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  Ptgen


  Responsable : Christiane Bouchier (bouchier@pasteur.fr)


  resume

 

La plate-forme Génomique réalise des projets avec différentes équipes de l'Institut Pasteur dans le cadre du programme Génopole en microbiologie subventionné par le Ministère de l'Education Nationale, de la Recherche et de la Technologie. Ces projets de génomique à grande échelle ont été sélectionnés dans le cadre d'un appel à propositions. Ils sont réalisés en utilisant des procédures semi-automatisées. La plate-forme Génomique dispose de 5 séquenceurs capillaires (modèle ABI) : 4 ABI Prism 3700 (96 capillaires) et un ABI Prism 3100 (16 capillaires). La plate-forme Génomique posséde les principaux programmes d'assemblage de séquences utilisés par les différents centres académiques spécialisés en génomique ainsi que de nombreuses routines développées par le personnel du Service d'Informatique Scientifique de l'Institut Pasteur et de la plate-forme Annotation.



  rapport

cale

Liste des projets sélectionnés par le comité de pilotage dans le cadre de l'appel d'offre du 15 septembre 2000

Projets réalisés en 2001

Responsable

Nbre de clones séquencés

Nbre de séquences réalisées

Séquençage partiel du génome de Candida glabrata 2,5 X

B. Dujon

34848

67392

Complexe tuberculosis

K. Eiglmeier -T. Garnier

9792

19584

Séquençage d'EST d'Aspergillus nidulans

C. d'Enfert

4512

9024

Evolution moléculaire des enzymes de venins de Serpents

V. Choumet

2112

7488

Séquençage partiel du génome de Mycobacterium ulcerans

T. Stinear

27840

55680

Séquençage de produits PCR - ORF d' Helicobacter pylori

A. Labigne

Purification des produits PCR et réalisation des réactions de séquence

1827

 

Projets en cours de réalisation en 2001

Responsable

Nbre de clones séquencés

Nbre de séquences réalisées

Séquençage partiel du génome de Candida glabrata 3 X

B. Dujon

11712

23424

Séquençage partiel du génome de Microcystis aeruginosa

N. Tandeau de Marcac

3522

6467

Multirésistances aux antibiotiques des souches M. tuberculosis

B. Gicquel

Purification des produits PCR et réalisation des réactions de séquence

192

Diversité allélique de Plasmodium falciparum

O. Puijalon

Purification des produits PCR et réalisation des réactions de séquence

2016

Variabilité génétique des virus grippaux

S. van der Werf

Purification des produits PCR et réalisation des réactions de séquence

176

Séquençage d'EST d' Entamoeba histolytica

N. Guillen

960

1824


Procédures techniques semi-automatisées



  site web

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  publications

puce Toutes les publications sur notre base de données


  personnel

  Secrétariat Chercheurs Stagiaires Autre personnel
       

Stéphanie DUTHOY IP technicien 100 % temps

Stéphane FERRIS IP technicien 100 % temps

Laurence MA IP technicien 100 % temps

Eliana OCHOA IP technicien 100 % temps

Magali TICHIT IP technicien 100 % temps


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