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  Microseq


  Responsable : d’Alayer Jacques (jdalayer@pasteur.fr )


  resume

 

Le Plateau Technique d'Analyse et de Microséquençage des Protéines, au cours de l'année 2001, a continué son activité de service de microséquençage des protéines tant au bénéfice de l'Institut Pasteur qu'au bénéfice des laboratoires extérieurs.

Il a commencé une activité d'analyse des protéines avec l'apport d'une nouvelle technologie appelée " ProteinChip Technology ® " (Ciphergen) qui combine la capture de protéines sur des surfaces chimiques et l'analyse par spectrométrie de masse de type MALDI-TOF.



  rapport

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En 2001, le laboratoire a changé de nom et est rattaché à la Direction des Equipements et Technologies Stratégiques.

Le microséquençage est resté sa principale activité. La détermination des séquences d'acides aminés est faite à partir de protéines ou de peptides purifiés ou partiellement purifiés. Il peut aussi obtenir des séquences internes par coupures de protéines en fragments et purification par chromatographie de type HPLC avant analyse. Les séquences sont déterminées par séquençage automatique selon la méthode d'EDMAN (deux séquenceurs Applied Biosystems 473A et 494 sont disponibles).Une activé de conseil et la mise au point de microtechniques nécessaires à la préparation des échantillons font partie de cette activité.

Au cours de l'année, 86 unités ou laboratoires ont fait appel à ses services (> 7000 cycles de séquençage) dont 57 hors de l'Institut Pasteur.

L'analyse des protéines par spectrométrie de masse après capture sur différentes surfaces chimiques (ProteinChip Arrays ®) a commencé au milieu de l'année pour les laboratoires de l'Institut (une cinquantaine de journées). Du fait de la diversité des barrettes ProteinChip ® (http://www.ciphergen.com/) de très nombreuses et diverses analyses peuvent être réalisées : études d'interactions moléculaires spécifiques (récepteur/ligand, protéine/protéine, ADN/protéine …), études de l'expression différentielle de protéines ( découvrir et valider de nouveaux bio marqueurs …), purification, caractérisation et identification de protéines. Ces analyses se font avec des quantités de matériel très faibles compatibles avec la spectrométrie de masse.

Le Plateau Technique participe à des formations et séminaires sur le campus et à l'extérieur.



  publications

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  personnel

  Secrétariat Chercheurs Stagiaires Autre personnel
       

d’Alayer Jacques, ingénieur de recherche (jdalayer@pasteur.fr)

Chrisment Peggy, ingénieur technologue, (pchrisme@pasteur.fr)


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