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     Genomics


  Director : Bouchier Christiane (bouchier@pasteur.fr)


  abstract

 

Genomic platform (PF1) realize large-scale projects with several teams of Pasteur Institute as part of Genopole programm on Microbiology initiated by the Ministry of Education and Research. Genomic projects have been selected by a steering committee. These projects have been realized following a automation-based protocol. Genomic Platform belongs to Structure and dynamic of genomes department.



  report

cale

Situation at 5 january 2004

Projects completed since 2000

Complete genomic sequence of Candida glabrata (13 Mb)

Bernard Dujon - Unite de Génétique Moléculaire des Levures

Comparative Genomic - Tuberculosis complex

Karin Eiglmeier - Thierry Garnier - Unité de Génétique Moléculaire Bactérienne

Genome sequencing of Mycobacterium ulcerans

Timothy Stinear - Unité de Génétique Moléculaire Bactérienne

Genome sequencing of Legionella pneumophila (souche Paris)

Carmen Buchrieser - Laboratoire de Génomique des Microorganismes Pathogènes

PCR products sequencing - ORF of Helicobacter pylori

Agnés. Labigne - Unité de Pathogénie Bactérienne des Muqueuses

Molecular evolution of snake venom enzymes

Valérie Choumet - Unite des Venins

EST sequencing of Aspergillus nidulans

Christophe d'Enfert - Unite Biologie et Pathogénicité Fongiques

EST sequencing of Entamoeba histolytica

Nancy Guillen - Unité postulante de Biologie Cellulaire du Parasitisme

EST sequencing of Plasmodium yoelli

George Snounou - Unité de Parasitologie Biomédicale

EST sequencing of Theileria annulata

Gordon Langsley - Laboratoire de Signalisation Immunoparasitaire

Multilocus Sequence Typing of Candida albicans strains

Christophe d'Enfert - Unite Biologie et Pathogénicité Fongiques

Current projects

Molecular typing of CIP Bacteria strains

Chantal Bizet - Collection

Allelic diversity of Plasmodium falciparum

Odile Puijalon - Unité d'Immunologie Moléculaire des Parasites

Complete genomic sequence of Microcystis aeruginosa (4,6 Mb)

Nicole Tandeau de Marsac - Unité des Cyanobactéries

Genome sequencing of Vibrio lentus (souche Mel 32)

Didier Mazel - Unité Postulante Plasticité du Génome bactérien

Keywords: High-throughput sequencing, Genome, Sequence analysis



  web site

puce More informations on our web site


  publications

puce Publications 2003 of the unit on Pasteur's references database


  personnel

  Office staff Researchers Scientific trainees Other personnel
  Luchier Françoise fluchier@pasteur.fr     Ma Laurence technicien sup

Magnier Arnaud technicien sup

Motreff Laurence technicien sup, détachée du CRB

Tichit Magali technicienne de laboratoire

Zidane Nora technicien sup,

Christiane Bouchier Ingénieur technologue

Activity Reports 2003 - Institut Pasteur
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