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     Cristallogenèse et Diffraction des rayons X


  Responsable : ALZARI, Pedro M. (alzari@pasteur.fr)


  resume

 

L'objectif de la plate-forme est de regrouper l'ensemble des équipements pour la cristallogenèse, l'informatique et la diffraction des rayons X utilisés par les différentes équipes travaillant en radiocristallographie des macromolécules à l'Institut Pasteur, ainsi que de développer des méthodologies à haut débit pour le clonage, la production et la cristallisation de protéines, grâce à l'automatisation et à la miniaturisation des différentes étapes du processus.



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Génomique Structurale des Mycobactéries (P.M. Alzari, S.T. Cole, J.M. Betton et al)

L'arrivée des données issues du séquençage massif des génomes a imposé une nouvelle dynamique à la biologie structurale, entraînant un changement d'échelle dans le domaine et une nécessité d'accélérer les processus d'études au niveau mondial. Cela est maintenant possible grâce aux développements technologiques remarquables réalisés pour le clonage, l'expression, la purification et la caractérisation des macromolécules biologiques, ainsi que par les progrès réalisés dans les méthodes de détermination de structures, la cristallogenèse, la cryocristallographie et le développement de nouvelles sources de radiation synchrotron, pour ne citer que ces exemples. Nous souhaitons utiliser ces technologies pour contribuer au développement d'une meilleure chimiothérapie de la tuberculose. En particulier, nous nous proposons d'utiliser la génomique structurale comme un outil innovateur pour la découverte de nouvelles cibles thérapeutiques.

Grâce au soutien du Réseau National des Génopoles, des projets européens X-TB et SPINE, et de l'Institut Pasteur, nous avons entrepris un projet de génomique structurale de mycobactéries. Le choix initial de cibles s'appuie sur l'analyse comparative des génomes de M. tuberculosis et M. leprae. Ces cibles incluent, d'une part, des protéines impliquées dans la croissance bactérienne et/ou la virulence des mycobactéries, mais elles incluent aussi un nombre important de protéines de fonction inconnue dont l'analyse génomique suggère leur possible importance comme cibles thérapeutiques. A présent, plus de 300 gènes mycobactériens ont été clonés dans des vecteurs d'expression bactériens, plusieurs protéines purifiées ont été soumises à des essais de cristallisation et les premières structures tridimensionnelles ont été déterminées au cours de la dernière année. L'état actuel du projet est décrit dans la page Web " Structural Genomics of Mycobacteria " (http://www.pasteur.fr/SGM)

Mots-clés: génomique structurale, clonage, purification de protéines recombinantes, cristallogenèse, diffraction des rayons X



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  publications

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  personnel

  Secrétariat Chercheurs Stagiaires Autre personnel
    Alzari, Pedro, IP (Chef de Laboratoire, alzari@pasteur.fr) Fiez-Vandal, Cédric, Ingénieur (cfiez@pasteur.fr)

Guillemot, Fabrice, Post-doc (fguillem@pasteur.fr)

Haouz, Ahmed, Post-doc (ahaouz@pasteur.fr)

Proux, Florence, Ingénieur technologue (fproux@pasteur.fr)
Masia, Nathalie, ITA CNRS (masia@pasteur.fr)

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