Rapport d'activité de l'unité Génétique Moléculaire Bactérienne

Responsable : COLE Stewart (stcole@pasteur.fr)

Résumé du rapport

Le thème de recherche de l'unité est axé sur l'étude du pouvoir pathogène de deux genres de bactéries à Gram positif, les Mycobactéries et les Clostridies, au moyen des techniques de génomique, de génétique moléculaire, de génomique fonctionnelle, et de bio-informatique.

Abstract

The principal research goal of the unit is the dissection of the pathogenic mechanisms employed by two very different Gram positive bacteria - the Mycobacteria (M. leprae, M. tuberculosis) and the Clostridia (C. difficile, C. perfringens) - through integrated approaches involving genomics, functional genomics, molecular genetics, biochemistry and bioinformatics.

Texte du rapport

Étude des génomes, de la résistance aux antibiotiques et du pouvoir pathogène des bacilles de la lèpre et de la tuberculose

(Stewart Cole, Karin Eiglmeier, Thierry Garnier)

Les génomes mycobactériens. Afin de mieux comprendre la biologie et le pouvoir pathogène des mycobactéries responsables de la lèpre et de la tuberculose, l'analyse systématique de leur génome a été entreprise. La séquence du génome de M. tuberculosis étant achevé, nous entamons actuellement un programme de génomique fonctionnelle et comparative. A l'aide de biopuces, la présence au sein du complexe du bacille tuberculeux d'un certain nombre de régions chromosomiques variables, dont quelques-unes ont vraisemblament contribué à l'atténuation de la souche vaccinale, M. bovis BCG Pasteur, a été mise en évidence. Leur rapport avec la virulence et les différences phénotypiques fait actuellement l'objet d'une analyse.

Résistance aux agents anti-mycobactériens. L'isoniazide est un puissant agent antituberculeux, dont la toxicité résulte de sa transformation en radicaux acyles lors d'une réaction enzymatique catalysée par la catalase-peroxydase. Grâce à l'étude structure-fonction, d'importants progrès, dont les retombées pour la conception de nouveaux agents antiinfectieux sont évidentes, ont été réalisés dans la compréhension de ce mécanisme.

Etude des génomes, de la résistance aux antibiotiques et du pouvoir pathogène des Clostridies

(Gilles Reysset, Bruno Dupuy)

Clostridium perfringens et Clostridium difficile sont des bactéries anaérobies pathogènes, aussi importantes en médecine humaine qu'en médecine vétérinaire.

Les recherches que nous avons menées sur C. perfringens, agent responsable de maladies pouvant aller de la simple intoxication alimentaire à l'entérite nécrotique ou à la gangrène gazeuse, se sont principalement portées sur l'organisation fonctionnelle de certains facteurs de virulence (comme la toxine alpha) et sur l'uréase présente chez certaines souches. Actuellement, nous poursuivons nos efforts en étudiant l'adaptation aux stress oxydatifs de cette bactérie ubiquitaire, dont la survie à l'air et aux radicaux superoxydes et hydroxydes, constitue vraisemblablement un facteur de pathogénicité important. Le pouvoir pathogène de C. difficile, responsable de colites pseudomembraneuses et de la majorité des diarrhées post-antibiothérapiques, repose essentiellement sur sa capacité à produire deux toxines majeures, ToxA et ToxB. Nous avons entrepris l'étude de la régulation transcriptionnelle des gènes toxA et toxB, et nous cherchons à définir en particulier le rôle exact que semble jouer la protéine régulatrice TxeR dans leur expression. En collaboration avec une équipe de l'hôpital Saint-Antoine, nous avons entrepris l'étude de la résistance au métronidazole d'un certain nombre d'isolats cliniques de C. difficile apparus récemment.

Pour obtenir des informations complémentaires, consultez l’URL : http://www.pasteur.fr/units/Lgmb/

Personnel de l'unité

Secrétariat de l'unité

FARGUES Anne-Marie, IP

Chercheurs de l'unité

COLE Stewart                                    Professeur
REYSSET Gilles                          Chef de Laboratoire
GARNIER Thierry                         Chargé de recherche
EIGLMEIER Karin                         Chargé de recherche
DUPUY Bruno                             Chargé de recherche

Stagiaires de l'unité

BROSCH Roland, Post-doc
DOMENECH-RUBIO Pilar, Post-doc
GORDON Stephen, Post-doc
PYM Alexander, Post-doc
BANU Sayera, Thèse

Autre personnel de l'unité

HONORE Nadine, IP
SAINT-JOANIS Brigitte, IP
BRIOLAT Valérie, IP
DOS-SANTOS Sandrine
LACROIX Céline

Publications de l'unité

98234055
99134966
99120037
99120062
99120041
99003183
98248218
98295987
98406084
98125736
98288654

Cole, S.T.Comparative mycobacterial genomics. Curr Opin Microbiol, 1 (1998) 567-581

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