Le Plateau Technique d'Analyse et de Microséquençage des Protéines, au cours de l'année 2002, a continué son activité de service de microséquençage des protéines tant au bénéfice de l'Institut Pasteur qu'au bénéfice des laboratoires extérieurs.

Il a poursuivi l'activité d'analyse des protéines avec l'apport d'une nouvelle technologie appelée " ProteinChip Technology ® " (Ciphergen) qui combine la capture de protéines sur différentes surfaces chimiques et l'analyse par spectrométrie de masse de type MALDI-TOF.

Depuis 2001, le laboratoire a changé de nom et a été rattaché à la Direction des Equipements et Technologies Stratégiques.

En 2002, le microséquençage des protéines est resté sa principale activité. La détermination des séquences d'acides aminés est faite à partir de protéines ou de peptides purifiés ou partiellement purifiés. Il est aussi possible d'obtenir des séquences internes par coupures de protéines en fragments qui sont ensuite purifiés par chromatographie de type HPLC avant analyse. Les séquences sont déterminées par séquençage automatique selon la méthode chimique d'Edman (deux séquenceurs Applied Biosystems 473A et 494 sont disponibles).Une activé de conseil et la mise au point de microtechniques nécessaires à la préparation des échantillons font partie de cette activité.

Au cours de l'année, 77 unités ou laboratoires ont fait appel à ses services (> 5800 cycles de séquençage) dont 53 hors de l'Institut Pasteur.

L'analyse des protéines par spectrométrie de masse après capture sur différentes surfaces chimiques (ProteinChip Arrays ®) a continué à se développer. Du fait de la diversité des barrettes ProteinChip ® ( http://www.ciphergen.com/ ) de très nombreuses et diverses analyses peuvent être faites : études d'interactions moléculaires spécifiques (récepteur/ligand, protéine/protéine, ADN/protéine …), études de l'expression différentielle de protéines (découverte et validation de nouveaux bio marqueurs …), purification, caractérisation et identification de protéines. Ces analyses se font avec des quantités de matériel très faibles compatibles avec la spectrométrie de masse.

Au cours de l'année, 26 unités ou laboratoires ont fait appel à ce service dont 6 hors de l'Institut Pasteur.

Le Plateau Technique participe à des formations et enseignements sur le campus et à l'extérieur.

Mots-clés: protéines, microséquençage, ProteinChips, spectrométrie de masse