Institut Pasteur Rapport d'activité de l'unité Virologie Moléculaire

CNRS URA 1966

Responsable : GIRARD Marc (mgirard@pasteur.fr)

Résumé du rapport

L'unité de Virologie Moléculaire s'intéresse depuis de nombreuses 

       années au problèmes de la réplication des Picornavirus. Ces petits
       virus à RNA sont responsables de nombreuses maladies chez
       l'homme (notamment la poliomyélite, le rhume et l'hépatite A
       provoquée par le HAV) et chez l'animal (notamment des
       encéphalomyélites chez la souris et la fièvre aphteuse chez le bétail.
       Un autre virus est étudié dans l'unité: celui du SIDA, le VIH.

Texte du rapport

Responsable : Annette Martin: Deux caractéristiques de ces virus 

       retiennent plus particulièrement l'attention. C'est tout d'abord le fait
       que leur information génétique est traduite sous forme d'une seule
       longe protéine précurseur dite polyprotéine virale, qui donne
       naissance par clivages endopeptidiques aux 4 protéines des particules
       virales et aux enzymes nécessaires à la multiplication du virus. On
       trouve parmi ces dernières la réplicase, une hélicase et divers facteurs
       impliqués dans la réplication de l'ARN viral ainsi que deux protéases
       qui assurent le découpage de la polyprotéine. Nous avons étudié la
       spécificité de ces dernières, la nature de leur site actif, leur signaux
       de reconnaissance et les étapes intermédiaires de la cascade
       protéolytique qu'elles génèrent. On commence à bien connaitre le
       processus pour les virus de la poliomymélite et de la fièvre aphteuse,
       mais il reste encore des points particuliers à résoudre pour le HAV.
       Responsable: Katherine Kean: Une seconde caractéristique des
       picornavirus est l'existence dans la partie amont (5') de leur ARN
       d'une structure secondaire spéciale, qui permet aux ribosomes de la
       cellule hôte de se positionner directement à l'endroit du codon AUG
       initiateur de la polyprotéine, sans avoir à rechercher cet AUG en
       cheminant le long de la séquence du messager qui précède. On a
       baptisé ce site d'entrée interne du ribosome "IRES". L'existence des
       IRES permet à la traduction des protéines des picornavirus
       d'échapper à l'inhibition de la traduction des protéines qu'entraine
       l'infection virale. Le virus détourne ainsi à son profit la synthèse des
       protéines de la cellule hôte. Nous avons analysé les divers éléments
       de structure des IRES, comparé leur efficacité respective, montré
       qu'elles pouvaient varier d'un virus à l'autre et surtout d'un type
       cellulaire à l'autre et nous sommes en train d'analyser les facteurs de
       la machinerie cellulaire qui permettent aux ribosomes de reconnaitre
       les IRES et de s'y fixer. Nous avons montré par ailleurs que les
       IRES jouent aussi un rôle dans la réplication des génomes viraux, ce
       qui nous a conduit à proposer un modèle pour expliquer comment la
       même molécule d'ARN viral peut être d'abord traduite dans le sens
       5' -> 3' puis répliquée dans le sens opposé (3'-> 5')
       Responsable: Marc Girard: Un autre virus étudié dans l'unité est
       celui du SIDA, le VIH. Un énorme pas en avant a été fait avec la
       découverte des co-récepteurs: le virus utilise (outre le CD4) le
       récepteur CXCR4 s'il s'agit d'une souche adaptée aux lymphocytes
       T; ou le récepteur CCR5 (et CCR3) s'il s'agit d'une souche sauvage
       macrophages-monocytes-tropique. Nous avons montré que
       l'expression dans des cellules CD4+ CCR5+ de la gp160 d'une
       souche sauvage macrophage-tropique (BX08) entraine la formation
       de syncitia. Ce phénomène est bloqué par les chimi
       okines RANTES et MIP1b, qui empêchent la multiplication des
       souches sauvages de VIH. Il reflète donc fidèlement la première
       étape de la pénétration du virus dans la cellule hôte. Nous cherchons
       à identifier les anticorps éventuellement capables de la bloquer, car ce
       devraient être des anticorps potentiellement protecteurs. Nous
       tentons d'autre part d'exprimer à l'état natif, oligomérique, la
       glycoprotéine gp160 de BX08, afin d'en étudier par la suite
       l'immunogénicité chez l'animal. Cette gp160 est capable de former
       des complexes ternaires avec les récepteurs CD4 et CCR5. Nous
       nous attachons à identifier la région de la molécule impliquée dans
       cette interaction. En parallèle, plusieurs études sont en cours pour
       comparer des vaccins vivants recombinants et des vaccins génétiques
       à base de plasmides nus
       Responsable: Catherine Vidal: Nous avons enfin abordé l'étude
       de l'atteinte neurologique provoquée par le VIH chez les patients
       VIH-positifs, en tentant de reproduire chez le rat les lésions
       fonctionnelles observées chez l'homme dans le cas de neuro-SIDA.
       Nous nous proposons de greffer pour cela, dans le cerveau de
       l'animal, des cellules de microglie exprimant la gp160 ou les
       protéines Nef ou Tat du VIH. Si cette approche apporte les résultats
       espérés, on envisagera de l'élargir au domaine des protéines des
       prions et des maladies dégénératives humaines.

