABI 494). Une activité de conseil et de mise au point de microtechniques nécessaires à la préparation des échantillons peut être proposée.

Au cours de l'année, 53 laboratoires ont fait appel à ses services dont 31 extérieurs (plus de 410 échantillons ont été analysés).

L'analyse des protéines par capture sur différentes surfaces chimiques et l'analyse par spectrométrie de masse (SELDI-TOF de Ciphergen ; site web : www.ciphergen.com) est une activité dont la demande croit. La diversité des analyses possibles, la sensibilité de la méthode et la rapidité, en font une technologie de choix. Par exemple : l'analyse d'interactions moléculaires spécifiques (récepteur / ligand, protéine / protéine, ADN / protéine …), l'analyse de l'expression différentielle de protéines (découverte et validation de bio marqueurs …), l'aide à la purification, la caractérisation et l'identification de protéines, et la recherches de sites de phosphorylation. Ces analyses se font avec des quantités de matériel très faibles, compatibles avec la spectrométrie de masse.

En 2003, 30 laboratoires ont fait appel à ce type d'analyse.

Le laboratoire participe à des formations et enseignements.

Mots-clés: Protéine, microséquençage, ProteinChip, Ciphergen, spectrométrie de masse


Activity Reports 2003 - Institut Pasteur
filet

Page Top research Institut Pasteur homepage

If you have problems with this Web page, please write to rescom@pasteur.fr