Institut Pasteur Rapport d'activité de l'unité Rétrovirologie moléculaire pour l'année 1999

INSTITUT PASTEUR


Responsable : WAIN-HOBSON Simon (simon@pasteur.fr)

Résumé du rapport

THEME DE RECHERCHE :
Dirigé par Simon Wain-Hobson

Les intérêts premiers de mon laboratoire furent la pathologie de l'infection par le VIH et l'étude des mécanismes autour de la variation génétique du virus. Ce dernier thème arrive à son terme bien qu'il y ait encore beaucoup de choses à dire dessus.

Quand on travaille sur le VIH, on est sans cesse obligé d'analyser un nombre limité d'échantillons précieux. Dans le but de développer les possibilités de la recherche, nous avons travaillé avec le modèle SIV (du macaque), qui permet une approche expérimentale. A travers des analyses détaillées de coupes faites au sein des centres spléniques germinatifs, on a pu voir que beaucoup de cellules infectées le sont par plusieurs virus. Les implications sont considérables car ceci favorise la formation de virus recombinants à des fréquences très élevées, ce qui contribue plus tard à cette énorme variation génétique du virus du VIH. Des analyses plus poussées ont montré que la grande majorité des virus à la surface des cellules dendritiques folliculaires sont produits sur place et non via la filtration de complexes immuns circulants. Les lymphocytes-T cytotoxiques fonctionnels spécifiques du VIH ont été identifiés à l'intérieur des centres germinatifs et de la rate. Toutes ces données ont contribué à dépeindre la dynamique de la réplication virale face à une formidable réponse immune anti-VIH.

Un provirus complet VIH-1 0 a été séquencé ainsi qu'un autre provirus qui a été hypermuté entièrement. L'hypermutation G->A de l'élément rétroviral gipsy de la Drosophille a été produit in vivo en nourrissant sa larve avec de la thymidine. Ceci confirme que, in vivo, il est tout à fait possible qu'un équilibre entre dNTPs soit crucial pour réaliser une synthèse exacte de l'ADN.

Abstract

Researching aim : pathogenesis of the HIV infection and experimental approach through the SIV model.

The primary interests of the lab have been the patholohy of HIV infection and the mechanisms surrounding the genetic variation of the virus. The latter theme is drawing to a close although there is much to finish off.

When working on HIV one is forever obliged to analyse a limited number of precious samples. In order to expand research possibilities we have been working with SIV / macaque model, which allows an experimental approach. Through detailed analyses of sections through splenic germinal centers it was shown that many infected cells are multiply infected. The implications are considerable for this allows the formation of recombinant viruses at very high frequencies which contributes further to the enormous genetic variation. Further analyses showed that the majority of viruses on the surfaces of the follicular dendritic cells were produced locally and not via filtration of circulating immune complexes. Functional HIV-specific cytotoxic T lymphocytes were identified within splenic white pulps and germinal centers. These data contribute to the dynamic picture of viral replication in the face of a powerful anti-HIV immune response.

A complete HIV-1 0 provirus was sequenced as well as another that was hypermutated throughout. G-> A hyeprmutation of the Drosophila retroviral element gipsy was produced in vivo by feeding larva with thymidine. This confirms in vivo the possibility that the balance of dNTPs is crucial to accurate DNA synthesis.

Texte du rapport

THEME DE RECHERCHE : Pathogénèse de l'infection par le VIH et approche expérimentale à travers le modèle SIV. Dirigé par Simon Wain-Hobson

Les intérêts premiers de mon laboratoire furent la pathologie de l'infection par le VIH et l'étude des mécanismes autour de la variation génétique du virus. Ce dernier thème arrive à son terme bien qu'il y ait encore beaucoup de choses à dire dessus.

Quand on travaille sur le VIH, on est sans cesse obligé d'analyser un nombre limité d'échantillons précieux. Dans le but de développer les possibilités de la recherche, nous avons travaillé avec le modèle SIV (du macaque), qui permet une approche expérimentale. A travers des analyses détaillées de coupes faites au sein des centres spléniques germinatifs, on a pu voir que beaucoup de cellules infectées le sont par plusieurs virus. Les implications sont considérables car ceci favorise la formation de virus recombinants à des fréquences très élevées, ce qui contribue plus tard à cette énorme variation génétique du virus du VIH. Des analyses plus poussées ont montré que la grande majorité des virus à la surface des cellules dendritiques folliculaires sont produits sur place et non via la filtration de complexes immuns circulants. Les lymphocytes-T cytotoxiques fonctionnels spécifiques du VIH ont été identifiés à l'intérieur des centres germinatifs et de la rate. Toutes ces données ont contribué à dépeindre la dynamique de la réplication virale face à une formidable réponse immune anti-VIH.

Un provirus complet VIH-1 0 a été séquencé ainsi qu'un autre provirus qui a été hypermuté entièrement. L'hypermutation G->A de l'élément rétroviral gipsy de la Drosophille a été produit in vivo en nourrissant sa larve avec de la thymidine. Ceci confirme que, in vivo, il est tout à fait possible qu'un équilibre entre dNTPs soit crucial pour réaliser une synthèse exacte de l'ADN.

Personnel de l'unité

Secrétariat de l'unité

Mme CHAHINE Michèle

Chercheurs de l'unité

Rémi Cheynier, Chargé de Recherche I.P. Nicole Chenciner, Chargée de Recherche I.P. Monica Sala, Assistante de Recherche I.P. Jean-Pierre Vartanian, Chargé de Recherche, I.P.

Stagiaires de l'unité

Philippe Blancou, Etudiant en thèse, ENS Lyon Marie-Jeanne Dumaurier, Etudiante en thèse, Paris 5 Céline Renoux, Etudiante en thèse, Paris 7 Peter Sommer, Post-Doc, boursee CEE (Marie-Curie)

Autre personnel de l'unité

Michel Henry, Technicien supérieur de laboratoire, I.P. Michèle Chahine, Secrétaire sténo-dactylo qualifiée, I.P. (1/2 temps)

Publications de l'unité

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