Personnel de l'unité

Secrétariat de l'unité

Claude Avrameas IP

Chercheurs de l'unité

Altmeyer Ralf, IP
Borman Andy, IP
Girard Marc, IP
Kean Katherine, CNRS
Martin Annette, IP
Vidal Catherine, IP

Stagiaires de l'unité

Cohen Lisette, MC
Granon Sylvie, Post-Doc
Habel André, Thèse
Mordelet Elodie, Thèse

Autre personnel de l'unité

Benichou Danièle, Ingénieur CNRS
Staropoli Isabelle, Ingénieur IP

Publications de l'unité

VIROLOGIE MOLECULAIRE

URA CNRS 1966

LISTE DES PUBLICATIONS DEPUIS 1990

1991

UNITE DE VIROLOGIE MOLECULAIRE, URA CNRS 1966

LISTE DES PUBLICATIONS DEPUIS 1992

-

1993

1995

1996

-H. KOPECKA, S. LEGUYADER, E. DUBOIS, D. MENARD, L. MIOSSEC, M. POMMEUY. 1996. Les virus entériques transmissibles par le milieu aquatique. Epidémiologie et Santé Publique 44: 948.

-M. GIRARD. 1996. 1966-1996. Trente années de Virologie, Médecine Science, 12: 112-119.

-M. GIRARD, L.YUE, F. BARRE-SINOUSSI, E. VAN DER RYST, B. MEIGNIER, E. MUCHMORE, P. FULTZ. 1996. Failure of a human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) subtype B-derived vaccine to prevent infection of chimpanzees by an HIV-1 subtype E strain. J. Virol. 70: 8229-8233.

-L. COHEN, K.M. KEAN, M. GIRARD, S. VAN DER WERF. 1996. Effects of P2 cleavage site mutations on poliovirus polyprotein processing. Virology, 224: 34-42.

-M. GIRARD. 1996. Research strategies for a vaccine against AIDS. in: "Vaccinia, vaccination and vaccinology, Jenner, Pasteur and their successors". S. Plotkin, B. Fantini (eds) Elsevier, Amsterdam, 315-320.

F.GAO, D.L. ROBERTSON, S.G. MORRISON, H. HUI, S. CRAIG, J. DECKER, P.N. FULTZ, M. GIRARD, G.M. SHAW, B.H. HAHN, P.M. SHARP. 1996. The heterosexual human immunodeficiency virus type 1 epidemic in Thailand is caused by in intersubtype (A/E) recombinant of African origin. J. Virol. 70:7013-7029.

1997

1998

1999

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